Algorithm for the diagnosis of smear‐negative pulmonary tuberculosis in high‐incidence resource‐constrained settings
Objectives Diagnosis of smear‐negative pulmonary tuberculosis (SNPT) remains a challenge, particularly in resource‐constrained settings. We evaluated a diagnostic algorithm that combines affordable laboratory tools and a clinical prediction rule (CPR). Methods We derived, based on published evidence...
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| Veröffentlicht in: | Tropical medicine & international health 2013-10, Vol.18 (10), p.1222-1230 |
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| Hauptverfasser: | , , , , , , , , |
| Format: | Artikel |
| Sprache: | eng |
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| Online-Zugang: | Volltext |
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| container_title | Tropical medicine & international health |
| container_volume | 18 |
| creator | Soto, Alonso Solari, Lely Agapito, Juan Gotuzzo, Eduardo Accinelli, Roberto Vargas, Dante Acurio, Vilma Matthys, Francine Stuyft, Patrick |
| description | Objectives
Diagnosis of smear‐negative pulmonary tuberculosis (SNPT) remains a challenge, particularly in resource‐constrained settings. We evaluated a diagnostic algorithm that combines affordable laboratory tools and a clinical prediction rule (CPR).
Methods
We derived, based on published evidence, a diagnostic algorithm for SNPT. Sputum concentration constitutes its first step. In suspects with negative results, SNPT probability is classified with a CPR as low (excluded), high (confirmed) or intermediate. For intermediate patients, sputum Middlebrook 7H9 liquid culture is performed, and they are assessed after 2 weeks. If clinically deteriorated, with still negative liquid culture, bronchoscopy is offered. Otherwise, results of Middlebrook 7H9 culture are awaited. We prospectively evaluated this algorithm against a reference standard of solid and liquid cultures in two reference hospitals in Lima, Peru.
Results
670 SNPT suspects were included from September 2005 to March 2008. The prevalence of SNPT was 27% according to the reference standard. The algorithm's overall accuracy was 0.94 (95% CI 0.91–0.95), its sensitivity was 0.88 (95% CI 0.82–0.92) and its specificity, 0.96 (95% CI 0.94–0.98). Sputum concentration, the CPR, Middlebrook 7H9 sputum culture and bronchoscopic samples defined a diagnosis of SNPT according to the algorithm in 57 (37%), 25 (16%), 63 (41%) and 8(5%) of patients, respectively. 65% of patients were diagnosed within 3 weeks.
Conclusions
The algorithm was accurate for SNPT diagnosis. Sputum concentration, CPR and selective Middlebrook 7H9 culture are essential components.
Objectifs
Le diagnostic de la tuberculose pulmonaire à frottis négatif (TPFN) reste un défi, en particulier dans les pays à ressources limitées. Nous avons évalué un algorithme de diagnostic qui combine des outils de laboratoire abordables et une règle de prédiction clinique (RPC).
MéthodesNous avons établi, sur base des données publiées, un algorithme de diagnostic pour la TPFN. La concentration des expectorations constitue sa première étape. Chez les suspects avec des résultats négatifs, la probabilité de TPFN est classée avec une RPC comme: faible (exclue), élevée (confirmée) ou intermédiaire. Pour les patients intermédiaires, la culture des crachats dans du milieu liquide Middlebrook 7H9 a été effectuée et évaluée au bout de deux semaines. Dans le cas d'une détérioration clinique avec une culture liquide toujours négative, la bronchoscopie est offerte. Dans le |
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Diagnosis of smear‐negative pulmonary tuberculosis (SNPT) remains a challenge, particularly in resource‐constrained settings. We evaluated a diagnostic algorithm that combines affordable laboratory tools and a clinical prediction rule (CPR).
