Chronic liver disease-associated severe thrombocytopenia in Spain: Results from a retrospective study using machine learning and natural language processing
Patients with chronic liver disease (CLD) often develop thrombocytopenia (TCP) as a complication. Severe TCP (platelet count
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| Veröffentlicht in: | Gastroenterología y hepatología 2024-03, Vol.47 (3), p.236-245 |
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| Hauptverfasser: | , , , , , , |
| Format: | Artikel |
| Sprache: | eng |
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| Online-Zugang: | Volltext |
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| container_title | Gastroenterología y hepatología |
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| creator | Calleja-Panero, Jose Luis Esteban Mur, Rafael Jarque, Isidro Romero-Gómez, Manuel Group, Savana Research García Labrador, Lucia González Calvo, Jose |
| description | Patients with chronic liver disease (CLD) often develop thrombocytopenia (TCP) as a complication. Severe TCP (platelet count |
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To describe the real-world scenario of CLD-associated severe TCP patients’ clinical characteristics. To evaluate the association between invasive procedures, prophylactic treatments, and bleeding events in this group of patients. To describe their need of medical resource use in Spain.
This is a retrospective, multicenter study including patients who had confirmed diagnosis of CLD and severe TCP in four hospitals within the Spanish National Healthcare Network from January 2014 to December 2018. We analyzed the free-text information from Electronic Health Records (EHRs) of patients using Natural Language Processing (NLP), machine learning techniques, and SNOMED-CT terminology. Demographics, comorbidities, analytical parameters and characteristics of CLD were extracted at baseline and need for invasive procedures, prophylactic treatments, bleeding events and medical resources used in the follow up period. Frequency tables were generated for categorical variables, whereas continuous variables were described in summary tables as mean (SD) and median (Q1–Q3).
Out of 1,765,675 patients, 1787 had CLD and severe TCP; 65.2% were male with a mean age of 54.7 years old. Cirrhosis was detected in 46% (n=820) of patients and 9.1% (n=163) had hepatocellular carcinoma. Invasive procedures were needed in 85.6% of patients during the follow up period. Patients undergoing procedures compared to those patients without invasive procedures presented higher rates of bleeding events (33% vs 8%, p<0.0001) and higher number of bleedings. While prophylactic platelet transfusions were given to 25.6% of patients undergoing procedures, TPO receptor agonist use was only detected in 3.1% of them. Most patients (60.9%) required at least one hospital admission during the follow up and 14.4% of admissions were due to bleeding events with a hospital length of stay of 6 (3, 9) days.
NLP and machine learning are useful tools to describe real-world data in patients with CLD and severe TCP in Spain. Bleeding events are frequent in those patients who need invasive procedures, even receiving platelet transfusions as a prophylactic treatment, increasing the further use of medical resources. Because that, new prophylactic treatments that are not yet generalized, are needed.
Los pacientes con enfermedad hepática crónica (EHC) a menudo desarrollan trombocitopenia (TCP) como agravante de su enfermedad. La TCP grave (definida por un recuento de plaquetas < 50 x 109/L) puede aumentar la morbilidad y complicar el manejo de la EPC, incrementando el riesgo de hemorragia durante los procedimientos invasivos.
Describir el escenario de mundo real de las características clínicas de los pacientes con TCP grave asociado a EHC. Evaluar la asociación entre procedimientos invasivos, tratamientos profilácticos y eventos hemorrágicos en este grupo de pacientes, así como describir el uso de recursos médicos en España.
Se plantea un estudio multicéntrico retrospectivo que incluye pacientes con diagnóstico confirmado de EHC y TCP grave en cuatro hospitales de la Red Nacional de Salud de España desde enero de 2014 hasta diciembre de 2018. Analizamos la información de texto libre de la Historia Clínica Electrónica (HCE) de pacientes que utilizan procesamiento de lenguaje natural (PLN), técnicas de aprendizaje automático y terminología de SNOMED-CT. Los datos demográficos, las comorbilidades, los parámetros analíticos y las características de la EHC se extrajeron al inicio del estudio, así como la necesidad de procedimientos invasivos, tratamientos profilácticos, eventos hemorrágicos y recursos médicos utilizados en el periodo de seguimiento. Se generaron tablas de frecuencia para las variables categóricas, mientras que las variables continuas se describieron en tablas resumen como media (SD) y mediana (Q1-Q3).
