Molecular cloning of αRYR hotspot region 1 from broiler chicken

Samples of Pectoralis major m. were collected, and an RT-PCR analysis of the a-Ryanodine receptor (a RYR) from chicken mRNA hotspot region spanning aminoacid residues 386 to 540, numbered according to the turkey sequence, revealed two classes of transcripts. The sequences of the first class were sim...

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Veröffentlicht in:Brazilian archives of biology and technology 2009-11, Vol.52 (spe), p.225-231
Hauptverfasser: Ziober, Iris Lamberti(Universidade Estadual de Londrina Centro de Ciências Agrárias Departamento de Ciência e Tecnologia de Alimentos), Paião, Fernanda Gonzales(Universidade Estadual de Londrina Centro de Ciências Agrárias Departamento de Ciência e Tecnologia de Alimentos), Marin, Silvana Regina Rockenbach(Embrapa Centro Nacional de Pesquisa de Soja), Marchi, Denis Fabricio(Universidade Estadual de Londrina Centro de Ciências Agrárias Departamento de Ciência e Tecnologia de Alimentos), Binneck, Eliseu(Embrapa Centro Nacional de Pesquisa de Soja), Nepomuceno, Alexandre Lima(Embrapa Centro Nacional de Pesquisa de Soja), Coutinho, Luiz Lehmann(Universidade de São Paulo Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz Laboratório de Biotecnologia Animal), Shimokomaki, Massami(Universidade Estadual de Londrina Centro de Ciências Agrárias Departamento de Ciência e Tecnologia de Alimentos)
Format: Artikel
Sprache:eng
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Beschreibung
Zusammenfassung:Samples of Pectoralis major m. were collected, and an RT-PCR analysis of the a-Ryanodine receptor (a RYR) from chicken mRNA hotspot region spanning aminoacid residues 386 to 540, numbered according to the turkey sequence, revealed two classes of transcripts. The sequences of the first class were similar to turkey and human with 97% and 74% of identity, respectively, and included all transcripts with substitutions in the nucleotide sequence. The second class was characterized by the deletion of nucleotides, leading to a premature stop codon and coding for a truncated and nonfunctional protein. These results are to date the first report related to the sequencing of the chicken αRYR hotspot region 1, which will possibility serve as a guide for further studies regarding a solution in the poultry production chain related to the problem of pale, soft and exudative (PSE) meat. Amostras do músculo Pectoralis major foram coletadas e uma RT-PCR foi conduzida para avaliar a sequência do mRNA do αRYR, região compreendida entre os resíduos de aminoácido 386-540, numerado de acordo com a sequência de perus. Os resultados revelaram duas classes de transcritos. O primeiro teve 97% e 74% de identidade com as sequências de αRyR e RyR1 de perus e humanos, respectivamente, e incluiu todos os transcritos com substituições de nucleotídeos. A segunda classe de transcritos foi caracterizada pela deleção de bases que levaram a um stop códon prematuro e a uma proteína truncada não-funcional. Esses resultados são até o momento, o primeiro relato de sequenciamento do αRYR, região hotspot1 de frangos e podem servir como guia para estudos futuros na tentativa de se encontrar uma solução para os problemas na cadeia de produção de frangos relacionados com as carnes PSE (pálida, flácida e exsudativa).
ISSN:1516-8913
1516-8913
1678-4324
DOI:10.1590/S1516-89132009000700029