Diversidade genética de Cucurbita pepo, C. argyrosperma e C. ficifolia empregando marcadores microssatélites

No Sul do Brasil são cultivadas variedades locais das cinco espécies domesticadas de Cucurbita. Dentre elas, as menos estudadas são C. argyrosperma e C. ficifolia. Análises de microssatélites são importantes para a caracterização molecular dessas duas espécies, mas existe a necessidade de primers es...

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Veröffentlicht in:Horticultura brasileira 2013-09, Vol.31 (3), p.361-368
Hauptverfasser: Priori, Daniela, Barbieri, Rosa Lía, Castro, Caroline M, Oliveira, Antonio C de, Vilela, Juliana CB, Mistura, Claudete C
Format: Artikel
Sprache:eng
Online-Zugang:Volltext
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Beschreibung
Zusammenfassung:No Sul do Brasil são cultivadas variedades locais das cinco espécies domesticadas de Cucurbita. Dentre elas, as menos estudadas são C. argyrosperma e C. ficifolia. Análises de microssatélites são importantes para a caracterização molecular dessas duas espécies, mas existe a necessidade de primers específicos, ainda não disponíveis. O objetivo desse trabalho foi avaliar a transferibilidade de primers e otimizar a amplificação de locos SSR de C. pepo em C. argyrosperma e C. ficifolia, bem como averiguar a diversidade genética entre diferentes acessos de germoplasma destas espécies. Foram utilizados dez acessos de C. pepo, nove de C. argyrosperma e cinco de C. ficifolia do Banco Ativo de Germoplasma de Cucurbitáceas da Embrapa Clima Temperado. O DNA foi extraído em bulk das folhas de cinco indivíduos de cada acesso. Foram usados 40 primers SSR desenvolvidos para C. pepo. Em C. pepo, 35 primers (87,5%) amplificaram, em C. argyrosperma, 34 primers (85%) e em C. ficifolia, 32 primers (80%). Portanto a taxa de transferibilidade de locos SSR de C. pepo para C. argyrosperma e C. ficifolia foi alta, indicando que podem ser empregados na caracterização molecular destas espécies. Landraces of five domesticated species of Cucurbita are cultivated in southern Brazil. Among them C. argyrosperma and C. ficifolia are the least studied. Microsatellite markers are important for the molecular characterization of these two species, but there is a need for specific primers, not yet available. The aim of this study was to evaluate the transferability of primers and optimize the amplification of SSR loci in C. pepo, C. argyrosperma and C. ficifolia and also evaluate genetic diversity in different accessions of germplasm in these species. We used ten accessions of C. pepo, nine of C. argyrosperma and five of C. ficifolia from the Genebank of Cucurbitaceae from Embrapa Temperate Agriculture. DNA was extracted in bulk from the leaves of five individuals of each accession. 40 SSR primers developed for C. pepo were used. In C. pepo 35 primers (87.5%) amplified, in C. argyrosperma, 34 primers (85%), and in C. ficifolia, 32 primers (80%). The transferability of SSR loci in C. pepo to C. argyrosperma and C. ficifolia was 85 and 80% respectively. The transferability of SSR loci from C. pepo to C. argyrosperma and C. ficifolia was 85 and 80% respectively. Thus, the transferability rate of SSR loci developed for C. pepo to C. argyrosperma and C. ficifolia was high, indicating that they can
ISSN:0102-0536
0102-0536
DOI:10.1590/S0102-05362013000300004