陆地棉叶片叶绿素含量与SSR标记的关联分析及优异等位变异的挖掘

【目的】筛选与陆地棉叶片叶绿素含量性状相关联的分子标记,挖掘其优异等位变异及典型材料,为陆地棉分子标记辅助育种提供技术支持。【方法】在3年6个环境中,对185份陆地棉品种（系）组成的自然群体进行倒4叶叶绿素相对含量（soil and plant analyzer development,SPAD）的测定,每年分3个时期（打顶后0、10和20 d）。采用Power Marker 3.25软件计算各位点的多态性信息含量,以分析群体的遗传多样性。利用STRUCTURE 2.3.4软件计算群体结构矩阵（Q）,利用TASSEL 3.0软件计算亲属关系矩阵（K）,通过GLM（general linear model,Q）和MLM（mixed linear model,Q＋K）2种方法,同时对SPAD与SSR标记进行关联分析。依据计算的等位位点表型效应值,挖掘优异的等位变异及典型材料。【结果】137对SSR多态性引物共扩增出355个等位变异,平均每对引物扩增到2.6个多态性位点,PIC平均值为0.67,变化范围为0.01—0.95,高度多态性引物（PIC〉0.5）占85%,其中PIC最高的标记为HAU2146（PIC=0.95）和NAU2083（PIC=0.93）。当（35）K取得最大值时,K=2,因此,将185份陆地棉材料划分为2个亚群。通过GLM方法共检测到22个显著性位点（P〈0.001）,表型变异解释率为5.28%—10.85%,平均为7.24%,贡献率最高的等位变异位点是SWU0529a（R^2=10.85%）和NAU998c（R^2=10.48%）;通过MLM方法共检测到17个显著性位点（P〈0.01）,表型变异解释率为3.72%—8.58%,平均为4.72%,贡献率最高的等位变异位点是SWU0923b（R^2=8.06%）和SWU0662d（R^2=6.74%）;2种方法共同检测到的显著性位点有12个,等位变异NAU998c在3个时期2种方法能同时被检测到。通过等位变异的表型效应分析,找到2个增效效应最大的等位变异（HAU3318b和SWU0987b）,利用找到的等位变异对材料进行筛选,获得携带2个增效效应等位变异的材料53份,2个增效效应位点都未检测到的材料有46份,统计结果显示,在打顶后10和20 d 2个时期,53份材料的SPAD均值显著高于46份材料的SAPD均值。【结论】检测到12个与SPAD值相关的显