中国荷斯坦牛FADS2基因3′端SNP突变对乳中脂肪酸组成的影响

【目的】FADS2是多不饱和脂肪酸合成中关键的限速酶之一,可催化食物中亚油酸（LNA,C18：2n6）合成γ-亚麻酸（GLA,C18：3n6）、二十碳五烯酸（EPA,C20：5n3）、二十二碳六烯酸（DHA,C22：6n3）等长链脂肪酸。试验旨在探讨中国荷斯坦牛FADS2基因3′端非编码区SNP突变对乳中脂肪酸含量的影响。【方法】随机选择20头无亲缘关系的中国荷斯坦牛样本,用直接测序列法检测FADS2基因3′端非编码区SNP突变位点。再以江苏某大型奶牛场551头中国荷斯坦牛为材料,用飞行时间质谱法对前期发现的2个SNP位点进行检测,同时利用最小二乘模型分析了SNP突变及其单倍型对乳中脂肪酸含量及其不饱和指数的影响。【结果】中国荷斯坦牛FADS2基因3′端非编码区存在3个SNP突变位点：c.1571 A〉G、c.2743 A〉G、c.2776 A〉G。c.1571 A〉G位点GG型为优势基因型,基因型频率为0.800,G为优势等位基因,基因频率为0.887。c.2776 A〉G位点AA为优势基因型,基因型频率为0.673,A为优势等位基因,基因频率为0.819。χ^2检验表明：c.2776 A〉G位点基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡（P〉0.05）,而c.1571 A〉G位点基因型分布均偏离Hardy-Weinberg平衡（P〈0.05）。FADS2基因c.1571 A〉G位点与c.2776 A〉G位点间连锁不平衡系数r2为0.028,未达到显著水平（P〉0.05）。c.1571A〉G位点与c.2776 A〉G位点有3种单倍型,GA、GG和AA频率分别为0.705、0.181和0.114。多因素方差分析表明：FADS2-1571对C14：1含量、C14和C18不饱和指数的影响达到极显著水平（P〈0.01）,对C18：0、SFA和MUFA含量的影响达到显著水平（P〈0.05）。GG型个体乳中C14：1含量、C14和C18不饱和指数显著高于AG型（P〈0.05）。FADS2-2776位点对C16：1含量、C16和C20不饱和指数的影响达到极显著水平（P〈0.01）,对C14：1含量的影响达到显著水平（P〈0.05）,GG型个体乳中C16：1含量、C16和C20不饱和指数显著高于AG型和AA型（P〈0.05）。同时,FDAS2-1571-2776单倍型对C16：1含量和C20不饱和指数的影响达到显著水平（