中国辣椒BCAT基因家族鉴定、表达分析及克隆
S641.3; [目的]了解中国辣椒(Capsicum chinense Jacq.)BCAT基因家族成员的分布、性质及表达模式.中国辣椒是辣椒的5个主要栽培种之一,果实通常具有由支链酯类形成的浓郁果香.支链氨基酸转氨酶(BCAT,Branched-chain Aminotransferase)负责催化支链氨基酸合成相应2-氧代酸,是催化合成支链酯类的第一步反应酶.[方法]使用生物信息学分析和实时荧光定量PCR等方法对中国辣椒的BCAT基因家族成员进行鉴定、表达分析和克隆.[结果]获得5个BCAT基因家族成员,分别命名为CcBCAT1、CcBCAT2、CcBCAT3、CcBCAT4和CcBCA...
Gespeichert in:
Veröffentlicht in: | 广东农业科学 2022, Vol.49 (12), p.34-43 |
---|---|
Hauptverfasser: | , , , , , , , , |
Format: | Artikel |
Sprache: | chi |
Online-Zugang: | Volltext |
Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
container_end_page | 43 |
---|---|
container_issue | 12 |
container_start_page | 34 |
container_title | 广东农业科学 |
container_volume | 49 |
creator | 谢炳春 黄俊霖 温松森 李涛 李颖 徐小万 徐晓美 吴智明 衡周 |
description | S641.3; [目的]了解中国辣椒(Capsicum chinense Jacq.)BCAT基因家族成员的分布、性质及表达模式.中国辣椒是辣椒的5个主要栽培种之一,果实通常具有由支链酯类形成的浓郁果香.支链氨基酸转氨酶(BCAT,Branched-chain Aminotransferase)负责催化支链氨基酸合成相应2-氧代酸,是催化合成支链酯类的第一步反应酶.[方法]使用生物信息学分析和实时荧光定量PCR等方法对中国辣椒的BCAT基因家族成员进行鉴定、表达分析和克隆.[结果]获得5个BCAT基因家族成员,分别命名为CcBCAT1、CcBCAT2、CcBCAT3、CcBCAT4和CcBCAT5,随后对其进行生物信息学分析并克隆CcBCAT1~CcBCAT4.生物信息学分析显示,这些基因分布于辣椒的4条染色体上,蛋白均为亲水性蛋白,氨基酸长度在184~557 aa,分子量为20.29~89.60 ku,等电点为5.57~8.34.亚细胞定位预测结果显示,CcBCAT1定位于叶绿体和线粒体,其他基因家族成员均位于叶绿体.CcBCATs基因时空表达分析显示,CcBCAT1-4基因具有组织表达特异性,CcBCAT2~CcBCAT4相对表达量随着辣椒的成熟呈现逐步上升的趋势,其中CcBCAT4最为明显、CcBCAT1则相反、CcBCAT5未检测到表达.[结论]明确中国辣椒BCAT基因家族的表达模式,推测CcBCAT4参与辣椒果实相关次生代谢物合成. |
doi_str_mv | 10.16768/j.issn.1004-874X.2022.12.004 |
format | Article |
fullrecord | <record><control><sourceid>wanfang_jour</sourceid><recordid>TN_cdi_wanfang_journals_gdnykx202212004</recordid><sourceformat>XML</sourceformat><sourcesystem>PC</sourcesystem><wanfj_id>gdnykx202212004</wanfj_id><sourcerecordid>gdnykx202212004</sourcerecordid><originalsourceid>FETCH-LOGICAL-s1024-3e9b6a4698c4de821019c5c8ff18290e6d107d1c03e290f27164bc50baf4412a3</originalsourceid><addsrcrecordid>eNpjYFA1NNAzNDM3s9DP0sssLs7TMzQwMNG1MDeJ0DMyMDLSMzTSAwqwMHDCxTkYeIuLM5MMTA2NzQ0tzcw5Gaye7Fj7dPbeF_sWP1syycnZMeTp_F1PZy94um7bs-n9Lzu3PF0363FD44uFK17s2_e0o-3ZvAlP-7uetna_nNXGw8CalphTnMoLpbkZQt1cQ5w9dH383T2dHX10iw0NjEx0jVMtk8wSTcwsLZJNUlItjAwNDC2TTZMt0tIMLYwsDVLNUgwNzFMMkw2MU4HcNCNzQzOTpGRTg6TENBMTQ6NEY24GdYi55Yl5aYl56fFZ-aVFeUAb49NT8iqzK0B-NTQCetEYAMY0Xm4</addsrcrecordid><sourcetype>Aggregation Database</sourcetype><iscdi>true</iscdi><recordtype>article</recordtype></control><display><type>article</type><title>中国辣椒BCAT基因家族鉴定、表达分析及克隆</title><source>DOAJ Directory of Open Access Journals</source><creator>谢炳春 ; 黄俊霖 ; 温松森 ; 李涛 ; 李颖 ; 徐小万 ; 徐晓美 ; 吴智明 ; 衡周</creator><creatorcontrib>谢炳春 ; 黄俊霖 ; 温松森 ; 李涛 ; 李颖 ; 徐小万 ; 徐晓美 ; 吴智明 ; 衡周</creatorcontrib><description>S641.3; [目的]了解中国辣椒(Capsicum chinense Jacq.)BCAT基因家族成员的分布、性质及表达模式.