畜禽保种群体遗传多样性的模拟

【目的】基于微卫星标记特点，采用计算机模拟技术，探讨畜禽保种群遗传多样性的变化过程。【方法】选择30个均匀分布于基因组、具有4—10个等位基因的标记位点，位点间无相互作用；模拟产生的畜禽保种群公母比例为1：5、随机交配、各家系随机等量留种、群体规模保持世代恒定，世代问无重叠，群体有效大小分别为Ne=10、20、50、100和200，保种繁殖50个世代，1000次重复。采用多态性位点数（num-p）、平均等位基因数（他）、有效等位基因数（Ae）、观测基因杂合度（Ho）、期望杂合度（He）、稀有等位基因数（RA）、缺乏丰富位点数（NRP）作为遗传多样性度量指标。【结果】保种群体的遗传多样性总体趋势随保种世代而逐渐降低，不同群体规模遗传多样性的降低速度差异显著，相比基础群，胎值越大，num-p、Na、Ae、110、He和RA的下降速率越慢，且当90=100和200时，num-p基本维持50个世代不变，删则分别增加0．86％和2．49倍；而此值越大，NRP的增加速率越慢。【结论】遗传漂变导致了群体内遗传多样性的丢失。小群体中遗传漂变导致的遗传多样性丢失速度比大群体更高，发生在闭锁群体水平上的有效群体规模的减少将加快基因漂变速度，从而降低保种群体内的遗传多样性。