Selection of a representative core collection from the Chilean common bean germplasm

Race Chile is an important component of the genetic structure of the common bean ( Phaseolus vulgaris L.). The germplasm bank of the Instituto de Investigaciones Agropecuarias INIA contains 1200 accessions distributed mainly into two Active Working Germplasm Banks at INIA La Platina (Santiago) and a...

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Veröffentlicht in:Chilean journal of agricultural research 2010-03, Vol.70 (1), p.3-15
Hauptverfasser: Paredes, Mario C, Becerra, Viviana V, Tay, Juan U, Blair, Matthew W, Bascur, Gabriel B
Format: Artikel
Sprache:eng
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container_title Chilean journal of agricultural research
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creator Paredes, Mario C
Becerra, Viviana V
Tay, Juan U
Blair, Matthew W
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description Race Chile is an important component of the genetic structure of the common bean ( Phaseolus vulgaris L.). The germplasm bank of the Instituto de Investigaciones Agropecuarias INIA contains 1200 accessions distributed mainly into two Active Working Germplasm Banks at INIA La Platina (Santiago) and at INIA Quilamapu (Chillán) and also the Germplasm Base Bank at INIA Intihuasi (La Serena). The Chilean collection possesses accessions collected throughout the country. One way to study and use the germplasm stored at the Seed Banks is the formation of a core collection. The objectives of this work were: a) To establish a common bean core collection with the germplasm collected throughout the country, and b) to evaluate its representatives based on phenotypic data and to compare with data from the whole collection. The results indicated that the Chilean base collection contained accessions belonging to the Andean and Mesoamerican gene pools and to genotypes belong to race Chile, Perú, Nueva Granada, Mesoamerica and Durango. The Chilean bean core collection consisted of 246 accessions. Comparison for several phenotypic traits data from 246 accessions from the whole and core collection indicated the genetic variation expressed for each trait in the whole collection was quite well represented in the core collection. This core collection will be very useful for further phenotypic and genetic characterization and to select accessions for the bean breeding program. La raza Chile es un componente importante de la estructura genética del germoplasma del poroto común ( Phaseolus vulgaris L.). El Instituto de Investigaciones Agropecuarias, INIA, posee alrededor de 1200 accesiones almacenadas en los Bancos activos de Germoplasma en INIA La Platina (Santiago) e INIA Quilamapu (Chillán) y Banco Base en INIA Intihuasi (La Serena). Esta colección está formada por accesiones colectadas a través de todo el país. La formación de una colección núcleo se ha planteado como una forma de hacer un uso más eficiente del germoplasma almacenado en los Bancos de Germoplasma. Los objetivos de este trabajo fueron formar una colección núcleo de germoplasma de porotos, y evaluar su representatividad. La estrategia utilizada para formar la colección núcleo fue la estratificación de las accesiones de la colección base de acuerdo al acervo genético y raza, permitiendo que la mayor diversidad genética estuviera representada en esta nueva colección. Los resultados obtenidos indicaron que la colecci
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The germplasm bank of the Instituto de Investigaciones Agropecuarias INIA contains 1200 accessions distributed mainly into two Active Working Germplasm Banks at INIA La Platina (Santiago) and at INIA Quilamapu (Chillán) and also the Germplasm Base Bank at INIA Intihuasi (La Serena). The Chilean collection possesses accessions collected throughout the country. One way to study and use the germplasm stored at the Seed Banks is the formation of a core collection. The objectives of this work were: a) To establish a common bean core collection with the germplasm collected throughout the country, and b) to evaluate its representatives based on phenotypic data and to compare with data from the whole collection. The results indicated that the Chilean base collection contained accessions belonging to the Andean and Mesoamerican gene pools and to genotypes belong to race Chile, Perú, Nueva Granada, Mesoamerica and Durango. The Chilean bean core collection consisted of 246 accessions. Comparison for several phenotypic traits data from 246 accessions from the whole and core