Diversidad genética de aislamientos de Phytophthora infestans en plantaciones de papa en Costa Rica con el uso de RAPDs
In order to determine the genetic diversity of Phytophthora infestans in Costa Rica, a total of 62 isolates were collected in potato-growing regions of Cartago, Zarcero, Heredia and Fraijanes during 1999-2001 and subjected to a RAPD analysis. All isolates were previously assayed for mating type and...
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Veröffentlicht in: | Agronomía costarricense 2005, Vol.29 (1), p.41-55 |
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Zusammenfassung: | In order to determine the
genetic diversity of Phytophthora infestans in
Costa Rica, a total of 62 isolates were collected
in potato-growing regions of Cartago, Zarcero,
Heredia and Fraijanes during 1999-2001 and
subjected to a RAPD analysis. All isolates were
previously assayed for mating type and metalaxyl
resistance. By using 11 primers, it was
possible to generate 17 RAPD genotypes, with
frequencies ranging from 0.55 to 0.02. Resistant
and susceptible isolates coming from all sampled
zones were found in the most frequent group.
All isolates from the 17 groups showed a genetic
relationship. The highest genetic variation was
found among isolates; therefore, the population
structure was not fractioned as a result of the
production zone or the sensitivity to metalaxyl.
Analyses with the Gst coefficient showed no
genetic similarities between Costa Rican and
the foreign (US-1, US-18, and EC-1) isolates. In
conclusion, RAPD analysis revealed the genetic
diversity of the P. infestans population in Costa
Rican potato fields, although there is a possibility
that all isolates are sharing a common ancestor
Para determinar la diversidad genética de
Phytophthora infestans en Costa Rica, 62 aislamientos
de este patógeno fueron recolectados en
plantaciones de papa en las zonas de Cartago,
Zarcero, Fraijanes y Heredia durante 1999-2001
y analizados con el uso de RAPDs. Todos
los aislamientos fueron previamente evaluados
para el tipo de apareamiento y la resistencia al
metalaxyl. Se seleccionó 11 imprimadores con
los cuales fue posible formar 17 grupos RAPD
cuyas frecuencias variaron de 0,55 a 0,02. En el
grupo más frecuente se encontró aislamientos
resistentes y sensibles provenientes de todas las
zonas muestreadas. Todos los aislamientos en los
17 grupos mostraron una alta relación genética.
La mayor diversidad genética se encontró entre
aislamientos y no se observó ninguna sub-estructuración
poblacional de acuerdo a las zonas o
sensibilidad al metalaxyl. Al comparar los aislamientos
costarricenses con los aislamientos forá-
neos US-1, US-18 y EC-1, no se observó ninguna
relación genética entre ambas poblaciones; de
hecho, el coeficiente de diferenciación genética
Gst mostró que la población local es diferente a la
de los aislamientos foráneos. El análisis con los
RAPDs reveló que la población de P. infestans,
en las plantaciones de papa en Costa Rica, es
diversa aunque probablemente los aislamientos
comparten un ancestro en común. |
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ISSN: | 0377-9424 2215-2202 |