联合应用基因表达谱和拷贝数变异信息探索结直肠癌分子亚型

R735.34%Q81; 目的:整合基因表达谱和拷贝数变异谱数据来揭示Ⅱ～Ⅲ期结直肠癌的分子分型,并探索各分型与结直肠癌术后复发的关系.方法:从网络公共资源中下载结直肠癌的基因表达谱数据及对应的拷贝变异谱数据,经批间校正、四分位数标准化、缺失值估算及特征过滤等处理后获得用于后续整合分析的基因表达谱和基因组拷贝数谱数据;选用贝叶斯一致性聚类(BCC)算法整合上述两种谱学数据进行结直肠癌分子亚型分析;结合结直肠癌患者的复发和生存数据,利用生存分析评价各亚型的预后预测能力;并用基因系列富集度分析软件比较不同亚型所富集的生物学信号.所有谱数据分析基于R-3.0.1平台,统计分析采用SPSS 16.0软...

Ausführliche Beschreibung

Bibliographische Detailangaben

Veröffentlicht in:	浙江大学学报（医学版） 2014, Vol.43 (4), p.420-426
Hauptverfasser:	苗华, 曹付傲, 李旭, 缪宗原, 叶淳, 隋金珂, 王汉涛
Format:	Artikel
Sprache:	chi
Online-Zugang:	Volltext
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