巢式PCR快速检测西瓜细菌性果斑病菌

【目的】建立nested—PCR方法,快速检测西瓜种子中的燕麦嗜酸菌西瓜亚种(Acidovorax8 Vellaesubsp.citrulli,Aac),为西瓜细菌性果斑病(bacterialfruitblotchofwatermelon,WFB)的防控提供技术支持。【方法】根据AacBOX短重复序列的PCR产物设计两对引物BX-L1/BX-R5和BX-L1/Bx—S-R2,建立以Bx—L1/Bx—R5为外侧引物,Bx—L1/Bx—s—R2为内侧引物的nested-PeR,以5uL样品处理液于99℃高温裂解10min,再放置冰上冷却5min,以所释放病原洲A为模板进行PCR扩增,采用50μL反...

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Veröffentlicht in:中国农业科学 2014, Vol.47 (2), p.284-291
1. Verfasser: 王婧 毕阳 朱艳 韩舜愈 祝霞 盛文军 李敏
Format: Artikel
Sprache:chi
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Beschreibung
Zusammenfassung:【目的】建立nested—PCR方法,快速检测西瓜种子中的燕麦嗜酸菌西瓜亚种(Acidovorax8 Vellaesubsp.citrulli,Aac),为西瓜细菌性果斑病(bacterialfruitblotchofwatermelon,WFB)的防控提供技术支持。【方法】根据AacBOX短重复序列的PCR产物设计两对引物BX-L1/BX-R5和BX-L1/Bx—S-R2,建立以Bx—L1/Bx—R5为外侧引物,Bx—L1/Bx—s—R2为内侧引物的nested-PeR,以5uL样品处理液于99℃高温裂解10min,再放置冰上冷却5min,以所释放病原洲A为模板进行PCR扩增,采用50μL反应体系:5μL10×PCRbuffer(25mm01.L。MgCl2),4-1LdNTP(D4030RA,2.5mmol·L-1),5J物(5μmol·L-1)各3μL,0.4uLTaqDNA酶(DR001B,5U·μL-1),通过退火温度优化,反应条件为:引物BX-L1/BX-R5各3“L进行第一轮扩增,95℃,2min;95℃,30s;65℃,45s;72℃,1rain;35个循环;72℃,延伸7rain;取扩增后的产物1gL为模板,以引物BX-L1/sx—s—R2各3gL进行第二轮扩增,95℃,2rain;95℃,30s,66℃,45s,72℃,1min,30个循环,72℃,7min。在此条件下对梯度Aac菌悬液、模拟带菌种子提取液进行特异性、灵敏性及重复性检验,对不同带菌率的西瓜种子提取液进行检测。【结果】引物Bx—L1/BX-R5和BX-L1/BX-S-R2在检测不同来源的Aac菌株时都产生了预期大小的片段,并且对其近源种燕麦嗜酸菌卡特菜兰亚种(A.avenaesubsp.cattleyae)、魔芋假单胞菌(A.aVellaesubspkonjaF,)及其不相关菌株未扩增出目标片段。以Bx—L1/BX-R5为外侧引物,BX-L1/BX-S-R2为内侧引物的nested-PCR,对Aac纯菌液和模拟带菌种子提取液的最低检测限4.7×10 1cfu/mL,比direct-PCR灵敏度高出1000倍。当西瓜种子带菌率在0.1%一0.5%时,nested-PCR阳性检测率为66.7%;当种子带菌率为1%--10%时,nested—PCR的阳性检测率为83%-100%。【结论】以Bx—L1/BX-R5为外侧BI物,BX-L1
ISSN:0578-1752