collection indicated the genetic variation expressed for each trait in the whole collection was quite well represented in the core collection. This core collection will be very useful for further phenotypic and genetic characterization and to select accessions for the bean breeding program. La raza Chile es un componente importante de la estructura genética del germoplasma del poroto común ( Phaseolus vulgaris L.). El Instituto de Investigaciones Agropecuarias, INIA, posee alrededor de 1200 accesiones almacenadas en los Bancos activos de Germoplasma en INIA La Platina (Santiago) e INIA Quilamapu (Chillán) y Banco Base en INIA Intihuasi (La Serena). Esta colección está formada por accesiones colectadas a través de todo el país. La formación de una colección núcleo se ha planteado como una forma de hacer un uso más eficiente del germoplasma almacenado en los Bancos de Germoplasma. Los objetivos de este trabajo fueron formar una colección núcleo de germoplasma de porotos, y evaluar su representatividad. La estrategia utilizada para formar la colección núcleo fue la estratificación de las accesiones de la colección base de acuerdo al acervo genético y raza, permitiendo que la mayor diversidad genética estuviera representada en esta nueva colección. Los resultados obtenidos indicaron que la colección base estaba formada por genotipos pertenecientes a los acervos genéticos Andino y Mesoamericano y a las razas cultivadas Chile, Perú, Nueva Granada, Mesoamérica y Durango. La colección núcleo estuvo formada por 246 accesiones, donde se dio mayor representatividad a las accesiones de la raza Chile. La comparación morfológica, fenológica y agronómica permitió determinar que la diversidad genética presente en la colección base estaba representada adecuadamente en la colección núcleo. Esta colección núcleo será de gran utilidad para futuros estudios de caracterización de este germoplasma y para seleccionar progenitores para el programa de mejoramiento genético de frejol.</description><identifier>ISSN: 0718-5820</identifier><identifier>ISSN: 0718-5839</identifier><identifier>EISSN: 0718-5839</identifier><identifier>DOI: 10.4067/S0718-58392010000100001</identifier><language>eng</language><publisher>Instituto de Investigaciones Agropecuarias, INIA</publisher><subject>acervos genéticos ; AGRICULTURE, MULTIDISCIPLINARY ; AGRONOMY ; bean gene pools ; phenotypic variability ; phenotypic variability, bean gene pools, race Chile ; race Chile ; raza Chile ; variación fenotípica ; variación fenotípica, acervos genéticos, raza Chile</subject><ispartof>Chilean journal of agricultural research, 2010-03, Vol.70 (1), p.3-15</ispartof><rights>Copyright © 2010 - Universidade de Santa Cruz do Sul</rights><rights>This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License.</rights><oa>free_for_read</oa><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed><citedby>FETCH-LOGICAL-b287t-b1911e98ad3f19d25ee52b27f83d363fcaafdbed1ce80a4ce86dcb694e9af0d63</citedby></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Tsyndetics_thumb_exl</thumbnail><link.rule.ids>230,314,776,780,881,27901,27902,79168</link.rule.ids></links><search><creatorcontrib>Paredes, Mario C</creatorcontrib><creatorcontrib>Becerra, Viviana V</creatorcontrib><creatorcontrib>Tay, Juan U</creatorcontrib><creatorcontrib>Blair, Matthew W</creatorcontrib><creatorcontrib>Bascur, Gabriel B</creatorcontrib><title>Selection of a representative core collection from the Chilean common bean germplasm</title><title>Chilean journal of agricultural research</title><addtitle>Chil. j. agric. res</addtitle><description>Race Chile is an important component of the genetic structure of the common bean ( Phaseolus vulgaris L.). The germplasm bank of the Instituto de Investigaciones Agropecuarias INIA contains 1200 accessions distributed mainly into two Active Working Germplasm Banks at INIA La Platina (Santiago) and at INIA Quilamapu (Chillán) and also the Germplasm Base Bank at INIA Intihuasi (La Serena). The Chilean collection possesses accessions collected throughout the country. One way to study and use the germplasm stored at the Seed Banks is the formation of a core collection. The objectives of this work were: a) To establish a common bean core collection with the germplasm collected throughout the country, and b) to evaluate its representatives based on phenotypic data and to compare with data from the whole collection. The results indicated that the Chilean base collection contained accessions belonging to the Andean and Mesoamerican gene pools and to genotypes belong to race