啮齿目核糖酸酶5基因(RNase5)的分子进化

RNase5是RNASEA基因超家族中的一个重要成员,是分子进化研究的理想模型之一。基于基因组水平,我们对啮齿目的3个进化枝10科17个物种开展RNase5的分子进化研究。利用TBlastN及BlastN方法鉴定每个基因组的RNase5,发现该基因在啮齿目的Ctenohystrica所有物种发生丢失,时间是在Ctenohystrica形成之后;邻接法和最大似然法构建的系统发育树均支持RNase5在“与小家鼠相关的进化枝”的小家鼠、褐家鼠和拉布拉多自足鼠发生三次独立基因复制事件;利用PAML软件的枝模型、位点模型及枝一位点模型计算选择压力,均检测到RNase5受到强烈的正选择作用。总之,我们的研...

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Veröffentlicht in:兽类学报 2017, Vol.37 (3), p.300-307
1. Verfasser: 郎大田 张新军 吴银梅
Format: Artikel
Sprache:chi
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Beschreibung
Zusammenfassung:RNase5是RNASEA基因超家族中的一个重要成员,是分子进化研究的理想模型之一。基于基因组水平,我们对啮齿目的3个进化枝10科17个物种开展RNase5的分子进化研究。利用TBlastN及BlastN方法鉴定每个基因组的RNase5,发现该基因在啮齿目的Ctenohystrica所有物种发生丢失,时间是在Ctenohystrica形成之后;邻接法和最大似然法构建的系统发育树均支持RNase5在“与小家鼠相关的进化枝”的小家鼠、褐家鼠和拉布拉多自足鼠发生三次独立基因复制事件;利用PAML软件的枝模型、位点模型及枝一位点模型计算选择压力,均检测到RNase5受到强烈的正选择作用。总之,我们的研究深入系统开展了RNase5在啮齿目中的分子进化,增加了该基因研究的多样性,为进一步系统认识该基因在动物的适应性进化遗传机制奠定了基础。
ISSN:1000-1050