Molecular Characterization and Expression Analysis of the Sterol-carrier Protein-2 Fragment in Anopheles sacharovi Generations
Amaç: Bu çalışmada, Anopheles sacharoviá.e sterol taşıyıcı protein-2 (SCP-2) geninin ilk kez moleküler karakterizasyonunun yapılması ve bu proteini kodlayan genin An. sacharovi gelişim dönemleri ve dişi nesillerin tükürük bezi, orta baǧırsak ve yaǧ dokusu gibi farklı dokularında ekspresyon düzeyleri...
Gespeichert in:
Veröffentlicht in: | Türkiye parazitolojii dergisi 2022-12, Vol.46 (4), p.312-321 |
---|---|
Hauptverfasser: | , , |
Format: | Artikel |
Sprache: | tur |
Schlagworte: | |
Online-Zugang: | Volltext |
Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
container_end_page | 321 |
---|---|
container_issue | 4 |
container_start_page | 312 |
container_title | Türkiye parazitolojii dergisi |
container_volume | 46 |
creator | Aygün, Sümeyye Düzlü, Önder Yıldırım, Alparslan |
description | Amaç: Bu çalışmada, Anopheles sacharoviá.e sterol taşıyıcı protein-2 (SCP-2) geninin ilk kez moleküler karakterizasyonunun yapılması ve bu proteini kodlayan genin An. sacharovi gelişim dönemleri ve dişi nesillerin tükürük bezi, orta baǧırsak ve yaǧ dokusu gibi farklı dokularında ekspresyon düzeylerinin karşılaştırılması amaçlanmıştır. Yöntemler: Sultan Sazlıǧı yöresinden toplanan ergin dişi A??, sacharovi ve insektaryumda elde edilen gelişim dönemleri çalışma materyalini oluşturmuştur. Morfolojik ve moleküler tür identifikasyonu yapılan An. sacharovi nesilleri ve ergin dişi dokularından total RNA ekstraksiyonunu takiben cDNA izolasyonu gerçekleştirilmiştir. cDNA kalıplarında SCP-2 geninin 216 bp fragmenti optimize edilmiş primerlerle amplifiye edilmiş ve amplikonlar sekanslanmıştır. Sekanslar in-silico analizlerle işlenerek genetik karakterizasyonlan saǧlanmıştır. Bulgular: Sekans analizine alman toplam 14 izolata ait SCP-2 nükleotid sekanslarının 12 sinin %100 benzer olduǧu, birbirine homolog olan diǧer iki izolata ait SCP-2 sekanslannm ise 183. bazda tek nükleotid deǧişimi gösterdiǧi belirlenmiştir. SCP-2 gen bölgesinin 216 bp fragmen tinin 72 amino asit zincirini kodladıǧı tespit edilmiştir. Filogenetik analiz sonucu SCP-2 gen sekanslarının sivrisinek türü ve soyu bazında monofiletik olarak kümelendiǧi, An. sacharovi izolatlarmm Anopheles kümesi içerisinde An. stephensi ve An. funestusTa birlikte alt küme oluşturduǧu görülmüştür. qPCR ekspresyon analizleri sonucunda SCP-2,nin en yüksek ergin erkeklerde ifade olduǧu ve bunu sırasıyla ergin dişi, L4, L3, L2, L1 ve pupa dönemlerinin izlediǧi belirlenmiştir. Ergin dişi dokularında ise SCP-2,nin en yüksek, fatbody'de ifade olduǧu bunu sırasıyla midgut ve tükrük bezinin izlediǧi belirlenmiştir. Sonuç: Bu çalışmada, vektör potansiyeli yüksek olan An. sacharovi için aşı adayı veya hedef ilaç bölgelerinden önemli birisi olan SCP-2 ilk kez karakterize edilmiş ve sivrisineǧin gelişim evreleri ve dokularındaki ekspresyonel farklılıklar ortaya konulmuştur. |
doi_str_mv | 10.4274/tpd.galenos.2022.68553 |
format | Article |