Methods
We derived, based on published evidence, a diagnostic algorithm for SNPT. Sputum concentration constitutes its first step. In suspects with negative results, SNPT probability is classified with a CPR as low (excluded), high (confirmed) or intermediate. For intermediate patients, sputum Middlebrook 7H9 liquid culture is performed, and they are assessed after 2 weeks. If clinically deteriorated, with still negative liquid culture, bronchoscopy is offered. Otherwise, results of Middlebrook 7H9 culture are awaited. We prospectively evaluated this algorithm against a reference standard of solid and liquid cultures in two reference hospitals in Lima, Peru.
Results
670 SNPT suspects were included from September 2005 to March 2008. The prevalence of SNPT was 27% according to the reference standard. The algorithm's overall accuracy was 0.94 (95% CI 0.91–0.95), its sensitivity was 0.88 (95% CI 0.82–0.92) and its specificity, 0.96 (95% CI 0.94–0.98). Sputum concentration, the CPR, Middlebrook 7H9 sputum culture and bronchoscopic samples defined a diagnosis of SNPT according to the algorithm in 57 (37%), 25 (16%), 63 (41%) and 8(5%) of patients, respectively. 65% of patients were diagnosed within 3 weeks.
Conclusions
The algorithm was accurate for SNPT diagnosis. Sputum concentration, CPR and selective Middlebrook 7H9 culture are essential components.
Objectifs
Le diagnostic de la tuberculose pulmonaire à frottis négatif (TPFN) reste un défi, en particulier dans les pays à ressources limitées. Nous avons évalué un algorithme de diagnostic qui combine des outils de laboratoire abordables et une règle de prédiction clinique (RPC).
MéthodesNous avons établi, sur base des données publiées, un algorithme de diagnostic pour la TPFN. La concentration des expectorations constitue sa première étape. Chez les suspects avec des résultats négatifs, la probabilité de TPFN est classée avec une RPC comme: faible (exclue), élevée (confirmée) ou intermédiaire. Pour les patients intermédiaires, la culture des crachats dans du milieu liquide Middlebrook 7H9 a été effectuée et évaluée au bout de deux semaines. Dans le cas d'une détérioration clinique avec une culture liquide toujours négative, la bronchoscopie est offerte. Dans le cas contraire, les résultats de culture dans le Middlebrook 7H9 sont attendus. Nous avons évalué prospectivement cet algorithme par rapport à une norme de référence basée sur la culture en milieux solides et liquides dans deux hôpitaux de référence à Lima, au Pérou.
Résultats
670 suspects de TPFN ont été inclus de septembre 2005 à mars 2008. La prévalence de la TPFN était de 27% selon la norme de référence. La précision globale de l'algorithme était de 0.94 (IC 95%: 0.91–0.95), sa sensibilité était de 0.88 (IC 95%: 0.82–0.92) et sa spécificité de 0.96 (IC 95%: 0.94–0.98). La concentration des expectorations, la RPC, la culture des expectorations dans le Middlebrook 7H9 et des échantillons bronchoscopiques ont défini un diagnostic de la TPFN selon l'algorithme chez 57 (37%), 25 (16%), 63 (41%) et 8 (5%) patients respectivement. 65% des patients ont été diagnostiqués endéans 3 semaines.
Conclusions
L'algorithme était précis pour le diagnostic de la TPFN. La concentration des expectorations, la RPC et la culture sélective dans le Middlebrook 7H9 sont des éléments essentiels.
Objetivos
El diagnóstico de la tuberculosis pulmonar con baciloscopia negativa (TPBN) continúa siendo un gran reto, particularmente en lugares con pocos recursos. Hemos evaluado un algoritmo de diagnóstico que combina herramientas de laboratorio asequibles y una regla de predicción clínica (RPC).