中国辣椒是辣椒的5个主要栽培种之一,果实通常具有由支链酯类形成的浓郁果香.支链氨基酸转氨酶(BCAT,Branched-chain Aminotransferase)负责催化支链氨基酸合成相应2-氧代酸,是催化合成支链酯类的第一步反应酶.[方法]使用生物信息学分析和实时荧光定量PCR等方法对中国辣椒的BCAT基因家族成员进行鉴定、表达分析和克隆.[结果]获得5个BCAT基因家族成员,分别命名为CcBCAT1、CcBCAT2、CcBCAT3、CcBCAT4和CcBCAT5,随后对其进行生物信息学分析并克隆CcBCAT1~CcBCAT4.生物信息学分析显示,这些基因分布于辣椒的4条染色体上,蛋白均为亲水性蛋白,氨基酸长度在184~557 aa,分子量为20.29~89.60 ku,等电点为5.57~8.34.亚细胞定位预测结果显示,CcBCAT1定位于叶绿体和线粒体,其他基因家族成员均位于叶绿体.CcBCATs基因时空表达分析显示,CcBCAT1-4基因具有组织表达特异性,CcBCAT2~CcBCAT4相对表达量随着辣椒的成熟呈现逐步上升的趋势,其中CcBCAT4最为明显、CcBCAT1则相反、CcBCAT5未检测到表达.[结论]明确中国辣椒BCAT基因家族的表达模式,推测CcBCAT4参与辣椒果实相关次生代谢物合成.</description><identifier>ISSN: 1004-874X</identifier><identifier>DOI: 10.16768/j.issn.1004-874X.2022.12.004</identifier><language>chi</language><publisher>仲恺农业工程学院园艺园林学院,广东 广州 510225</publisher><ispartof>广东农业科学, 2022, Vol.49 (12), p.34-43</ispartof><rights>Copyright © Wanfang Data Co. Ltd. All Rights Reserved.</rights><lds50>peer_reviewed</lds50><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Uhttp://www.wanfangdata.com.cn/images/PeriodicalImages/gdnykx/gdnykx.jpg</thumbnail><link.rule.ids>314,780,784,864,4024,27923,27924,27925</link.rule.ids></links><search><creatorcontrib>谢炳春</creatorcontrib><creatorcontrib>黄俊霖</creatorcontrib><creatorcontrib>温松森</creatorcontrib><creatorcontrib>李涛</creatorcontrib><creatorcontrib>李颖</creatorcontrib><creatorcontrib>徐小万</creatorcontrib><creatorcontrib>徐晓美</creatorcontrib><creatorcontrib>吴智明</creatorcontrib><creatorcontrib>衡周</creatorcontrib><title>中国辣椒BCAT基因家族鉴定、表达分析及克隆</title><title>广东农业科学</title><description>S641.3; [目的]了解中国辣椒(Capsicum chinense Jacq.)BCAT基因家族成员的分布、性质及表达模式.中国辣椒是辣椒的5个主要栽培种之一,果实通常具有由支链酯类形成的浓郁果香.支链氨基酸转氨酶(BCAT,Branched-chain Aminotransferase)负责催化支链氨基酸合成相应2-氧代酸,是催化合成支链酯类的第一步反应酶.[方法]使用生物信息学分析和实时荧光定量PCR等方法对中国辣椒的BCAT基因家族成员进行鉴定、表达分析和克隆.[结果]获得5个BCAT基因家族成员,分别命名为CcBCAT1、CcBCAT2、CcBCAT3、CcBCAT4和CcBCAT5,随后对其进行生物信息学分析并克隆CcBCAT1~CcBCAT4.生物信息学分析显示,这些基因分布于辣椒的4条染色体上,蛋白均为亲水性蛋白,氨基酸长度在184~557 aa,分子量为20.29~89.60 ku,等电点为5.57~8.34.亚细胞定位预测结果显示,CcBCAT1定位于叶绿体和线粒体,其他基因家族成员均位于叶绿体.CcBCATs基因时空表达分析显示,CcBCAT1-4基因具有组织表达特异性,CcBCAT2~CcBCAT4相对表达量随着辣椒的成熟呈现逐步上升的趋势,其中CcBCAT4最为明显、CcBCAT1则相反、CcBCAT5未检测到表达.