De 1.765.675 pacientes identificados, 1.787 tenían EHC y TCP grave, siendo el 65,2% varones con una edad media de 54,7 años. Se detectó cirrosis en el 46% (n = 820) de los pacientes y el 9,1% (n = 163) de ellos presentaron un diagnóstico de carcinoma hepatocelular. Se necesitaron procedimientos invasivos en el 85,6% de los pacientes durante el periodo de seguimiento, presentando una mayor tasa de eventos hemorrágicos (33 vs. 8%, p < 0,0001) y mayor número de sangrados. El 25,6% de los pacientes sometidos a procedimientos invasivos recibieron transfusiones profilácticas de plaquetas, si bien el uso de agonistas del receptor de trombopoyetina (TPO) solo se detectó en el 3,1% de los casos. La mayoría de los pacientes (60,9%) requirieron al menos un ingreso hospitalario durante el periodo de seguimiento, debiéndose el 14,4% de ellos a eventos hemorrágicos con una estancia hospitalaria de 6 (3, 9) días.
El PNL y el aprendizaje automático son herramientas útiles para describir datos del mundo real en pacientes con EHC y TCP grave en España. Los eventos hemorrágicos son frecuentes en aquellos pacientes que se someten a procedimientos invasivos, incluso recibiendo transfusiones de plaquetas como tratamiento profiláctico, lo que supone un incremento del uso de recursos médicos. Estos datos apuntan hacia la necesidad actual existente de generalización de nuevos tratamientos profilácticos.</description><identifier>ISSN: 0210-5705</identifier><identifier>DOI: 10.1016/j.gastrohep.2023.05.010</identifier><identifier>PMID: 37236305</identifier><language>eng</language><publisher>Spain: Elsevier España, S.L.U</publisher><subject>Aprendizaje automático ; Carcinoma, Hepatocellular - complications ; Chronic liver disease ; Electronic health records ; Female ; Hepatopatía crónica ; Historias clínicas electrónicas ; Humans ; Invasive procedures ; Liver Neoplasms ; Machine Learning ; Male ; Middle Aged ; Natural Language Processing ; Platelet transfusions ; Procedimientos invasivos ; Procesamiento del lenguaje natural ; Retrospective Studies ; Spain - epidemiology ; Thrombocytopenia ; Transfusiones de plaquetas ; Trombocitopenia</subject><ispartof>Gastroenterología y hepatología, 2024-03, Vol.47 (3), p.236-245</ispartof><rights>2023 The Authors</rights><rights>Copyright © 2023 The Authors. Publicado por Elsevier España, S.L.U. All rights reserved.</rights><lds50>peer_reviewed</lds50><oa>free_for_read</oa><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed><cites>FETCH-LOGICAL-c366t-1d89cba638834cad748ec351bed095f753c84486dbebd0f9551be3d99d183e8e3</cites><orcidid>0000-0001-5673-4490</orcidid></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Tsyndetics_thumb_exl</thumbnail><linktohtml>$$Uhttps://dx.doi.org/10.1016/j.gastrohep.2023.05.010$$EHTML$$P50$$Gelsevier$$Hfree_for_read</linktohtml><link.rule.ids>314,780,784,3550,27924,27925,45995</link.rule.ids><backlink>$$Uhttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/37236305$$D View this record in MEDLINE/PubMed$$Hfree_for_read</backlink></links><search><creatorcontrib>Calleja-Panero, Jose Luis</creatorcontrib><creatorcontrib>Esteban Mur, Rafael</creatorcontrib><creatorcontrib>Jarque, Isidro</creatorcontrib><creatorcontrib>Romero-Gómez, Manuel</creatorcontrib><creatorcontrib>Group, Savana Research</creatorcontrib><creatorcontrib>García Labrador, Lucia</creatorcontrib><creatorcontrib>González Calvo, Jose</creatorcontrib><title>Chronic liver disease-associated severe thrombocytopenia in Spain: Results from a retrospective study using machine learning and natural language processing</title><title>Gastroenterología y hepatología</title><addtitle>Gastroenterol Hepatol</addtitle><description>Patients with chronic liver disease (CLD) often develop thrombocytopenia (TCP) as a complication. Severe TCP (platelet count<50×109/L) can increase morbidity and complicate CLD management, increasing bleeding risk during invasive procedures.