Métodos
Basándonos en evidencia publicada, derivamos un algoritmo diagnóstico para TPBN. El primer paso es concentrar el esputo. En pacientes con resultados negativos pero con sospecha de TB la probabilidad de TPBN se clasifica con una RPC como baja (excluída), alta (confirmada) o intermedia. Para pacientes con una clasificación intermedia, se realiza un cultivo de esputo en medio líquido Middlebrook 7H9 y se evalúan dos semanas más tarde. Si están clínicamente deteriorados, con un cultivo líquido aún negativo, se realiza una broncoscopia. Evaluamos de forma prospectiva este algoritmo frente a un estándar de referencia de cultivos sólido y líquido en dos hospitales de referencia en Lima, Perú.
Resultados
Se incluyeron 670 pacientes con sospecha de TPBN entre Septiembre 2005 y Marzo 2008. La prevalencia de TPBN era un 27% según el estándar de referencia. La precisión del algorithmo era de 0.94 (IC 95% 0.91–0.95), la sensitibilidad era de 0.88 (IC 95% 0.82–0.92) y la especificidad de 0.96 (IC 95% 0.94–0.98). La concentración de esputo, el RPC, el cultivo de esputo Middlebrook 7H9 y las muestras de la broncoscopia definieron un diagnóstico de TPBN según el algoritmo en 57 (37%), 25 (16%), 63 (41%) y 8(5%) de los pacientes respectivamente. Un 65% de los pacientes fueron diagnosticados en un plazo de tres semanas.
Conclusiones
El algoritmo era preciso para el diagnóstico de TPBN. La concentración de esputo, la RPC y el cultivo en Middlebrook 7H9 eran componentes esenciales.</description><identifier>ISSN: 1360-2276</identifier><identifier>EISSN: 1365-3156</identifier><identifier>DOI: 10.1111/tmi.12172</identifier><identifier>PMID: 23952335</identifier><language>eng</language><publisher>Oxford: Blackwell</publisher><subject>Adult ; Algorithms ; Bacterial diseases ; Bacterial diseases of the respiratory system ; Biological and medical sciences ; decision‐making ; diagnosis ; Female ; General aspects ; Human bacterial diseases ; Humans ; Infectious diseases ; Male ; Mass Screening - methods ; Medical diagnosis ; Medical sciences ; Middle Aged ; Mycobacterium ; Mycobacterium tuberculosis - isolation & purification ; Predictive Value of Tests ; pulmonary ; Sensitivity and Specificity ; smear‐negative ; Sputum - microbiology ; Tuberculosis ; Tuberculosis and atypical mycobacterial infections ; Tuberculosis, Pulmonary - diagnosis ; Young Adult</subject><ispartof>Tropical medicine & international health, 2013-10, Vol.18 (10), p.1222-1230</ispartof><rights>2013 John Wiley & Sons Ltd</rights><rights>2014 INIST-CNRS</rights><rights>2013 John Wiley & Sons Ltd.</rights><lds50>peer_reviewed</lds50><oa>free_for_read</oa><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed><citedby>FETCH-LOGICAL-c4512-cdf69913e773c8f3b9d1427d1c42035b56919900454691573f4db688446fc1173</citedby><cites>FETCH-LOGICAL-c4512-cdf69913e773c8f3b9d1427d1c42035b56919900454691573f4db688446fc1173</cites></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Tsyndetics_thumb_exl</thumbnail><linktopdf>$$Uhttps://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1111%2Ftmi.12172$$EPDF$$P50$$Gwiley$$H</linktopdf><linktohtml>$$Uhttps://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111%2Ftmi.12172$$EHTML$$P50$$Gwiley$$H</linktohtml><link.rule.ids>314,780,784,1417,1433,27924,27925,45574,45575,46409,46833</link.rule.ids><backlink>$$Uhttp://pascal-francis.inist.fr/vibad/index.php?action=getRecordDetail&idt=27712380$$DView record in Pascal Francis$$Hfree_for_read</backlink><backlink>$$Uhttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23952335$$D View this record in