Identification of kinetic order parameters for non-equilibrium dynamics

A popular approach to analyze the dynamics of high-dimensional many-body systems, such as macromolecules, is to project the trajectories onto a space of slowly varying collective variables, where subsequent analyses are made, such as clustering or estimation of free energy profiles or Markov state m...

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Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:	The Journal of chemical physics 2019-04, Vol.150 (16), p.164120
Hauptverfasser:	Paul, Fabian, Wu, Hao, Vossel, Maximilian, de Groot, Bert L., Noé, Frank
Format:	Artikel
Sprache:	eng
Schlagworte:	Balancing Clustering Computer simulation Coupling (molecular) Electrochemical potential Free energy Independent component analysis Ion diffusion Macromolecules Markov chains Molecular dynamics Order parameters Parameter identification Physics Proteins Reduction Resistance Selectivity Trajectories
Online-Zugang:	Volltext
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