fullrecord | <record><control><sourceid>proquest</sourceid><recordid>TN_cdi_proquest_journals_2881464753</recordid><sourceformat>XML</sourceformat><sourcesystem>PC</sourcesystem><sourcerecordid>2881464753</sourcerecordid><originalsourceid>FETCH-proquest_journals_28814647533</originalsourceid><addsrcrecordid>eNqNj81Kw0AUhQdRMP68glxwnTiZyd9WSqubgqD7cklvmynjTLx3IurCZzcVH8DV4cB3-DhK3ZS6qExb3aVxW-zRU4hSGG1M0XR1bU9UZsqqya1u21OVlVbrvLFGn6sLkYPWTW0am6nvdfTUTx4ZFgMy9onYfWFyMQCGLSw_RiaRY70P6D_FCcQdpIHgeUajz3tkdsTwxDGRC7mBFeP-lUICdxzFcSBPAoL9LIjvDh4oEP8q5Eqd7dALXf_lpbpdLV8Wj_nI8W0iSZtDnHgWy8Z03fynamtr_0f9ANdOWhI</addsrcrecordid><sourcetype>Aggregation Database</sourcetype><iscdi>true</iscdi><recordtype>article</recordtype><pqid>2881464753</pqid></control><display><type>article</type><title>Molecular Characterization and Expression Analysis of the Sterol-carrier Protein-2 Fragment in Anopheles sacharovi Generations</title><source>DOAJ Directory of Open Access Journals</source><source>EZB-FREE-00999 freely available EZB journals</source><creator>Aygün, Sümeyye ; Düzlü, Önder ; Yıldırım, Alparslan</creator><creatorcontrib>Aygün, Sümeyye ; Düzlü, Önder ; Yıldırım, Alparslan</creatorcontrib><description>Amaç: Bu çalışmada, Anopheles sacharoviá.e sterol taşıyıcı protein-2 (SCP-2) geninin ilk kez moleküler karakterizasyonunun yapılması ve bu proteini kodlayan genin An. sacharovi gelişim dönemleri ve dişi nesillerin tükürük bezi, orta baǧırsak ve yaǧ dokusu gibi farklı dokularında ekspresyon düzeylerinin karşılaştırılması amaçlanmıştır. Yöntemler: Sultan Sazlıǧı yöresinden toplanan ergin dişi A??, sacharovi ve insektaryumda elde edilen gelişim dönemleri çalışma materyalini oluşturmuştur. Morfolojik ve moleküler tür identifikasyonu yapılan An. sacharovi nesilleri ve ergin dişi dokularından total RNA ekstraksiyonunu takiben cDNA izolasyonu gerçekleştirilmiştir. cDNA kalıplarında SCP-2 geninin 216 bp fragmenti optimize edilmiş primerlerle amplifiye edilmiş ve amplikonlar sekanslanmıştır. Sekanslar in-silico analizlerle işlenerek genetik karakterizasyonlan saǧlanmıştır. Bulgular: Sekans analizine alman toplam 14 izolata ait SCP-2 nükleotid sekanslarının 12 sinin %100 benzer olduǧu, birbirine homolog olan diǧer iki izolata ait SCP-2 sekanslannm ise 183. bazda tek nükleotid deǧişimi gösterdiǧi belirlenmiştir. SCP-2 gen bölgesinin 216 bp fragmen tinin 72 amino asit zincirini kodladıǧı tespit edilmiştir. Filogenetik analiz sonucu SCP-2 gen sekanslarının sivrisinek türü ve soyu bazında monofiletik olarak kümelendiǧi, An. sacharovi izolatlarmm Anopheles kümesi içerisinde An. stephensi ve An. funestusTa birlikte alt küme oluşturduǧu görülmüştür. qPCR ekspresyon analizleri sonucunda SCP-2,nin en yüksek ergin erkeklerde ifade olduǧu ve bunu sırasıyla ergin dişi, L4, L3, L2, L1 ve pupa dönemlerinin izlediǧi belirlenmiştir. Ergin dişi dokularında ise SCP-2,nin en yüksek, fatbody'de ifade olduǧu bunu sırasıyla midgut ve tükrük bezinin izlediǧi belirlenmiştir. Sonuç: Bu çalışmada, vektör potansiyeli yüksek olan An. sacharovi için aşı adayı veya hedef ilaç bölgelerinden önemli birisi olan SCP-2 ilk kez karakterize edilmiş ve sivrisineǧin gelişim evreleri ve dokularındaki ekspresyonel farklılıklar ortaya konulmuştur.