MEDLINE/PubMed$$Hfree_for_read</backlink></links><search><creatorcontrib>Soto, Alonso</creatorcontrib><creatorcontrib>Solari, Lely</creatorcontrib><creatorcontrib>Agapito, Juan</creatorcontrib><creatorcontrib>Gotuzzo, Eduardo</creatorcontrib><creatorcontrib>Accinelli, Roberto</creatorcontrib><creatorcontrib>Vargas, Dante</creatorcontrib><creatorcontrib>Acurio, Vilma</creatorcontrib><creatorcontrib>Matthys, Francine</creatorcontrib><creatorcontrib>Stuyft, Patrick</creatorcontrib><title>Algorithm for the diagnosis of smear‐negative pulmonary tuberculosis in high‐incidence resource‐constrained settings</title><title>Tropical medicine & international health</title><addtitle>Trop Med Int Health</addtitle><description>Objectives
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Results
670 SNPT suspects were included from September 2005 to March 2008. The prevalence of SNPT was 27% according to the reference standard. The algorithm's overall accuracy was 0.94 (95% CI 0.91–0.95), its sensitivity was 0.88 (95% CI 0.82–0.92) and its specificity, 0.96 (95% CI 0.94–0.98). Sputum concentration, the CPR, Middlebrook 7H9 sputum culture and bronchoscopic samples defined a diagnosis of SNPT according to the algorithm in 57 (37%), 25 (16%), 63 (41%) and 8(5%) of patients, respectively. 65% of patients were diagnosed within 3 weeks.
Conclusions
The algorithm was accurate for SNPT diagnosis. Sputum concentration, CPR and selective Middlebrook 7H9 culture are essential components.
Objectifs
Le diagnostic de la tuberculose pulmonaire à frottis négatif (TPFN) reste un défi, en particulier dans les pays à ressources limitées. Nous avons évalué un algorithme de diagnostic qui combine des outils de laboratoire abordables et une règle de prédiction clinique (RPC).
MéthodesNous avons établi, sur base des données publiées, un algorithme de diagnostic pour la TPFN. La concentration des expectorations constitue sa première étape. Chez les suspects avec des résultats négatifs, la probabilité de TPFN est classée avec une RPC comme: faible (exclue), élevée (confirmée) ou intermédiaire. Pour les patients intermédiaires, la culture des crachats dans du milieu liquide Middlebrook 7H9 a été effectuée et évaluée au bout de deux semaines. Dans le cas d'une détérioration clinique avec une culture liquide toujours négative, la bronchoscopie est offerte. Dans le cas contraire, les résultats de culture dans le Middlebrook 7H9 sont attendus. Nous avons évalué prospectivement cet algorithme par rapport à une norme de référence basée sur la culture en milieux solides et liquides dans deux hôpitaux de référence à Lima, au Pérou.
Résultats
670 suspects de TPFN ont été inclus de septembre 2005 à mars 2008. La prévalence de la TPFN était de 27% selon la norme de référence. La précision globale de l'algorithme était de 0.94 (IC 95%: 0.91–0.95), sa sensibilité était de 0.88 (IC 95%: 0.82–0.92) et sa spécificité de 0.96 (IC 95%: 0.94–0.98). La concentration des expectorations, la RPC, la culture des expectorations dans le Middlebrook 7H9 et des échantillons bronchoscopiques ont défini un diagnostic de la TPFN selon l'algorithme chez 57 (37%), 25 (16%), 63 (41%) et 8 (5%) patients respectivement. 65% des patients ont été diagnostiqués endéans 3 semaines.
Conclusions
L'algorithme était précis pour le diagnostic de la TPFN. La concentration des expectorations, la RPC et la culture sélective dans le Middlebrook 7H9 sont des éléments essentiels.
Objetivos
El diagnóstico de la tuberculosis pulmonar con baciloscopia negativa (TPBN) continúa siendo un gran reto, particularmente en lugares con pocos recursos. Hemos evaluado un algoritmo de diagnóstico que combina herramientas de laboratorio asequibles y una regla de predicción clínica (RPC).