To describe the real-world scenario of CLD-associated severe TCP patients’ clinical characteristics. To evaluate the association between invasive procedures, prophylactic treatments, and bleeding events in this group of patients. To describe their need of medical resource use in Spain.
This is a retrospective, multicenter study including patients who had confirmed diagnosis of CLD and severe TCP in four hospitals within the Spanish National Healthcare Network from January 2014 to December 2018. We analyzed the free-text information from Electronic Health Records (EHRs) of patients using Natural Language Processing (NLP), machine learning techniques, and SNOMED-CT terminology. Demographics, comorbidities, analytical parameters and characteristics of CLD were extracted at baseline and need for invasive procedures, prophylactic treatments, bleeding events and medical resources used in the follow up period. Frequency tables were generated for categorical variables, whereas continuous variables were described in summary tables as mean (SD) and median (Q1–Q3).
Out of 1,765,675 patients, 1787 had CLD and severe TCP; 65.2% were male with a mean age of 54.7 years old. Cirrhosis was detected in 46% (n=820) of patients and 9.1% (n=163) had hepatocellular carcinoma. Invasive procedures were needed in 85.6% of patients during the follow up period. Patients undergoing procedures compared to those patients without invasive procedures presented higher rates of bleeding events (33% vs 8%, p<0.0001) and higher number of bleedings. While prophylactic platelet transfusions were given to 25.6% of patients undergoing procedures, TPO receptor agonist use was only detected in 3.1% of them. Most patients (60.9%) required at least one hospital admission during the follow up and 14.4% of admissions were due to bleeding events with a hospital length of stay of 6 (3, 9) days.
NLP and machine learning are useful tools to describe real-world data in patients with CLD and severe TCP in Spain. Bleeding events are frequent in those patients who need invasive procedures, even receiving platelet transfusions as a prophylactic treatment, increasing the further use of medical resources. Because that, new prophylactic treatments that are not yet generalized, are needed.
Los pacientes con enfermedad hepática crónica (EHC) a menudo desarrollan trombocitopenia (TCP) como agravante de su enfermedad. La TCP grave (definida por un recuento de plaquetas < 50 x 109/L) puede aumentar la morbilidad y complicar el manejo de la EPC, incrementando el riesgo de hemorragia durante los procedimientos invasivos.
Describir el escenario de mundo real de las características clínicas de los pacientes con TCP grave asociado a EHC. Evaluar la asociación entre procedimientos invasivos, tratamientos profilácticos y eventos hemorrágicos en este grupo de pacientes, así como describir el uso de recursos médicos en España.
Se plantea un estudio multicéntrico retrospectivo que incluye pacientes con diagnóstico confirmado de EHC y TCP grave en cuatro hospitales de la Red Nacional de Salud de España desde enero de 2014 hasta diciembre de 2018. Analizamos la información de texto libre de la Historia Clínica Electrónica (HCE) de pacientes que utilizan procesamiento de lenguaje natural (PLN), técnicas de aprendizaje automático y terminología de SNOMED-CT. Los datos demográficos, las comorbilidades, los parámetros analíticos y las características de la EHC se extrajeron al inicio del estudio, así como la necesidad de procedimientos invasivos, tratamientos profilácticos, eventos hemorrágicos y recursos médicos utilizados en el periodo de seguimiento. Se generaron tablas de frecuencia para las variables categóricas, mientras que las variables continuas se describieron en tablas resumen como media (SD) y mediana (Q1-Q3).
