GLOBE: a contrastive learning-based framework for integrating single-cell transcriptome datasets

Abstract Integration of single-cell transcriptome datasets from multiple sources plays an important role in investigating complex biological systems. The key to integration of transcriptome datasets is batch effect removal. Recent methods attempt to apply a contrastive learning strategy to correct b...

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Veröffentlicht in:Briefings in bioinformatics 2022-09, Vol.23 (5)
Hauptverfasser: Yan, Xuhua, Zheng, Ruiqing, Li, Min
Format: Artikel
Sprache:eng
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