Métodos
Basándonos en evidencia publicada, derivamos un algoritmo diagnóstico para TPBN. El primer paso es concentrar el esputo. En pacientes con resultados negativos pero con sospecha de TB la probabilidad de TPBN se clasifica con una RPC como baja (excluída), alta (confirmada) o intermedia. Para pacientes con una clasificación intermedia, se realiza un cultivo de esputo en medio líquido Middlebrook 7H9 y se evalúan dos semanas más tarde. Si están clínicamente deteriorados, con un cultivo líquido aún negativo, se realiza una broncoscopia. Evaluamos de forma prospectiva este algoritmo frente a un estándar de referencia de cultivos sólido y líquido en dos hospitales de referencia en Lima, Perú.
Resultados
Se incluyeron 670 pacientes con sospecha de TPBN entre Septiembre 2005 y Marzo 2008. La prevalencia de TPBN era un 27% según el estándar de referencia. La precisión del algorithmo era de 0.94 (IC 95% 0.91–0.95), la sensitibilidad era de 0.88 (IC 95% 0.82–0.92) y la especificidad de 0.96 (IC 95% 0.94–0.98). La concentración de esputo, el RPC, el cultivo de esputo Middlebrook 7H9 y las muestras de la broncoscopia definieron un diagnóstico de TPBN según el algoritmo en 57 (37%), 25 (16%), 63 (41%) y 8(5%) de los pacientes respectivamente. Un 65% de los pacientes fueron diagnosticados en un plazo de tres semanas.
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Results
670 SNPT suspects were included from September 2005 to March 2008. The prevalence of SNPT was 27% according to the reference standard. The algorithm's overall accuracy was 0.94 (95% CI 0.91–0.95), its sensitivity was 0.88 (95% CI 0.82–0.92) and its specificity, 0.96 (95% CI 0.94–0.98). Sputum concentration, the CPR, Middlebrook 7H9 sputum culture and bronchoscopic samples defined a diagnosis of SNPT according to the algorithm in 57 (37%), 25 (16%), 63 (41%) and 8(5%) of patients, respectively. 65% of patients were diagnosed within 3 weeks.
Conclusions
The algorithm was accurate for SNPT diagnosis. Sputum concentration, CPR and selective Middlebrook 7H9 culture are essential components.
Objectifs
Le diagnostic de la tuberculose pulmonaire à frottis négatif (TPFN) reste un défi, en particulier dans les pays à ressources limitées. Nous avons évalué un algorithme de diagnostic qui combine des outils de laboratoire abordables et une règle de prédiction clinique (RPC).
MéthodesNous avons établi, sur base des données publiées, un algorithme de diagnostic pour la TPFN. La concentration des expectorations constitue sa première étape. Chez les suspects avec des résultats négatifs, la probabilité de TPFN est classée avec une RPC comme: faible (exclue), élevée (confirmée) ou intermédiaire. Pour les patients intermédiaires, la culture des crachats dans du milieu liquide Middlebrook 7H9 a été effectuée et évaluée au bout de deux semaines. Dans le cas d'une détérioration clinique avec une culture liquide toujours négative, la bronchoscopie est offerte. Dans le cas contraire, les résultats de culture dans le Middlebrook 7H9 sont attendus. Nous avons évalué prospectivement cet algorithme par rapport à une norme de référence basée sur la culture en milieux solides et liquides dans deux hôpitaux de référence à Lima, au Pérou.
Résultats
670 suspects de TPFN ont été inclus de septembre 2005 à mars 2008. La prévalence de la TPFN était de 27% selon la norme de référence. La précision globale de l'algorithme était de 0.94 (IC 95%: 0.91–0.95), sa sensibilité était de 0.88 (IC 95%: 0.82–0.92) et sa spécificité de 0.96 (IC 95%: 0.94–0.98). La concentration des expectorations, la RPC, la culture des expectorations dans le Middlebrook 7H9 et des échantillons bronchoscopiques ont défini un diagnostic de la TPFN selon l'algorithme chez 57 (37%), 25 (16%), 63 (41%) et 8 (5%) patients respectivement. 65% des patients ont été diagnostiqués endéans 3 semaines.
