A Bayesian network approach to poultry science: discovering connections between genetic features and stress in chickens

Comprendre sistemes biològics pot ser una tasca difícil i desafiadora. L'estrès pot ser considerat com un d'aquests sistemes biològics: és un fenomen complex la percepció i la integració del qual comença al cervell, gatillant la resposta d'estrès amb moltes implicacions en la productivitat, l'estat de salut, i el benestar d'aus de corral. En el camp de la genètica i epigenètica, centenars de milers de marcadors genètics/epigenètics poden ser quantificats per individu entre aus no estressades i estressades. La genètica de l'estrès pot ser explorada en profunditat mitjançant l'aplicació d'algorismes de xarxes Bayesianes (BN) per tal d'identificar variables genètiques claus associades amb l'estrès i descobrir interaccions ocultes entre elles. Les BN són gràfics acíclics dirigits que representen les distribucions de probabilitats conjuntes d'un conjunt definit de variables; consisteixen en un conjunt de nodes, que representen les variables, i un conjunt de fletxes, que representen les relacions entre nodes. En aquest context, els objectius d‟aquesta tesi van ser recol·lectar dades provinents d‟altres estudis i identificar un conjunt reduït de variables genètiques associades al‟estrès en pollastres (Gallus gallus), descobrint relacions i interaccions informatives mitjançant l‟aplicació d‟algorismes de BNs. Dos conjunts de dades genètiques i un d'epigenètic que van avaluar els efectes de l'estrès en pollastres van ser explorats. La biologia darrere de les dades va demostrar que els gens i les variables epigenètiques estan relacionades a l'activitat de Proteïnes d'Estrès Tèrmic, vies apoptòtiques i de dany de l'AND en conjunt amb mecanismes de reparació de teixits, i la funcionalitat d'unions adherents. Aquestes variables genètiques podrien resultar crucials sota condicions d'estrès, especialment aquelles amb un rol de protecció del funcionament correcte d'altres proteïnes o estructures. Considerar aquests gens com a marcadors clau de l'estrès requeriria estudis futurs a curt i llarg termini, per tal de millorar la salut i el benestar d'ocells de corral en qüestió de maneig i programes de cria. Comprender sistemas biológicos puede ser una tarea difícil y desafiante. El estrés puede ser considerado como uno de estos sistemas biológicos: es un fenómeno complejo cuya percepción e integración comienza en el cerebro, gatillando la respuesta de estrés con muchas implicancias en la productividad, el estado de salud, y el bienestar de aves de corral. En el campo de la ge