SCAMPP+FastTree: improving scalability for likelihood-based phylogenetic placement

Abstract Summary Phylogenetic placement is the problem of placing ‘query’ sequences into an existing tree (called a ‘backbone tree’). One of the most accurate phylogenetic placement methods to date is the maximum likelihood-based method pplacer, using RAxML to estimate numeric parameters on the back...

Ausführliche Beschreibung

Bibliographische Detailangaben

Veröffentlicht in:	Bioinformatics advances 2023, Vol.3 (1), p.vbad008-vbad008
Hauptverfasser:	Chu, Gillian, Warnow, Tandy
Format:	Artikel
Sprache:	eng
Schlagworte:	Original Paper
Online-Zugang:	Volltext
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