珍稀细茎石斛LEAFY同源基因的克隆及在石斛药材鉴定中的意义
本文基于兰科已有的LEAFY(LFY)同源基因保守区设计引物,对细茎石斛(DendrobiummoniliformefL.1sw.)的该基因进行克隆及序列分析。通过普通PCR及Tail.PCR技术得到LFY同源基因——DP儿Fy,全长共3575bp,包含3个外显子和2个内含子。将De比Fy基因外显子序列提交到NCBI进行BLAST比对,发现该基因与兰科其他植物同源基因序列相似度很高,均达80%以上,其中与蝴蝶兰(Phalaenopsishybridcultivar)LFY同源基因(PhalLFY)和文心兰(OncidiumGowerRamsey)LFY同源基因相似度分别达84%和90%。应用M...
Gespeichert in:
Veröffentlicht in: | 药学学报 2013, Vol.48 (4), p.597-603 |
---|---|
1. Verfasser: | |
Format: | Artikel |
Sprache: | chi |
Schlagworte: | |
Online-Zugang: | Volltext |
Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
container_end_page | 603 |
---|---|
container_issue | 4 |
container_start_page | 597 |
container_title | 药学学报 |
container_volume | 48 |
creator | 邢文瑞 侯北伟 管婧姣 罗晶 丁小余 |
description | 本文基于兰科已有的LEAFY(LFY)同源基因保守区设计引物,对细茎石斛(DendrobiummoniliformefL.1sw.)的该基因进行克隆及序列分析。通过普通PCR及Tail.PCR技术得到LFY同源基因——DP儿Fy,全长共3575bp,包含3个外显子和2个内含子。将De比Fy基因外显子序列提交到NCBI进行BLAST比对,发现该基因与兰科其他植物同源基因序列相似度很高,均达80%以上,其中与蝴蝶兰(Phalaenopsishybridcultivar)LFY同源基因(PhalLFY)和文心兰(OncidiumGowerRamsey)LFY同源基因相似度分别达84%和90%。应用MP的方法,根据不同物种LFY同源基因进行系统发生关系分析,发现细茎石斛与文心兰、蝴蝶兰亲缘关系最近。氨基酸序列比对分析结果表明,该基因C端编码的氨基酸相对更为保守。从DenLFY基因外显予和内含子单独分析来看,外显子的获得及其编码氨基酸的推测对于LFY,基因功能的研究是一个开端,而内含子2在细茎石斛和铁皮石斛fDendrobiumofficinaleKimuraetMigo)中存在长度差异,在石斛药材鉴定方面有着很大的应用潜力。 |
format | Article |
fullrecord | <record><control><sourceid>chongqing</sourceid><recordid>TN_cdi_chongqing_primary_45348707</recordid><sourceformat>XML</sourceformat><sourcesystem>PC</sourcesystem><cqvip_id>45348707</cqvip_id><sourcerecordid>45348707</sourcerecordid><originalsourceid>FETCH-chongqing_primary_453487073</originalsourceid><addsrcrecordid>eNpjYeA0MDU01jWxMDfgYOAtLs5MMjA0NzMCco05GQKe9_c-X9HwfHfbi56-5_M3P5s228fV0S3y6YSeZ7smPJ2_6-nsBc9ntTxt7X45q-1pf9fTOSsgql70rn82d8LLzi1P1816smMtUM2zlv4nOzt5GFjTEnOKU3mhNDeDoptriLOHbnJGfl56YWZeenxBUWZuYlFlvImpMchR5sbEqAEAh_lWNg</addsrcrecordid><sourcetype>Publisher</sourcetype><iscdi>true</iscdi><recordtype>article</recordtype></control><display><type>article</type><title>珍稀细茎石斛LEAFY同源基因的克隆及在石斛药材鉴定中的意义</title><source>Alma/SFX Local Collection</source><creator>邢文瑞 侯北伟 管婧姣 罗晶 丁小余</creator><creatorcontrib>邢文瑞 侯北伟 管婧姣 罗晶 丁小余</creatorcontrib><description>本文基于兰科已有的LEAFY(LFY)同源基因保守区设计引物,对细茎石斛(DendrobiummoniliformefL.1sw.)的该基因进行克隆及序列分析。通过普通PCR及Tail.PCR技术得到LFY同源基因——DP儿Fy,全长共3575bp,包含3个外显子和2个内含子。将De比Fy基因外显子序列提交到NCBI进行BLAST比对,发现该基因与兰科其他植物同源基因序列相似度很高,均达80%以上,其中与蝴蝶兰(Phalaenopsishybridcultivar)LFY同源基因(PhalLFY)和文心兰(OncidiumGowerRamsey)LFY同源基因相似度分别达84%和90%。应用MP的方法,根据不同物种LFY同源基因进行系统发生关系分析,发现细茎石斛与文心兰、蝴蝶兰亲缘关系最近。氨基酸序列比对分析结果表明,该基因C端编码的氨基酸相对更为保守。