阿尔茨海默病引起的轻度认知功能损害的微小RNA表达谱的生物信息学分析

阿尔茨海默病引起的轻度认知功能损害的微小RNA表达谱的生物信息学分析

R749.1+6; 目的·分析阿尔茨海默病(Alzheimer's disease,AD)所致轻度认知功能损害(mild cognitive impairment,MCI)患者的血浆微小RNA(microRNA,miRNA)表达谱,并探讨AD所致MCI在遗传调控水平上的发病机制.方法·纳入5例AD所致MCI患者和5例对照受试者,应用miRNA芯片测序技术分析血浆miRNA表达谱.采用TargetScan 7.2数据库分析显著上调miRNA的靶基因.采用Cytoscape软件分析显著上调miRNA的miRNA-基因相互作用网络,筛选关键miRNA.运用R语言对关键miRNA的靶基因进行...

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Veröffentlicht in:上海交通大学学报（医学版） 2020-09, Vol.40 (9), p.1174-1183
Hauptverfasser: 何海宁, 张微, 严峰, 史琰琛, 王静华, 肖世富, 王涛
Format: Artikel
Sprache:chi
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creator 何海宁
张微
严峰
史琰琛
王静华
肖世富
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description R749.1+6; 目的·分析阿尔茨海默病(Alzheimer's disease,AD)所致轻度认知功能损害(mild cognitive impairment,MCI)患者的血浆微小RNA(microRNA,miRNA)表达谱,并探讨AD所致MCI在遗传调控水平上的发病机制.方法·纳入5例AD所致MCI患者和5例对照受试者,应用miRNA芯片测序技术分析血浆miRNA表达谱.采用TargetScan 7.2数据库分析显著上调miRNA的靶基因.采用Cytoscape软件分析显著上调miRNA的miRNA-基因相互作用网络,筛选关键miRNA.运用R语言对关键miRNA的靶基因进行基因本体数据库(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析.结果·AD所致MCI患者的血浆中存在13个显著上调的miRNA,其中有5个是核心调控网络中的关键miRNA,其靶标基因主要参与突触可塑性调节、Wnt信号通路、突触间囊泡转运和突触间囊泡定位等生物学过程,并调控Ras信号通路、丝裂原活化蛋白激酶信号通路和糖酵解/糖异生等通路.结论·AD所致MCI患者血浆中5个上调的miRNA可能作为关键调控因素参与AD相关的病理进程,或可成为诊断AD所致MCI的潜在生物学标志物.
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