[结论]明确中国辣椒BCAT基因家族的表达模式,推测CcBCAT4参与辣椒果实相关次生代谢物合成.</description><issn>1004-874X</issn><fulltext>true</fulltext><rsrctype>article</rsrctype><creationdate>2022</creationdate><recordtype>article</recordtype><recordid>eNpjYFA1NNAzNDM3s9DP0sssLs7TMzQwMNG1MDeJ0DMyMDLSMzTSAwqwMHDCxTkYeIuLM5MMTA2NzQ0tzcw5Gaye7Fj7dPbeF_sWP1syycnZMeTp_F1PZy94um7bs-n9Lzu3PF0363FD44uFK17s2_e0o-3ZvAlP-7uetna_nNXGw8CalphTnMoLpbkZQt1cQ5w9dH383T2dHX10iw0NjEx0jVMtk8wSTcwsLZJNUlItjAwNDC2TTZMt0tIMLYwsDVLNUgwNzFMMkw2MU4HcNCNzQzOTpGRTg6TENBMTQ6NEY24GdYi55Yl5aYl56fFZ-aVFeUAb49NT8iqzK0B-NTQCetEYAMY0Xm4</recordid><startdate>2022</startdate><enddate>2022</enddate><creator>谢炳春</creator><creator>黄俊霖</creator><creator>温松森</creator><creator>李涛</creator><creator>李颖</creator><creator>徐小万</creator><creator>徐晓美</creator><creator>吴智明</creator><creator>衡周</creator><general>仲恺农业工程学院园艺园林学院,广东 广州 510225</general><general>广东省农业科学院蔬菜研究所/广东省蔬菜新技术研究重点实验室,广东广州 510640%广东省农业科学院蔬菜研究所/广东省蔬菜新技术研究重点实验室,广东广州 510640%仲恺农业工程学院园艺园林学院,广东 广州 510225</general><scope>2B.</scope><scope>4A8</scope><scope>92I</scope><scope>93N</scope><scope>PSX</scope><scope>TCJ</scope></search><sort><creationdate>2022</creationdate><title>中国辣椒BCAT基因家族鉴定、表达分析及克隆</title><author>谢炳春 ; 黄俊霖 ; 温松森 ; 李涛 ; 李颖 ; 徐小万 ; 徐晓美 ; 吴智明 ; 衡周</author></sort><facets><frbrtype>5</frbrtype><frbrgroupid>cdi_FETCH-LOGICAL-s1024-3e9b6a4698c4de821019c5c8ff18290e6d107d1c03e290f27164bc50baf4412a3</frbrgroupid><rsrctype>articles</rsrctype><prefilter>articles</prefilter><language>chi</language><creationdate>2022</creationdate><toplevel>peer_reviewed</toplevel><toplevel>online_resources</toplevel><creatorcontrib>谢炳春</creatorcontrib><creatorcontrib>黄俊霖</creatorcontrib><creatorcontrib>温松森</creatorcontrib><creatorcontrib>李涛</creatorcontrib><creatorcontrib>李颖</creatorcontrib><creatorcontrib>徐小万</creatorcontrib><creatorcontrib>徐晓美</creatorcontrib><creatorcontrib>吴智明</creatorcontrib><creatorcontrib>衡周</creatorcontrib><collection>Wanfang Data Journals - Hong Kong</collection><collection>WANFANG Data Centre</collection><collection>Wanfang Data Journals</collection><collection>万方数据期刊 - 香港版</collection><collection>China Online Journals (COJ)</collection><collection>China Online Journals (COJ)</collection><jtitle>广东农业科学</jtitle></facets><delivery><delcategory>Remote Search