Seleção tradicional e associada a marcadores moleculares na avaliação genética animal
O objetivo deste trabalho foi comparar a seleção, utilizando valores genéticos preditos pelo BLUP clássico (BLUP), BLUP marcadores (BLUPM) e pela seleção individual (SI), usando simulação com o programa Genesys. Para obter a matriz de similaridade genética utilizada no BLUPM, foram simulados cem mar...
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| Veröffentlicht in: | Pesquisa agropecuaria brasileira 2006, Vol.41 (4), p.615-621 |
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| Format: | Artikel |
| Sprache: | por |
| Schlagworte: | |
| Online-Zugang: | Volltext |
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| container_title | Pesquisa agropecuaria brasileira |
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| creator | Carneiro, Paulo Luiz Souza(Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia Dep. de Ciências Biológicas Laboratório de Genética Molecular) Malhado, Carlos Henrique Mendes(Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia Dep. de Ciências Biológicas Laboratório de Genética Molecular) Euclydes, Ricardo Frederico(Universidade Federal de Viçosa Dep. de Zootecnia) Torres, Robledo de Almeida(Universidade Federal de Viçosa Dep. de Zootecnia) Lopes, Paulo Sávio(Universidade Federal de Viçosa Dep. de Zootecnia) Carneiro, Antonio Policarpo Souza(Universidade Estadual do Oeste do Paraná Centro de Ciências Agrárias) Cunha, Elizângela Emídio(Universidade Federal de Viçosa Dep. de Zootecnia) |
| description | O objetivo deste trabalho foi comparar a seleção, utilizando valores genéticos preditos pelo BLUP clássico (BLUP), BLUP marcadores (BLUPM) e pela seleção individual (SI), usando simulação com o programa Genesys. Para obter a matriz de similaridade genética utilizada no BLUPM, foram simulados cem marcadores moleculares do tipo microssatélite (SSR - Simple Sequence Repeat), por meio de um coeficiente de similaridade correspondente à distância euclideana média para dados quantitativos. A fim de comparar os diferentes métodos, utilizaram-se populações com tamanho efetivo de 66,66 e média de 30 repetições, avaliando-se os valores fenotípicos médios. Os ganhos ao longo das 20 gerações de seleção foram maiores para o BLUP em relação ao BLUPM, e este foi superior à SI. Quanto ao ganho obtido nas cinco primeiras gerações, o BLUPM apresentou ganhos semelhantes ao BLUP e superiores à SI. Diferentes sistemas de acasalamento dos reprodutores selecionados não revelaram diferenças em ganho genético nos métodos baseados no BLUP.
The objective of this work was to compare selection based on breeding values predicted by classical best linear unbiased prediction (BLUP), BLUP associated with molecular markers (BLUPM) and individual selection (IS) using data simulated with the Genesys program. To obtain the genetic similarity matrix to be used in BLUPM, a hundred microsatellite markers (simple sequence repeats) were simulated using a similarity coefficient corresponding to the mean Euclidean distance between quantitative data. The different selection methods were compared using populations of an effective size of 66.66 and a mean of 30 repetitions, and mean phenotypic values were determined. Genetic gain obtained over 20 generations of selection was higher for BLUP than BLUPM, which in turn was superior to IS. Similar genetic gains were obtained for BLUPM and BLUP only when the gain for the first five generations was considered, and these gains were higher than those obtained with IS. Selected reproducers mating systems did not lead to differences in genetic gain for the BLUP-based methods. |
