肝癌细胞应对TNF-α刺激过程中与细胞黏附相关的信号转导网络研究
目的 利用生物信息学方法进一步认识肝癌细胞应对肿瘤坏死因子α（TNF-α）刺激过程中的细胞黏附相关的信号转导网络.方法 利用肝癌细胞HepG2应对TNF-α刺激的基因芯片数据、转录因子数据库HTRI以及蛋白-蛋白相互作用数据库HRPD构建了肝癌细胞应对TNF-α刺激过程中的信号转导网络,并利用网络结构和基因功能聚类的分析方法进行了研究.结果 发现在信号转导网络中MYC、SP1等基因是信号转导网络中的关键转录因子,信号转导网络中的基因与细胞黏附密切相关,EGFR很可能是肝癌细胞应对TNF-α刺激过程中调控细胞黏附的关键基因.结论 EGFR很可能在TNF-α引起的肝癌细胞迁移过程中发挥了关键作用....
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| Veröffentlicht in: | 中华医学杂志 2014, Vol.94 (42), p.3345-3348 |
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| Format: | Artikel |
| Sprache: | chi |
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| container_title | 中华医学杂志 |
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| creator | 郑永昌 杜顺达 徐海峰 徐意瑶 赵海涛 迟天毅 卢欣 桑新亭 毛一雷 |
| description | 目的 利用生物信息学方法进一步认识肝癌细胞应对肿瘤坏死因子α（TNF-α）刺激过程中的细胞黏附相关的信号转导网络.方法 利用肝癌细胞HepG2应对TNF-α刺激的基因芯片数据、转录因子数据库HTRI以及蛋白-蛋白相互作用数据库HRPD构建了肝癌细胞应对TNF-α刺激过程中的信号转导网络,并利用网络结构和基因功能聚类的分析方法进行了研究.结果 发现在信号转导网络中MYC、SP1等基因是信号转导网络中的关键转录因子,信号转导网络中的基因与细胞黏附密切相关,EGFR很可能是肝癌细胞应对TNF-α刺激过程中调控细胞黏附的关键基因.结论 EGFR很可能在TNF-α引起的肝癌细胞迁移过程中发挥了关键作用. |
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