De 1.765.675 pacientes identificados, 1.787 tenían EHC y TCP grave, siendo el 65,2% varones con una edad media de 54,7 años. Se detectó cirrosis en el 46% (n = 820) de los pacientes y el 9,1% (n = 163) de ellos presentaron un diagnóstico de carcinoma hepatocelular. Se necesitaron procedimientos invasivos en el 85,6% de los pacientes durante el periodo de seguimiento, presentando una mayor tasa de eventos hemorrágicos (33 vs. 8%, p < 0,0001) y mayor número de sangrados. El 25,6% de los pacientes sometidos a procedimientos invasivos recibieron transfusiones profilácticas de plaquetas, si bien el uso de agonistas del receptor de trombopoyetina (TPO) solo se detectó en el 3,1% de los casos. La mayoría de los pacientes (60,9%) requirieron al menos un ingreso hospitalario durante el periodo de seguimiento, debiéndose el 14,4% de ellos a eventos hemorrágicos con una estancia hospitalaria de 6 (3, 9) días.
El PNL y el aprendizaje automático son herramientas útiles para describir datos del mundo real en pacientes con EHC y TCP grave en España. Los eventos hemorrágicos son frecuentes en aquellos pacientes que se someten a procedimientos invasivos, incluso recibiendo transfusiones de plaquetas como tratamiento profiláctico, lo que supone un incremento del uso de recursos médicos. 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To describe the real-world scenario of CLD-associated severe TCP patients’ clinical characteristics. To evaluate the association between invasive procedures, prophylactic treatments, and bleeding events in this group of patients. To describe their need of medical resource use in Spain.
This is a retrospective, multicenter study including patients who had confirmed diagnosis of CLD and severe TCP in four hospitals within the Spanish National Healthcare Network from January 2014 to December 2018. We analyzed the free-text information from Electronic Health Records (EHRs) of patients using Natural Language Processing (NLP), machine learning techniques, and SNOMED-CT terminology. Demographics, comorbidities, analytical parameters and characteristics of CLD were extracted at baseline and need for invasive procedures, prophylactic treatments, bleeding events and medical resources used in the follow up period. Frequency tables were generated for categorical variables, whereas continuous variables were described in summary tables as mean (SD) and median (Q1–Q3).
Out of 1,765,675 patients, 1787 had CLD and severe TCP; 65.2% were male with a mean age of 54.7 years old. Cirrhosis was detected in 46% (n=820) of patients and 9.1% (n=163) had hepatocellular carcinoma. Invasive procedures were needed in 85.6% of patients during the follow up period. Patients undergoing procedures compared to those patients without invasive procedures presented higher rates of bleeding events (33% vs 8%, p<0.0001) and higher number of bleedings. While prophylactic platelet transfusions were given to 25.6% of patients undergoing procedures, TPO receptor agonist use was only detected in 3.1% of them. Most patients (60.9%) required at least one hospital admission during the follow up and 14.4% of admissions were due to bleeding events with a hospital length of stay of 6 (3, 9) days.
NLP and machine learning are useful tools to describe real-world data in patients with CLD and severe TCP in Spain. Bleeding events are frequent in those patients who need invasive procedures, even receiving platelet transfusions as a prophylactic treatment, increasing the further use of medical resources. Because that, new prophylactic treatments that are not yet generalized, are needed.
Los pacientes con enfermedad hepática crónica (EHC) a menudo desarrollan trombocitopenia (TCP) como agravante de su enfermedad. La TCP grave (definida por un recuento de plaquetas < 50 x 109/L) puede aumentar la morbilidad y complicar el manejo de la EPC, incrementando el riesgo de hemorragia durante los procedimientos invasivos.
Describir el escenario de mundo real de las características clínicas de los pacientes con TCP grave asociado a EHC. Evaluar la asociación entre procedimientos invasivos, tratamientos profilácticos y eventos hemorrágicos en este grupo de pacientes, así como describir el uso de recursos médicos en España.
Se plantea un estudio multicéntrico retrospectivo que incluye pacientes con diagnóstico confirmado de EHC y TCP grave en cuatro hospitales de la Red Nacional de Salud de España desde enero de 2014 hasta diciembre de 2018. Analizamos la información de texto libre de la Historia Clínica Electrónica (HCE) de pacientes que utilizan procesamiento de lenguaje natural (PLN), técnicas de aprendizaje automático y terminología de SNOMED-CT. Los datos demográficos, las comorbilidades, los parámetros analíticos y las características de la EHC se extrajeron al inicio del estudio, así como la necesidad de procedimientos invasivos, tratamientos profilácticos, eventos hemorrágicos y recursos médicos utilizados en el periodo de seguimiento. Se generaron tablas de frecuencia para las variables categóricas, mientras que las variables continuas se describieron en tablas resumen como media (SD) y mediana (Q1-Q3).