Resource</delcategory><fulltext>fulltext</fulltext></delivery><addata><au>谢炳春</au><au>黄俊霖</au><au>温松森</au><au>李涛</au><au>李颖</au><au>徐小万</au><au>徐晓美</au><au>吴智明</au><au>衡周</au><format>journal</format><genre>article</genre><ristype>JOUR</ristype><atitle>中国辣椒BCAT基因家族鉴定、表达分析及克隆</atitle><jtitle>广东农业科学</jtitle><date>2022</date><risdate>2022</risdate><volume>49</volume><issue>12</issue><spage>34</spage><epage>43</epage><pages>34-43</pages><issn>1004-874X</issn><abstract>S641.3; [目的]了解中国辣椒(Capsicum chinense Jacq.)BCAT基因家族成员的分布、性质及表达模式.中国辣椒是辣椒的5个主要栽培种之一,果实通常具有由支链酯类形成的浓郁果香.支链氨基酸转氨酶(BCAT,Branched-chain Aminotransferase)负责催化支链氨基酸合成相应2-氧代酸,是催化合成支链酯类的第一步反应酶.[方法]使用生物信息学分析和实时荧光定量PCR等方法对中国辣椒的BCAT基因家族成员进行鉴定、表达分析和克隆.[结果]获得5个BCAT基因家族成员,分别命名为CcBCAT1、CcBCAT2、CcBCAT3、CcBCAT4和CcBCAT5,随后对其进行生物信息学分析并克隆CcBCAT1~CcBCAT4.生物信息学分析显示,这些基因分布于辣椒的4条染色体上,蛋白均为亲水性蛋白,氨基酸长度在184~557 aa,分子量为20.29~89.60 ku,等电点为5.57~8.34.亚细胞定位预测结果显示,CcBCAT1定位于叶绿体和线粒体,其他基因家族成员均位于叶绿体.CcBCATs基因时空表达分析显示,CcBCAT1-4基因具有组织表达特异性,CcBCAT2~CcBCAT4相对表达量随着辣椒的成熟呈现逐步上升的趋势,其中CcBCAT4最为明显、CcBCAT1则相反、CcBCAT5未检测到表达.[结论]明确中国辣椒BCAT基因家族的表达模式,推测CcBCAT4参与辣椒果实相关次生代谢物合成.</abstract><pub>仲恺农业工程学院园艺园林学院,广东 广州 510225</pub><doi>10.16768/j.issn.1004-874X.2022.12.004</doi><tpages>10</tpages></addata></record> |
fulltext | fulltext |
identifier | ISSN: 1004-874X |
ispartof | 广东农业科学, 2022, Vol.49 (12), p.34-43 |
issn | 1004-874X |
language | chi |
recordid | cdi_wanfang_journals_gdnykx202212004 |
source | DOAJ Directory of Open Access Journals |
title | 中国辣椒BCAT基因家族鉴定、表达分析及克隆 |
url | https://sfx.bib-bvb.de/sfx_tum?ctx_ver=Z39.88-2004&ctx_enc=info:ofi/enc:UTF-8&ctx_tim=2024-12-24T02%3A13%3A48IST&url_ver=Z39.88-2004&url_ctx_fmt=infofi/fmt:kev:mtx:ctx&rfr_id=info:sid/primo.exlibrisgroup.com:primo3-Article-wanfang_jour&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:journal&rft.genre=article&rft.atitle=%E4%B8%AD%E5%9B%BD%E8%BE%A3%E6%A4%92BCAT%E5%9F%BA%E5%9B%A0%E5%AE%B6%E6%97%8F%E9%89%B4%E5%AE%9A%E3%80%81%E8%A1%A8%E8%BE%BE%E5%88%86%E6%9E%90%E5%8F%8A%E5%85%8B%E9%9A%86&rft.jtitle=%E5%B9%BF%E4%B8%9C%E5%86%9C%E4%B8%9A%E7%A7%91%E5%AD%A6&rft.au=%E8%B0%A2%E7%82%B3%E6%98%A5&rft.date=2022&rft.volume=49&rft.issue=12&rft.spage=34&rft.epage=43&rft.pages=34-43&rft.issn=1004-874X&rft_id=info:doi/10.16768/j.issn.1004-874X.2022.12.004&rft_dat=%3Cwanfang_jour%3Egdnykx202212004%3C/wanfang_jour%3E%3Curl%3E%3C/url%3E&disable_directlink=true&sfx.directlink=off&sfx.report_link=0&rft_id=info:oai/&rft_id=info:pmid/&rft_wanfj_id=gdnykx202212004&rfr_iscdi=true |