Résistance aux antituberculeux de première ligne et principales familles génotypiques de Mycobacterium tuberculosis en région Antilles-Guyane : profils, évolution et tendances de 1995 à 2011

Résumé Il s’agit du premier état des lieux concernant la circulation d’isolats de Mycobacterium tuberculosis résistants et multirésistants aux antituberculeux dans les départements français d’Amérique (DFA — Guadeloupe, Martinique Guyane française) sur une période de 17 ans (janvier 1995-décembre 2011). Un total de 1 239 cas de tuberculose a été étudié: 1 199 nouveaux cas (résistances et multirésistances primaires de 11,8 et 1,6 %) et 40 persistants (définis comme des cas avec antécédent de culture positive à plus de six mois d’intervalle et dont les spoligotypes restent identiques) pour lesquels des proportions significativement plus importantes de résistance à au moins l’isoniazide (22,5 %; p = 0,002), à la rifampicine (20,0 %; p < 0,001) et de multirésistances (17,5 %; p < 0,001) ont été observées par comparaison aux nouveaux cas. Les 281 profils de spoligotypage obtenus montrent la présence de cinq lignées principales, T (29,9 %), LAM (23,9 %), Haarlem (22,1 %), EAI (7,1 %) et X (6,7 %). Deux de ces lignées, lignée X et LAM, prédominent parmi les isolats résistants et multirésistants respectivement (X: 10,5 % des isolats résistants, p = 0,04; LAM: 42,3 % des isolats multirésistants, p = 0,02). Quatre des 19 profils de spoligotypage majoritaires, correspondant aux SIT 20, 64, 45 et 46, étaient significativement associés à la résistance aux antituberculeux. Parmi eux, le génotype SIT 20, associé à une monorésistance à l’isoniazide et à une multirésistance aux antituberculeux, serait en circulation active et persistante depuis 1999, en Guyane française, département dans lequel il a par ailleurs été observé la présence de souches de M. tuberculosis phylogéographiquement associées au Guyana et au Suriname (SIT 131 et SIT 1340).