De 1.765.675 pacientes identificados, 1.787 tenían EHC y TCP grave, siendo el 65,2% varones con una edad media de 54,7 años. Se detectó cirrosis en el 46% (n = 820) de los pacientes y el 9,1% (n = 163) de ellos presentaron un diagnóstico de carcinoma hepatocelular. Se necesitaron procedimientos invasivos en el 85,6% de los pacientes durante el periodo de seguimiento, presentando una mayor tasa de eventos hemorrágicos (33 vs. 8%, p < 0,0001) y mayor número de sangrados. El 25,6% de los pacientes sometidos a procedimientos invasivos recibieron transfusiones profilácticas de plaquetas, si bien el uso de agonistas del receptor de trombopoyetina (TPO) solo se detectó en el 3,1% de los casos. La mayoría de los pacientes (60,9%) requirieron al menos un ingreso hospitalario durante el periodo de seguimiento, debiéndose el 14,4% de ellos a eventos hemorrágicos con una estancia hospitalaria de 6 (3, 9) días.
El PNL y el aprendizaje automático son herramientas útiles para describir datos del mundo real en pacientes con EHC y TCP grave en España. Los eventos hemorrágicos son frecuentes en aquellos pacientes que se someten a procedimientos invasivos, incluso recibiendo transfusiones de plaquetas como tratamiento profiláctico, lo que supone un incremento del uso de recursos médicos. Estos datos apuntan hacia la necesidad actual existente de generalización de nuevos tratamientos profilácticos.</abstract><cop>Spain</cop><pub>Elsevier España, S.L.U</pub><pmid>37236305</pmid><doi>10.1016/j.gastrohep.2023.05.010</doi><tpages>10</tpages><orcidid>https://orcid.org/0000-0001-5673-4490</orcidid><oa>free_for_read</oa></addata></record> |
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| subjects | Aprendizaje automático Carcinoma, Hepatocellular - complications Chronic liver disease Electronic health records Female Hepatopatía crónica Historias clínicas electrónicas Humans Invasive procedures Liver Neoplasms Machine Learning Male Middle Aged Natural Language Processing Platelet transfusions Procedimientos invasivos Procesamiento del lenguaje natural Retrospective Studies Spain - epidemiology Thrombocytopenia Transfusiones de plaquetas Trombocitopenia |
| title | Chronic liver disease-associated severe thrombocytopenia in Spain: Results from a retrospective study using machine learning and natural language processing |
| url | https://sfx.bib-bvb.de/sfx_tum?ctx_ver=Z39.88-2004&ctx_enc=info:ofi/enc:UTF-8&ctx_tim=2025-01-01T05%3A38%3A41IST&url_ver=Z39.88-2004&url_ctx_fmt=infofi/fmt:kev:mtx:ctx&rfr_id=info:sid/primo.exlibrisgroup.com:primo3-Article-proquest_cross&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:journal&rft.genre=article&rft.atitle=Chronic%20liver%20disease-associated%20severe%20thrombocytopenia%20in%20Spain:%20Results%20from%20a%20retrospective%20study%20using%20machine%20learning%20and%20natural%20language%20processing&rft.jtitle=Gastroenterolog%C3%ADa%20y%20hepatolog%C3%ADa&rft.au=Calleja-Panero,%20Jose%20Luis&rft.date=2024-03&rft.volume=47&rft.issue=3&rft.spage=236&rft.epage=245&rft.pages=236-245&rft.issn=0210-5705&rft_id=info:doi/10.1016/j.gastrohep.2023.05.010&rft_dat=%3Cproquest_cross%3E2820027518%3C/proquest_cross%3E%3Curl%3E%3C/url%3E&disable_directlink=true&sfx.directlink=off&sfx.report_link=0&rft_id=info:oai/&rft_pqid=2820027518&rft_id=info:pmid/37236305&rft_els_id=S0210570523003412&rfr_iscdi=true |