水稻黑条矮缩病毒江苏玉米分离物全基因组序列及进化分析

利用RT-PCR从江苏玉米上克隆水稻黑条矮缩病毒（RBSDV）的全基因组，其基因组10个片段核苷酸数目和蛋白编码情况与已报道的RBSDV分离物基本一致。基因组的序列一致性分析和系统进化树表明，RBSDV基因组片段间存在频繁的RNA重排现象；江苏玉米分离物（Js）与湖北玉米分离物（HuB）和河北小麦分离物（HeB）的整体亲缘关系较近，而与安徽分离物（AH-MX8）的整体亲缘关系最远。综合本研究及前人对s8和S10的研究，RBSDV基因组不同片段的进化中RNA重组的作用不同：s1、s2和s4中没有RNA重组；s3、s5、s6、s8和S10中存在低频率重组；s7和s9存在较高频率重组．其中s7的高频率重组尤为显著。