柑橘黄龙病病原菌非洲种和美洲种23S-5SrDNA序列的克隆及分析

【目的】克隆柑橘黄龙病病原菌非洲种和美洲种23s-5SrDNA序列并和亚洲种相应区域进行比对，阐明黄龙病3个种核糖体RNA操纵子之间的关系。【方法】根据亚洲种23S-5SrRNA基因区域序列的保守性设计引物，在非洲种和美洲种DNA样品上扩增，对PCR产物进行克隆和测序，并对新获得的序列进行序列验证和分析。【结果】非洲种获得了3057bp序列包括23SrRNA基因、细胞壁脱氢酶假基因和5SrRNA基因；美洲种获得了3033bp序列包括23SrRNA基因、glpK基因和5SrRNA基因。3个种核糖体基因顺序分别是：亚洲种16SrRNA、tRNAIle、tRNAAla、23SrRNA、细胞壁脱氢酶假基因、5SrRNA和tRNAMet；非洲种16SrRNA、tRNAIl3、tRNAAla、23SrRNA、细胞壁脱氢酶假基因和5SrRNA；美洲种16SrRNA、tRNAIle、tRNAAla、23SrRNA、占雠基因和5SrRNA。【结论】黄龙病病原菌核糖体RNA基因有特殊的排列方式，即在23SrRNA和5SrRNA基因区间均有反向编码的细胞壁脱氢酶基因，其中亚洲种和非洲种为假基因，美洲种为glpK基因。