Diversidad genética y estructura poblacional del cerdo negro lampiño de Yucatán usando chip SNP50

RESUMEN: La estructura poblacional y diversidad genética de 104 cerdos negros lampiños de Yucatán (NLY) y ocho de raza Duroc fueron caracterizados usando un chip SNP50K. Se obtuvo la estructura poblacional, se calculó un análisis de componentes principales (ACP), menor alelo frecuencia (MAF), Hetero...

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Veröffentlicht in:Abanico veterinario 2020-12, Vol.10 (1)
Hauptverfasser: Sansor Nah, Raúl, Lemus Flores, Clemente, Burgos Paz, William, Toledo Alvarado, Hugo O, Dzib Cauich, Dany, Morales, Rogelio Alonso
Format: Artikel
Sprache:por ; spa
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Zusammenfassung:RESUMEN: La estructura poblacional y diversidad genética de 104 cerdos negros lampiños de Yucatán (NLY) y ocho de raza Duroc fueron caracterizados usando un chip SNP50K. Se obtuvo la estructura poblacional, se calculó un análisis de componentes principales (ACP), menor alelo frecuencia (MAF), Heterocigosidad observada (Ho), Consanguinidad (F), Índice de Fijación de individuos en subpoblaciones (Fis), índice de alogamia (t) y análisis de asociación para identificar SNP diferentes entre poblaciones. Según el análisis Admixture la población NLY se estructura en tres subpoblaciones. El componente genético de Duroc en subpoblaciones NLY es bajo de 0.0036 a 0.0353, apreciándose una subpoblación con mayor diversidad genética, con valores más bajos de F, Fis y mayor Ho y t. Se identificaron SNP (p
ISSN:2448-6132
2007-428X
DOI:10.21929/abavet2020.10