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The objective of this work was to compare selection based on breeding values predicted by classical best linear unbiased prediction (BLUP), BLUP associated with molecular markers (BLUPM) and individual selection (IS) using data simulated with the Genesys program. To obtain the genetic similarity matrix to be used in BLUPM, a hundred microsatellite markers (simple sequence repeats) were simulated using a similarity coefficient corresponding to the mean Euclidean distance between quantitative data. The different selection methods were compared using populations of an effective size of 66.66 and a mean of 30 repetitions, and mean phenotypic values were determined. Genetic gain obtained over 20 generations of selection was higher for BLUP than BLUPM, which in turn was superior to IS. Similar genetic gains were obtained for BLUPM and BLUP only when the gain for the first five generations was considered, and these gains were higher than those obtained with IS. Selected reproducers mating systems did not lead to differences in genetic gain for the BLUP-based methods.</description><identifier>ISSN: 0100-204X</identifier><identifier>ISSN: 1678-3921</identifier><identifier>EISSN: 1678-3921</identifier><identifier>DOI: 10.1590/S0100-204X2006000400010</identifier><language>por</language><publisher>Embrapa Informação TecnológicaPesquisa Agropecuária Brasileira</publisher><subject>AGRICULTURE, DAIRY & ANIMAL SCIENCE ; AGRICULTURE, MULTIDISCIPLINARY ; BLUP ; mating systems ; phenotype seletion ; seleção fenotípica ; simulation ; simulação ; sistemas de acasalamento</subject><ispartof>Pesquisa agropecuaria brasileira, 2006, Vol.41 (4), p.615-621</ispartof><rights>This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License.</rights><lds50>peer_reviewed</lds50><oa>free_for_read</oa><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Tsyndetics_thumb_exl</thumbnail><link.rule.ids>230,315,782,786,866,887,4026,27930,27931,27932</link.rule.ids></links><search><creatorcontrib>Carneiro, Paulo Luiz Souza(Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia Dep. de Ciências Biológicas Laboratório de Genética Molecular)</creatorcontrib><creatorcontrib>Malhado, Carlos Henrique Mendes(Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia Dep. de Ciências Biológicas Laboratório de Genética Molecular)</creatorcontrib><creatorcontrib>Euclydes, Ricardo Frederico(Universidade Federal de Viçosa Dep. de Zootecnia)</creatorcontrib><creatorcontrib>Torres, Robledo de Almeida(Universidade Federal de Viçosa Dep. de Zootecnia)</creatorcontrib><creatorcontrib>Lopes, Paulo Sávio(Universidade Federal de Viçosa Dep. de Zootecnia)</creatorcontrib><creatorcontrib>Carneiro, Antonio Policarpo Souza(Universidade Estadual do Oeste do Paraná Centro de Ciências Agrárias)</creatorcontrib><creatorcontrib>Cunha, Elizângela Emídio(Universidade Federal de Viçosa Dep. de Zootecnia)</creatorcontrib><title>Seleção tradicional e associada a marcadores moleculares na avaliação genética animal</title><title>Pesquisa agropecuaria brasileira</title><addtitle>Pesq. agropec. bras</addtitle><description>O objetivo deste trabalho foi comparar a seleção, utilizando valores genéticos preditos pelo BLUP clássico (BLUP), BLUP marcadores (BLUPM) e pela seleção individual (SI), usando simulação com o programa Genesys. Para obter a matriz de similaridade genética utilizada no BLUPM, foram simulados cem marcadores moleculares do tipo microssatélite (SSR - Simple Sequence Repeat), por meio de um coeficiente de similaridade correspondente à distância euclideana média para dados quantitativos. A fim de comparar os diferentes métodos, utilizaram-se populações com tamanho efetivo de 66,66 e média de 30 repetições, avaliando-se os valores fenotípicos médios. Os ganhos ao longo das 20 gerações de seleção foram maiores para o BLUP em relação ao BLUPM, e este foi superior à SI. Quanto ao ganho obtido nas cinco primeiras gerações, o BLUPM apresentou ganhos semelhantes ao BLUP e superiores à SI. Diferentes sistemas de acasalamento dos reprodutores selecionados não revelaram diferenças em ganho genético nos métodos baseados no BLUP.
