destiny: diffusion maps for large-scale single-cell data in R

: Diffusion maps are a spectral method for non-linear dimension reduction and have recently been adapted for the visualization of single-cell expression data. Here we present destiny, an efficient R implementation of the diffusion map algorithm. Our package includes a single-cell specific noise mode...

Ausführliche Beschreibung

Bibliographische Detailangaben

Veröffentlicht in:	Bioinformatics 2016-04, Vol.32 (8), p.1241-1243
Hauptverfasser:	Angerer, Philipp, Haghverdi, Laleh, Büttner, Maren, Theis, Fabian J, Marr, Carsten, Buettner, Florian
Format:	Artikel
Sprache:	eng
Schlagworte:	Algorithms Bioinformatics Cellular Cluster Analysis Diffusion Packages Reduction Single-Cell Analysis - methods Software Source code
Online-Zugang:	Volltext
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