从DenLFY基因外显予和内含子单独分析来看,外显子的获得及其编码氨基酸的推测对于LFY,基因功能的研究是一个开端,而内含子2在细茎石斛和铁皮石斛fDendrobiumofficinaleKimuraetMigo)中存在长度差异,在石斛药材鉴定方面有着很大的应用潜力。</description><identifier>ISSN: 0513-4870</identifier><language>chi</language><subject>LEAFY同源基因 ; Tai1-PCR技术 ; 序列分析 ; 细茎石斛</subject><ispartof>药学学报, 2013, Vol.48 (4), p.597-603</ispartof><lds50>peer_reviewed</lds50><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Uhttp://image.cqvip.com/vip1000/qk/90148X/90148X.jpg</thumbnail><link.rule.ids>314,780,784,4024</link.rule.ids></links><search><creatorcontrib>邢文瑞 侯北伟 管婧姣 罗晶 丁小余</creatorcontrib><title>珍稀细茎石斛LEAFY同源基因的克隆及在石斛药材鉴定中的意义</title><title>药学学报</title><addtitle>Acta Pharmaceutica Sinica</addtitle><description>本文基于兰科已有的LEAFY(LFY)同源基因保守区设计引物,对细茎石斛(DendrobiummoniliformefL.1sw.)的该基因进行克隆及序列分析。通过普通PCR及Tail.PCR技术得到LFY同源基因——DP儿Fy,全长共3575bp,包含3个外显子和2个内含子。将De比Fy基因外显子序列提交到NCBI进行BLAST比对,发现该基因与兰科其他植物同源基因序列相似度很高,均达80%以上,其中与蝴蝶兰(Phalaenopsishybridcultivar)LFY同源基因(PhalLFY)和文心兰(OncidiumGowerRamsey)LFY同源基因相似度分别达84%和90%。应用MP的方法,根据不同物种LFY同源基因进行系统发生关系分析,发现细茎石斛与文心兰、蝴蝶兰亲缘关系最近。氨基酸序列比对分析结果表明,该基因C端编码的氨基酸相对更为保守。从DenLFY基因外显予和内含子单独分析来看,外显子的获得及其编码氨基酸的推测对于LFY,基因功能的研究是一个开端,而内含子2在细茎石斛和铁皮石斛fDendrobiumofficinaleKimuraetMigo)中存在长度差异,在石斛药材鉴定方面有着很大的应用潜力。</description><subject>LEAFY同源基因</subject><subject>Tai1-PCR技术</subject><subject>序列分析</subject><subject>细茎石斛</subject><issn>0513-4870</issn><fulltext>true</fulltext><rsrctype>article</rsrctype><creationdate>2013</creationdate><recordtype>article</recordtype><recordid>eNpjYeA0MDU01jWxMDfgYOAtLs5MMjA0NzMCco05GQKe9_c-X9HwfHfbi56-5_M3P5s228fV0S3y6YSeZ7smPJ2_6-nsBc9ntTxt7X45q-1pf9fTOSsgql70rn82d8LLzi1P1816smMtUM2zlv4nOzt5GFjTEnOKU3mhNDeDoptriLOHbnJGfl56YWZeenxBUWZuYlFlvImpMchR5sbEqAEAh_lWNg</recordid><startdate>2013</startdate><enddate>2013</enddate><creator>邢文瑞 侯北伟 管婧姣 罗晶 丁小余</creator><scope>2RA</scope><scope>92L</scope><scope>CQIGP</scope><scope>W91</scope><scope>~WA</scope></search><sort><creationdate>2013</creationdate><title>珍稀细茎石斛LEAFY同源基因的克隆及在石斛药材鉴定中的意义</title><author>邢文瑞 侯北伟 管婧姣 罗晶 丁小余</author></sort><facets><frbrtype>5</frbrtype><frbrgroupid>cdi_FETCH-chongqing_primary_453487073</frbrgroupid><rsrctype>articles</rsrctype><prefilter>articles</prefilter><language>chi</language><creationdate>2013</creationdate><topic>LEAFY同源基因</topic><topic>Tai1-PCR技术</topic><topic>序列分析</topic><topic>细茎石斛</topic><toplevel>peer_reviewed</toplevel><toplevel>online_resources</toplevel><creatorcontrib>邢文瑞 侯北伟 管婧姣 罗晶 丁小余</creatorcontrib><collection>中文科技期刊数据库</collection><collection>中文科技期刊数据库-CALIS站点</collection><collection>中文科技期刊数据库-7.0平台</collection><collection>中文科技期刊数据库-医药卫生</collection><collection>中文科技期刊数据库- 