</description><identifier>ISSN: 1300-6320</identifier><identifier>EISSN: 2146-3077</identifier><identifier>DOI: 10.4274/tpd.galenos.2022.68553</identifier><language>tur</language><publisher>Izmir: Galenos Publishing House</publisher><subject>Adipose tissue ; Anopheles ; Anopheles sacharovi ; Anopheles stephensi ; Developmental stages ; Fat body ; Midgut ; Phylogeny ; Proteins ; Salivary gland ; Sequence analysis ; Single-cell protein ; Sterols</subject><ispartof>Türkiye parazitolojii dergisi, 2022-12, Vol.46 (4), p.312-321</ispartof><rights>Copyright Galenos Publishing House Dec 2022</rights><lds50>peer_reviewed</lds50><oa>free_for_read</oa><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Tsyndetics_thumb_exl</thumbnail><link.rule.ids>314,776,780,860,27903,27904</link.rule.ids></links><search><creatorcontrib>Aygün, Sümeyye</creatorcontrib><creatorcontrib>Düzlü, Önder</creatorcontrib><creatorcontrib>Yıldırım, Alparslan</creatorcontrib><title>Molecular Characterization and Expression Analysis of the Sterol-carrier Protein-2 Fragment in Anopheles sacharovi Generations</title><title>Türkiye parazitolojii dergisi</title><description>Amaç: Bu çalışmada, Anopheles sacharoviá.e sterol taşıyıcı protein-2 (SCP-2) geninin ilk kez moleküler karakterizasyonunun yapılması ve bu proteini kodlayan genin An. sacharovi gelişim dönemleri ve dişi nesillerin tükürük bezi, orta baǧırsak ve yaǧ dokusu gibi farklı dokularında ekspresyon düzeylerinin karşılaştırılması amaçlanmıştır. Yöntemler: Sultan Sazlıǧı yöresinden toplanan ergin dişi A??, sacharovi ve insektaryumda elde edilen gelişim dönemleri çalışma materyalini oluşturmuştur. Morfolojik ve moleküler tür identifikasyonu yapılan An. sacharovi nesilleri ve ergin dişi dokularından total RNA ekstraksiyonunu takiben cDNA izolasyonu gerçekleştirilmiştir. cDNA kalıplarında SCP-2 geninin 216 bp fragmenti optimize edilmiş primerlerle amplifiye edilmiş ve amplikonlar sekanslanmıştır. Sekanslar in-silico analizlerle işlenerek genetik karakterizasyonlan saǧlanmıştır. Bulgular: Sekans analizine alman toplam 14 izolata ait SCP-2 nükleotid sekanslarının 12 sinin %100 benzer olduǧu, birbirine homolog olan diǧer iki izolata ait SCP-2 sekanslannm ise 183. bazda tek nükleotid deǧişimi gösterdiǧi belirlenmiştir. SCP-2 gen bölgesinin 216 bp fragmen tinin 72 amino asit zincirini kodladıǧı tespit edilmiştir. Filogenetik analiz sonucu SCP-2 gen sekanslarının sivrisinek türü ve soyu bazında monofiletik olarak kümelendiǧi, An. sacharovi izolatlarmm Anopheles kümesi içerisinde An. stephensi ve An. funestusTa birlikte alt küme oluşturduǧu görülmüştür. qPCR ekspresyon analizleri sonucunda SCP-2,nin en yüksek ergin erkeklerde ifade olduǧu ve bunu sırasıyla ergin dişi, L4, L3, L2, L1 ve pupa dönemlerinin izlediǧi belirlenmiştir. Ergin dişi dokularında ise SCP-2,nin en yüksek, fatbody'de ifade olduǧu bunu sırasıyla midgut ve tükrük bezinin izlediǧi belirlenmiştir. Sonuç: Bu çalışmada, vektör potansiyeli yüksek olan An. sacharovi için aşı adayı veya hedef ilaç bölgelerinden önemli birisi olan SCP-2 ilk kez karakterize edilmiş ve sivrisineǧin gelişim evreleri ve dokularındaki ekspresyonel farklılıklar ortaya konulmuştur.</description><subject>Adipose tissue</subject><subject>Anopheles</subject><subject>Anopheles sacharovi</subject><subject>Anopheles stephensi</subject><subject>Developmental stages</subject><subject>Fat body</subject><subject>Midgut</subject><subject>Phylogeny</subject><subject>Proteins</subject><subject>Salivary gland</subject><subject>Sequence analysis</subject><subject>Single-cell