Chile, Perú, Nueva Granada, Mesoamerica and Durango. The Chilean bean core collection consisted of 246 accessions. Comparison for several phenotypic traits data from 246 accessions from the whole and core collection indicated the genetic variation expressed for each trait in the whole collection was quite well represented in the core collection. This core collection will be very useful for further phenotypic and genetic characterization and to select accessions for the bean breeding program. La raza Chile es un componente importante de la estructura genética del germoplasma del poroto común ( Phaseolus vulgaris L.). El Instituto de Investigaciones Agropecuarias, INIA, posee alrededor de 1200 accesiones almacenadas en los Bancos activos de Germoplasma en INIA La Platina (Santiago) e INIA Quilamapu (Chillán) y Banco Base en INIA Intihuasi (La Serena). Esta colección está formada por accesiones colectadas a través de todo el país. La formación de una colección núcleo se ha planteado como una forma de hacer un uso más eficiente del germoplasma almacenado en los Bancos de Germoplasma. Los objetivos de este trabajo fueron formar una colección núcleo de germoplasma de porotos, y evaluar su representatividad. La estrategia utilizada para formar la colección núcleo fue la estratificación de las accesiones de la colección base de acuerdo al acervo genético y raza, permitiendo que la mayor diversidad genética estuviera representada en esta nueva colección. Los resultados obtenidos indicaron que la colección base estaba formada por genotipos pertenecientes a los acervos genéticos Andino y Mesoamericano y a las razas cultivadas Chile, Perú, Nueva Granada, Mesoamérica y Durango. La colección núcleo estuvo formada por 246 accesiones, donde se dio mayor representatividad a las accesiones de la raza Chile. La comparación morfológica, fenológica y agronómica permitió determinar que la diversidad genética presente en la colección base estaba representada adecuadamente en la colección núcleo. Esta colección núcleo será de gran utilidad para futuros estudios de caracterización de este germoplasma y para seleccionar progenitores para el programa de mejoramiento genético de frejol.</description><subject>acervos genéticos</subject><subject>AGRICULTURE, MULTIDISCIPLINARY</subject><subject>AGRONOMY</subject><subject>bean gene pools</subject><subject>phenotypic variability</subject><subject>phenotypic variability, bean gene pools, race Chile</subject><subject>race Chile</subject><subject>raza Chile</subject><subject>variación fenotípica</subject><subject>variación fenotípica, acervos genéticos, raza Chile</subject><issn>0718-5820</issn><issn>0718-5839</issn><issn>0718-5839</issn><fulltext>true</fulltext><rsrctype>article</rsrctype><creationdate>2010</creationdate><recordtype>article</recordtype><sourceid>RBI</sourceid><recordid>eNp9UF1LwzAUDaLgnP4EsX-gMx9dPx6l6CYMfNh8Dkl6s2WkzUiq4L83Xd18EAzh3Ms995yEg9ADwbMM58XjGhekTOclqygmOJ4RLtDkTFyee4qv0U0Ie4zzrCBsgjZrsKB647rE6UQkHg4eAnS96M0nJMr5AexpR3vXJv0OknpnLIgucm0b53Lot-DbgxWhvUVXWtgAdz91it5fnjf1Ml29LV7rp1UqaVn0qSQVIVCVomGaVA2dA8yppIUuWcNyppUQupHQEAUlFlnEvFEyrzKohMZNzqZoNvoGZcA6vncfvosP8mMm_E8mUVCMAuVdCB40P3jTCv_FCeZDmv8o70elFo6LrTeB16thZRFpSn6_Io2zpoOzsfJG8NNQ7eMlR8NvRpaAww</recordid><startdate>20100301</startdate><enddate>20100301</enddate><creator>Paredes, Mario C</creator><creator>Becerra, Viviana V</creator><creator>Tay, Juan U</creator><creator>Blair, Matthew W</creator><creator>Bascur, Gabriel B</creator><general>Instituto de Investigaciones Agropecuarias, INIA</general><scope>RBI</scope><scope>FBQ</scope><scope>AAYXX</scope><scope>CITATION</scope><scope>GPN</scope></search><sort><creationdate>20100301</creationdate><title>Selection of a representative core collection from the Chilean common bean germplasm</title><author>Paredes, Mario C ; Becerra, Viviana V ; Tay, Juan U ; Blair, Matthew W ; Bascur, Gabriel B</author></sort><facets><frbrtype>5</frbrtype><frbrgroupid>cdi_FETCH-LOGICAL-b287t-b1911e98ad3f19d25ee52b27f83d363fcaafdbed1ce80a4ce86dcb694e9af0d63</frbrgroupid><rsrctype>articles</rsrctype><prefilter>articles</prefilter><language>eng</language><creationdate>2010</creationdate><topic>acervos genéticos</topic><topic>AGRICULTURE, MULTIDISCIPLINARY</topic><topic>AGRONOMY</topic><topic>bean gene pools</topic><topic>phenotypic variability</topic><topic>phenotypic variability, bean gene pools, race Chile</topic><topic>race Chile</topic><topic>raza Chile</topic><topic>variación fenotípica</topic><topic>variación fenotípica, acervos genéticos, raza Chile</topic><toplevel>online_resources</toplevel><creatorcontrib>Paredes, Mario