油菜花叶病毒山西地黄分离物的全基因组序列测定与分析

采用双链RNA（double-stranded RNA,dsRNA）技术和非序列依赖PCR扩增（sequence-independent amplification,SIA）方法对感病地黄进行分子鉴定,并测定油菜花叶病毒（Youcai mosaic virus,YoMV）山西地黄分离物（YoMV-SX）的基因组全序列。序列测定及分析发现侵染地黄的病毒为油菜花叶病毒（Youcai mosaic virus,YoMV）。获得YoMV-SX（Gen Bank登录号JX422022）全长为6 304 nt,5＇UTR长度为68 nt,3＇UTR长度为236 nt,含有4个开放阅读框（open reading frame,ORF）。全序列核苷酸一致性分析显示Yo M V-SX与Tobamovirus亚组Ⅲ中分离物的一致性为90.7%-96.0%,与同属亚组Ⅰ和Ⅱ的一致性仅为50.2%-63.3%。全序列系统进化分析表明,YoMV-SX与YoMV-Wh形成一个独立分支,亲缘关系最近。这是YoMV侵染地黄的首次报道。