The objective of this work was to compare selection based on breeding values predicted by classical best linear unbiased prediction (BLUP), BLUP associated with molecular markers (BLUPM) and individual selection (IS) using data simulated with the Genesys program. To obtain the genetic similarity matrix to be used in BLUPM, a hundred microsatellite markers (simple sequence repeats) were simulated using a similarity coefficient corresponding to the mean Euclidean distance between quantitative data. The different selection methods were compared using populations of an effective size of 66.66 and a mean of 30 repetitions, and mean phenotypic values were determined. Genetic gain obtained over 20 generations of selection was higher for BLUP than BLUPM, which in turn was superior to IS. Similar genetic gains were obtained for BLUPM and BLUP only when the gain for the first five generations was considered, and these gains were higher than those obtained with IS. Selected reproducers mating systems did not lead to differences in genetic gain for the BLUP-based methods.</description><subject>AGRICULTURE, DAIRY & ANIMAL SCIENCE</subject><subject>AGRICULTURE, MULTIDISCIPLINARY</subject><subject>BLUP</subject><subject>mating systems</subject><subject>phenotype seletion</subject><subject>seleção fenotípica</subject><subject>simulation</subject><subject>simulação</subject><subject>sistemas de acasalamento</subject><issn>0100-204X</issn><issn>1678-3921</issn><issn>1678-3921</issn><fulltext>true</fulltext><rsrctype>article</rsrctype><creationdate>2006</creationdate><recordtype>article</recordtype><recordid>eNplUMFKxDAQDaJgXf0EsT_QdZK0TXuURV1hwUMVFi9lmqRLlrSBZtcf8iB-R3_M1IoXD8MM894b5j1CbigsaVbCbQUUIGGQbhlADgBpKAonJKK5KBJeMnpKoj_SObnwfg_ABM9FRN4qbfX4OX64-DCgMtK4Hm2sY_TeSYMKY4w7HCQqN2gfd85qebQ4zX3A3tEanPU73Y9fByPDtjcd2kty1qL1-uq3L8jrw_3Lap1snh-fVnebpKVFeIqDBM1SRUG1PJ-eb0SjGt7KNEPQmShVGYxkmOuMq0LwQnOZlkKwIi84ZXxBlvNdL422rt674xA8-PonmfpfMkFwPQtadDXuBuPrbTVRAp4G_BvzPGLl</recordid><startdate>2006</startdate><enddate>2006</enddate><creator>Carneiro, Paulo Luiz Souza(Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia Dep. de Ciências Biológicas Laboratório de Genética Molecular)</creator><creator>Malhado, Carlos Henrique Mendes(Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia Dep. de Ciências Biológicas Laboratório de Genética Molecular)</creator><creator>Euclydes, Ricardo Frederico(Universidade Federal de Viçosa Dep. de Zootecnia)</creator><creator>Torres, Robledo de Almeida(Universidade Federal de Viçosa Dep. de Zootecnia)</creator><creator>Lopes, Paulo Sávio(Universidade Federal de Viçosa Dep. de Zootecnia)</creator><creator>Carneiro, Antonio Policarpo Souza(Universidade Estadual do Oeste do Paraná Centro de Ciências Agrárias)</creator><creator>Cunha, Elizângela Emídio(Universidade Federal de Viçosa Dep. de Zootecnia)</creator><general>Embrapa Informação TecnológicaPesquisa Agropecuária Brasileira</general><general>Embrapa Secretaria de Pesquisa e Desenvolvimento; 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Para obter a matriz de similaridade genética utilizada no BLUPM, foram simulados cem marcadores moleculares do tipo microssatélite (SSR - Simple Sequence Repeat), por meio de um coeficiente de similaridade correspondente à distância euclideana média para dados quantitativos. A fim de comparar os diferentes métodos, utilizaram-se populações com tamanho efetivo de 66,66 e média de 30 repetições, avaliando-se os valores fenotípicos médios. Os ganhos ao longo das 20 gerações de seleção foram maiores para o BLUP em relação ao BLUPM, e este foi superior à SI. Quanto ao ganho obtido nas cinco primeiras gerações, o BLUPM apresentou ganhos semelhantes ao BLUP e superiores à SI. Diferentes sistemas de acasalamento dos reprodutores selecionados não revelaram diferenças em ganho genético nos métodos baseados no BLUP.
The objective of this work was to compare selection based on breeding values predicted by classical best linear unbiased prediction (BLUP), BLUP associated with molecular markers (BLUPM) and individual selection (IS) using data simulated with the Genesys program. To obtain the genetic similarity matrix to be used in BLUPM, a hundred microsatellite markers (simple sequence repeats) were simulated using a similarity coefficient corresponding to the mean Euclidean distance between quantitative data. The different selection methods were compared using populations of an effective size of 66.66 and a mean of 30 repetitions, and mean phenotypic values were determined. Genetic gain obtained over 20 generations of selection was higher for BLUP than BLUPM, which in turn was superior to IS. Similar genetic gains were obtained for BLUPM and BLUP only when the gain for the first five generations was considered, and these gains were higher than those obtained with IS. Selected reproducers mating systems did not lead to differences in genetic gain for the BLUP-based methods.</abstract><pub>Embrapa Informação TecnológicaPesquisa Agropecuária Brasileira</pub><doi>10.1590/S0100-204X2006000400010</doi><tpages>7</tpages><oa>free_for_read</oa></addata></record> |
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