Multicanonical ab inito QM/MM molecular dynamics simulation of a peptide in an aqueous environment

We developed a multicanonical ab initio QM/MM molecular dynamics simulation method to enhance conformational sampling of biomolecules in an aqueous environment. We applied this method to an alanine dipeptide immersed in a sphere of explicit water molecules. The peptide and the water molecules were t...

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Veröffentlicht in:Journal of computational chemistry 2010-04, Vol.31 (6), p.1168-1175
Hauptverfasser: Jono, Ryota, Watanabe, Yuusuke, Shimizu, Kentaro, Terada, Tohru
Format: Artikel
Sprache:eng
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