F17大肠杆菌在湖羊羔羊个体脾脏中LncRNA表达谱变化

[目的]通过筛选对大肠杆菌(E.coli)F17菌毛非腹泻型与腹泻型的绵羊脾脏中差异表达的lncRNA,来探究lncRNA对绵羊抗腹泻的作用.[方法]本研究通过对湖羊羔羊口服E.coliF17菌株获得非腹泻和腹泻型个体,利用羔羊肠道细菌计数、病理组织切片验证攻毒成功性;构建非腹泻组和腹泻组羔羊脾脏的cDNA文库,使用Illumina HiSeq 2500平台进行配对测序;通过Gene Ontology (GO)和KEGG Pathway富集分析对差异表达转录本功能描述和细胞通路分析,利用FPKM法估计lncRNA和mRNA转录物的表达水平,并用高通量测序技术RNA-seq筛选出非腹泻和腹泻个体...

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Veröffentlicht in:中国农业科学 2019-04, Vol.52 (7), p.1282-1294
Hauptverfasser: 黄赛男, 金澄艳, 鲍建军, 王悦, 陈炜昊, 吴天弋, 王利宏, 吕晓阳, 高雯, 王步忠, 朱国强, 戴国俊, 孙伟
Format: Artikel
Sprache:chi
Online-Zugang:Volltext
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