Conclusions
L'algorithme était précis pour le diagnostic de la TPFN. La concentration des expectorations, la RPC et la culture sélective dans le Middlebrook 7H9 sont des éléments essentiels.
Objetivos
El diagnóstico de la tuberculosis pulmonar con baciloscopia negativa (TPBN) continúa siendo un gran reto, particularmente en lugares con pocos recursos. Hemos evaluado un algoritmo de diagnóstico que combina herramientas de laboratorio asequibles y una regla de predicción clínica (RPC).
Métodos
Basándonos en evidencia publicada, derivamos un algoritmo diagnóstico para TPBN. El primer paso es concentrar el esputo. En pacientes con resultados negativos pero con sospecha de TB la probabilidad de TPBN se clasifica con una RPC como baja (excluída), alta (confirmada) o intermedia. Para pacientes con una clasificación intermedia, se realiza un cultivo de esputo en medio líquido Middlebrook 7H9 y se evalúan dos semanas más tarde. Si están clínicamente deteriorados, con un cultivo líquido aún negativo, se realiza una broncoscopia. Evaluamos de forma prospectiva este algoritmo frente a un estándar de referencia de cultivos sólido y líquido en dos hospitales de referencia en Lima, Perú.
Resultados
Se incluyeron 670 pacientes con sospecha de TPBN entre Septiembre 2005 y Marzo 2008. La prevalencia de TPBN era un 27% según el estándar de referencia. La precisión del algorithmo era de 0.94 (IC 95% 0.91–0.95), la sensitibilidad era de 0.88 (IC 95% 0.82–0.92) y la especificidad de 0.96 (IC 95% 0.94–0.98). La concentración de esputo, el RPC, el cultivo de esputo Middlebrook 7H9 y las muestras de la broncoscopia definieron un diagnóstico de TPBN según el algoritmo en 57 (37%), 25 (16%), 63 (41%) y 8(5%) de los pacientes respectivamente. Un 65% de los pacientes fueron diagnosticados en un plazo de tres semanas.
Conclusiones
El algoritmo era preciso para el diagnóstico de TPBN. La concentración de esputo, la RPC y el cultivo en Middlebrook 7H9 eran componentes esenciales.</abstract><cop>Oxford</cop><pub>Blackwell</pub><pmid>23952335</pmid><doi>10.1111/tmi.12172</doi><tpages>9</tpages><oa>free_for_read</oa></addata></record> |
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| identifier | ISSN: 1360-2276 |
| ispartof | Tropical medicine & international health, 2013-10, Vol.18 (10), p.1222-1230 |
| issn | 1360-2276 1365-3156 |
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| source | MEDLINE; Wiley Journals; Elektronische Zeitschriftenbibliothek - Frei zugängliche E-Journals; IngentaConnect Free/Open Access Journals; Wiley Online Library (Open Access Collection) |
| subjects | Adult Algorithms Bacterial diseases Bacterial diseases of the respiratory system Biological and medical sciences decision‐making diagnosis Female General aspects Human bacterial diseases Humans Infectious diseases Male Mass Screening - methods Medical diagnosis Medical sciences Middle Aged Mycobacterium Mycobacterium tuberculosis - isolation & purification Predictive Value of Tests pulmonary Sensitivity and Specificity smear‐negative Sputum - microbiology Tuberculosis Tuberculosis and atypical mycobacterial infections Tuberculosis, Pulmonary - diagnosis Young Adult |
| title | Algorithm for the diagnosis of smear‐negative pulmonary tuberculosis in high‐incidence resource‐constrained settings |
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