镜像站点</collection><jtitle>药学学报</jtitle></facets><delivery><delcategory>Remote Search Resource</delcategory><fulltext>fulltext</fulltext></delivery><addata><au>邢文瑞 侯北伟 管婧姣 罗晶 丁小余</au><format>journal</format><genre>article</genre><ristype>JOUR</ristype><atitle>珍稀细茎石斛LEAFY同源基因的克隆及在石斛药材鉴定中的意义</atitle><jtitle>药学学报</jtitle><addtitle>Acta Pharmaceutica Sinica</addtitle><date>2013</date><risdate>2013</risdate><volume>48</volume><issue>4</issue><spage>597</spage><epage>603</epage><pages>597-603</pages><issn>0513-4870</issn><abstract>本文基于兰科已有的LEAFY(LFY)同源基因保守区设计引物,对细茎石斛(DendrobiummoniliformefL.1sw.)的该基因进行克隆及序列分析。通过普通PCR及Tail.PCR技术得到LFY同源基因——DP儿Fy,全长共3575bp,包含3个外显子和2个内含子。将De比Fy基因外显子序列提交到NCBI进行BLAST比对,发现该基因与兰科其他植物同源基因序列相似度很高,均达80%以上,其中与蝴蝶兰(Phalaenopsishybridcultivar)LFY同源基因(PhalLFY)和文心兰(OncidiumGowerRamsey)LFY同源基因相似度分别达84%和90%。应用MP的方法,根据不同物种LFY同源基因进行系统发生关系分析,发现细茎石斛与文心兰、蝴蝶兰亲缘关系最近。氨基酸序列比对分析结果表明,该基因C端编码的氨基酸相对更为保守。从DenLFY基因外显予和内含子单独分析来看,外显子的获得及其编码氨基酸的推测对于LFY,基因功能的研究是一个开端,而内含子2在细茎石斛和铁皮石斛fDendrobiumofficinaleKimuraetMigo)中存在长度差异,在石斛药材鉴定方面有着很大的应用潜力。</abstract></addata></record> |
fulltext | fulltext |
identifier | ISSN: 0513-4870 |
ispartof | 药学学报, 2013, Vol.48 (4), p.597-603 |
issn | 0513-4870 |
language | chi |
recordid | cdi_chongqing_primary_45348707 |
source | Alma/SFX Local Collection |
subjects | LEAFY同源基因 Tai1-PCR技术 序列分析 细茎石斛 |
title | 珍稀细茎石斛LEAFY同源基因的克隆及在石斛药材鉴定中的意义 |
url | https://sfx.bib-bvb.de/sfx_tum?ctx_ver=Z39.88-2004&ctx_enc=info:ofi/enc:UTF-8&ctx_tim=2024-12-29T02%3A35%3A22IST&url_ver=Z39.88-2004&url_ctx_fmt=infofi/fmt:kev:mtx:ctx&rfr_id=info:sid/primo.exlibrisgroup.com:primo3-Article-chongqing&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:journal&rft.genre=article&rft.atitle=%E7%8F%8D%E7%A8%80%E7%BB%86%E8%8C%8E%E7%9F%B3%E6%96%9BLEAFY%E5%90%8C%E6%BA%90%E5%9F%BA%E5%9B%A0%E7%9A%84%E5%85%8B%E9%9A%86%E5%8F%8A%E5%9C%A8%E7%9F%B3%E6%96%9B%E8%8D%AF%E6%9D%90%E9%89%B4%E5%AE%9A%E4%B8%AD%E7%9A%84%E6%84%8F%E4%B9%89&rft.jtitle=%E8%8D%AF%E5%AD%A6%E5%AD%A6%E6%8A%A5&rft.au=%E9%82%A2%E6%96%87%E7%91%9E%20%E4%BE%AF%E5%8C%97%E4%BC%9F%20%E7%AE%A1%E5%A9%A7%E5%A7%A3%20%E7%BD%97%E6%99%B6%20%E4%B8%81%E5%B0%8F%E4%BD%99&rft.date=2013&rft.volume=48&rft.issue=4&rft.spage=597&rft.epage=603&rft.pages=597-603&rft.issn=0513-4870&rft_id=info:doi/&rft_dat=%3Cchongqing%3E45348707%3C/chongqing%3E%3Curl%3E%3C/url%3E&disable_directlink=true&sfx.directlink=off&sfx.report_link=0&rft_id=info:oai/&rft_id=info:pmid/&rft_cqvip_id=45348707&rfr_iscdi=true |