自然界斜纹夜蛾核型多角体病毒的基因型多态性

【目的】从基因组序列角度进一步揭示自然界斜纹夜蛾核型多角体病毒（Spodoptera litura nucleopolyhedrovirus, SpltNPV）的基因型多态性。【方法】病毒克隆A5， F1， X3 和 X15分别以活体克隆法分离自SpltNPV埃及株、 日本福冈株和日本小笠原株。根据SpltNPV基因组全序列（GenBank登录号： AF325155）和海灰翅夜蛾核型多角体病毒（S. littoralis NPV, SpliNPV）部分基因序列（GenBank登录号： X99377, X99376 和X98924）设计引物， PCR扩增获得A5， F1， X3 和 X15的多角体蛋白（polyhedrin, polh）基因和ORF18~ORF23序列。【结果】根据多角体蛋白基因序列， X3和X15属于SpltNPV型， 而A5和F1属于SpliNPV型。将A5， F1， X3 和 X15的ORF18~ORF23与SpltNPV和SpliNPV相应的基因序列进行同源性比较。结果发现， F1与SpliNPV以及X3与SpltNPV的核苷酸序列相似性高， 但X3的ORF20在172~558 nt处缺失387 bp。尽管依据多角体蛋白基因序列X15属于SpltNPV型， 但对于ORF18~ORF23序列， X15与SpliNPV的相似性高于与SpltNPV的相似性。同样， A5属于SpliNPV型， ORF18~ORF20与SpliNPV相应的核苷酸序列相似性高， 但ORF21与SpltNPV相应的核苷酸序列一致性为100%， 特别是ORF22， SpltNPV的特有序列出现在A5的基因组中， 而且与SpltNPV的ORF22一致性为100%； 反过来， ORF23又与SpliNPV相应的核苷酸序列相似性高。【结论】所有这些都表明， SpltNPV在自然界不仅存在基因型多态性， 而且即使属于同一基因型， 它们的基因组序列也有显著差异。可利用SpltNPV在自然界的这种异质性筛选适宜防治斜纹夜蛾幼虫的株系。