C</creatorcontrib><creatorcontrib>Becerra, Viviana V</creatorcontrib><creatorcontrib>Tay, Juan U</creatorcontrib><creatorcontrib>Blair, Matthew W</creatorcontrib><creatorcontrib>Bascur, Gabriel B</creatorcontrib><collection>Bioline International</collection><collection>AGRIS</collection><collection>CrossRef</collection><collection>SciELO</collection><jtitle>Chilean journal of agricultural research</jtitle></facets><delivery><delcategory>Remote Search Resource</delcategory><fulltext>fulltext</fulltext></delivery><addata><au>Paredes, Mario C</au><au>Becerra, Viviana V</au><au>Tay, Juan U</au><au>Blair, Matthew W</au><au>Bascur, Gabriel B</au><format>journal</format><genre>article</genre><ristype>JOUR</ristype><atitle>Selection of a representative core collection from the Chilean common bean germplasm</atitle><jtitle>Chilean journal of agricultural research</jtitle><addtitle>Chil. j. agric. res</addtitle><date>2010-03-01</date><risdate>2010</risdate><volume>70</volume><issue>1</issue><spage>3</spage><epage>15</epage><pages>3-15</pages><issn>0718-5820</issn><issn>0718-5839</issn><eissn>0718-5839</eissn><abstract>Race Chile is an important component of the genetic structure of the common bean ( Phaseolus vulgaris L.). The germplasm bank of the Instituto de Investigaciones Agropecuarias INIA contains 1200 accessions distributed mainly into two Active Working Germplasm Banks at INIA La Platina (Santiago) and at INIA Quilamapu (Chillán) and also the Germplasm Base Bank at INIA Intihuasi (La Serena). The Chilean collection possesses accessions collected throughout the country. One way to study and use the germplasm stored at the Seed Banks is the formation of a core collection. The objectives of this work were: a) To establish a common bean core collection with the germplasm collected throughout the country, and b) to evaluate its representatives based on phenotypic data and to compare with data from the whole collection. The results indicated that the Chilean base collection contained accessions belonging to the Andean and Mesoamerican gene pools and to genotypes belong to race Chile, Perú, Nueva Granada, Mesoamerica and Durango. The Chilean bean core collection consisted of 246 accessions. Comparison for several phenotypic traits data from 246 accessions from the whole and core collection indicated the genetic variation expressed for each trait in the whole collection was quite well represented in the core collection. This core collection will be very useful for further phenotypic and genetic characterization and to select accessions for the bean breeding program. La raza Chile es un componente importante de la estructura genética del germoplasma del poroto común ( Phaseolus vulgaris L.). El Instituto de Investigaciones Agropecuarias, INIA, posee alrededor de 1200 accesiones almacenadas en los Bancos activos de Germoplasma en INIA La Platina (Santiago) e INIA Quilamapu (Chillán) y Banco Base en INIA Intihuasi (La Serena). Esta colección está formada por accesiones colectadas a través de todo el país. La formación de una colección núcleo se ha planteado como una forma de hacer un uso más eficiente del germoplasma almacenado en los Bancos de Germoplasma. Los objetivos de este trabajo fueron formar una colección núcleo de germoplasma de porotos, y evaluar su representatividad. La estrategia utilizada para formar la colección núcleo fue la estratificación de las accesiones de la colección base de acuerdo al acervo genético y raza, permitiendo que la mayor diversidad genética estuviera representada en esta nueva colección. Los resultados obtenidos indicaron que la colección base estaba formada por genotipos pertenecientes a los acervos genéticos Andino y Mesoamericano y a las razas cultivadas Chile, Perú, Nueva Granada, Mesoamérica y Durango. La colección núcleo estuvo formada por 246 accesiones, donde se dio mayor representatividad a las accesiones de la raza Chile. La comparación morfológica, fenológica y agronómica permitió determinar que la diversidad genética presente en la colección base estaba representada adecuadamente en la colección núcleo. 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identifier ISSN: 0718-5820
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issn 0718-5820
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source Bioline International; EZB-FREE-00999 freely available EZB journals; Alma/SFX Local Collection
subjects acervos genéticos
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AGRONOMY
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