Aplicació bioinformàtica per al descobriment de nous fàrmacs

El projecte ha estat desenvolupat dintre d’un grup del departament de Life Science del Barcelona Supercomputing Center - Centre Nacional de Supercomputació (BSC - CNS). El meu projecte de final de carrera consisteix en la implementació d’una eina informàtica anomenada SEABED (Small molEcule Activity scanner web-service Based on Ensemble Docking). Aquesta eina web serà utilitzada per la predicció ràpida i de baix cost econòmic d’interaccions entre proteïnes i petites molècules. L’interès de fer prediccions de baix cost és escanejar i reduir llibreries amb milions de compostos a subgrups de milers enriquits amb molècules amb dues propietats: propensió a tenir activitat contra la diana seleccionada i que siguin molècules més representatives de tot el conjunt. Reduint el volum de les llibreries de molècules (de milions a milers) farem factible el cribratge experimental per identificar aquelles que mostren activitat farmacològica. Amb la nova eina web, els usuaris no experts en bioinformàtica (biòlegs, químics, etc.) tindran un accés fàcil a la tecnologia d’enriquiment de compostos químics per als seus projectes. Per adaptar-se millor a cada necessitat, la web permet dos tipus d’accés: l’accés anònim o l’accés amb compte d’usuari.