焦核龙眼种子败育的cDNA-AFLP分析

采用cDNA-AFLP技术对龙眼(Dimocarpus longan Lour.)正常和败育的种子进行了差异表达分析,并对差异明显的片段进行回收、克隆、测序,以及利用NCBI中的BLAST数据库已知序列进行同源性比对。结果表明:在11条重复性较好的差异片段中有3个Transcript-derived fragments(TDFs)分别与Ca2+-ATP酶、纤维素酶、质体ATP/ADP转运蛋白具有较高的相似性,其中TDF2和TDF7下调表达,TDF5上调表达,这可能影响了龙眼种子发育过程中的许多重要代谢途径,从而引起龙眼种子败育;有4个TDFs与一些hypothetical蛋白的序列相似;另有4...

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Veröffentlicht in:植物科学学报 2011, Vol.29 (3), p.347-351
1. Verfasser: 唐晰 谢东丽 刘潇 蒋际谋 梁文裕 陈伟
Format: Artikel
Sprache:chi
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Beschreibung
Zusammenfassung:采用cDNA-AFLP技术对龙眼(Dimocarpus longan Lour.)正常和败育的种子进行了差异表达分析,并对差异明显的片段进行回收、克隆、测序,以及利用NCBI中的BLAST数据库已知序列进行同源性比对。结果表明:在11条重复性较好的差异片段中有3个Transcript-derived fragments(TDFs)分别与Ca2+-ATP酶、纤维素酶、质体ATP/ADP转运蛋白具有较高的相似性,其中TDF2和TDF7下调表达,TDF5上调表达,这可能影响了龙眼种子发育过程中的许多重要代谢途径,从而引起龙眼种子败育;有4个TDFs与一些hypothetical蛋白的序列相似;另有4个TDFs在蛋白数据库中未找到匹配的序列,核酸数据库中比对的结果也显示较高的E-值,说明为非同源基因。
ISSN:2095-0837