基于转录组测序挖掘小麦叶片抗旱相关基因

S512.1; [目的]通过转录组测序分析干旱胁迫的小麦,以期挖掘小麦响应干旱胁迫的关键基因.[方法]采用高通量Illumina Hiseq 2500测序平台对郑麦366号正常生长与自然干旱处理进行测序,并对测序数据进行分析,筛选响应干旱胁迫的关键基因.[结果]两组样品中分别获得45471018、45133470个clean read片段,包含6.82 Gb、6.39 Gb碱基信息,拼接组装后,得到188334个转录本和119588个Unigenes.通过筛选共获得1207个DEGs,其中752个上调,455个下调.GO功能富集分析显示,上调的DEGs主要富集在水解酶活性、催化活性、代谢过程、...

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Veröffentlicht in:广东农业科学 2022, Vol.49 (2), p.1-8
Hauptverfasser: 曾倩倩, 刘岩, 朱墨, 邱宗波
Format: Artikel
Sprache:chi
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creator 曾倩倩
刘岩
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description S512.1; [目的]通过转录组测序分析干旱胁迫的小麦,以期挖掘小麦响应干旱胁迫的关键基因.[方法]采用高通量Illumina Hiseq 2500测序平台对郑麦366号正常生长与自然干旱处理进行测序,并对测序数据进行分析,筛选响应干旱胁迫的关键基因.[结果]两组样品中分别获得45471018、45133470个clean read片段,包含6.82 Gb、6.39 Gb碱基信息,拼接组装后,得到188334个转录本和119588个Unigenes.通过筛选共获得1207个DEGs,其中752个上调,455个下调.GO功能富集分析显示,上调的DEGs主要富集在水解酶活性、催化活性、代谢过程、甘油代谢过程、膜和细胞部分等;下调的DEGs富集在细胞器、细胞和氧化还原酶活性的最多.KEGG途径富集分析发现,DEGs显著富集于淀粉和蔗糖代谢、卟啉和叶绿素代谢、光合作用-天线蛋白、光合作用、苯丙烷生物合成、乙醛酸和二羧酸代谢、甘油磷脂代谢、氨基酸代谢和光合生物中的碳固定等代谢通路.5个抗氧化酶基因的qRT-PCR结果与RNA-Seq测序结果变化趋势相一致.[结论]利用转录组测序技术获得了大量小麦抗旱相关基因,为深入研究小麦响应干旱胁迫的分子机制提供更多的基因遗传资源.
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