protein</subject><subject>Sterols</subject><issn>1300-6320</issn><issn>2146-3077</issn><fulltext>true</fulltext><rsrctype>article</rsrctype><creationdate>2022</creationdate><recordtype>article</recordtype><sourceid>ABUWG</sourceid><sourceid>AFKRA</sourceid><sourceid>AZQEC</sourceid><sourceid>BENPR</sourceid><sourceid>CCPQU</sourceid><sourceid>DWQXO</sourceid><sourceid>GNUQQ</sourceid><recordid>eNqNj81Kw0AUhQdRMP68glxwnTiZyd9WSqubgqD7cklvmynjTLx3IurCZzcVH8DV4cB3-DhK3ZS6qExb3aVxW-zRU4hSGG1M0XR1bU9UZsqqya1u21OVlVbrvLFGn6sLkYPWTW0am6nvdfTUTx4ZFgMy9onYfWFyMQCGLSw_RiaRY70P6D_FCcQdpIHgeUajz3tkdsTwxDGRC7mBFeP-lUICdxzFcSBPAoL9LIjvDh4oEP8q5Eqd7dALXf_lpbpdLV8Wj_nI8W0iSZtDnHgWy8Z03fynamtr_0f9ANdOWhI</recordid><startdate>20221201</startdate><enddate>20221201</enddate><creator>Aygün, Sümeyye</creator><creator>Düzlü, Önder</creator><creator>Yıldırım, Alparslan</creator><general>Galenos Publishing House</general><scope>3V.</scope><scope>7X7</scope><scope>7XB</scope><scope>88E</scope><scope>8FE</scope><scope>8FH</scope><scope>8FI</scope><scope>8FJ</scope><scope>8FK</scope><scope>ABUWG</scope><scope>AFKRA</scope><scope>AZQEC</scope><scope>BBNVY</scope><scope>BENPR</scope><scope>BHPHI</scope><scope>CCPQU</scope><scope>DWQXO</scope><scope>EDSIH</scope><scope>FYUFA</scope><scope>GHDGH</scope><scope>GNUQQ</scope><scope>HCIFZ</scope><scope>K9.</scope><scope>LK8</scope><scope>M0S</scope><scope>M1P</scope><scope>M7P</scope><scope>PIMPY</scope><scope>PQEST</scope><scope>PQQKQ</scope><scope>PQUKI</scope><scope>PRINS</scope></search><sort><creationdate>20221201</creationdate><title>Molecular Characterization and Expression Analysis of the Sterol-carrier Protein-2 Fragment in Anopheles sacharovi Generations</title><author>Aygün, Sümeyye ; Düzlü, Önder ; Yıldırım, Alparslan</author></sort><facets><frbrtype>5</frbrtype><frbrgroupid>cdi_FETCH-proquest_journals_28814647533</frbrgroupid><rsrctype>articles</rsrctype><prefilter>articles</prefilter><language>tur</language><creationdate>2022</creationdate><topic>Adipose tissue</topic><topic>Anopheles</topic><topic>Anopheles sacharovi</topic><topic>Anopheles stephensi</topic><topic>Developmental stages</topic><topic>Fat body</topic><topic>Midgut</topic><topic>Phylogeny</topic><topic>Proteins</topic><topic>Salivary gland</topic><topic>Sequence analysis</topic><topic>Single-cell protein</topic><topic>Sterols</topic><toplevel>peer_reviewed</toplevel><toplevel>online_resources</toplevel><creatorcontrib>Aygün, Sümeyye</creatorcontrib><creatorcontrib>Düzlü, Önder</creatorcontrib><creatorcontrib>Yıldırım, Alparslan</creatorcontrib><collection>ProQuest Central (Corporate)</collection><collection>Health & Medical Collection</collection><collection>ProQuest Central (purchase pre-March 2016)</collection><collection>Medical Database (Alumni Edition)</collection><collection>ProQuest SciTech Collection</collection><collection>ProQuest Natural Science Collection</collection><collection>Hospital Premium Collection</collection><collection>Hospital Premium Collection (Alumni Edition)</collection><collection>ProQuest Central (Alumni) (purchase pre-March 2016)</collection><collection>ProQuest Central (Alumni Edition)</collection><collection>ProQuest Central UK/Ireland</collection><collection>ProQuest Central Essentials</collection><collection>Biological Science Collection</collection><collection>ProQuest Central</collection><collection>Natural Science Collection</collection><collection>ProQuest One Community College</collection><collection>ProQuest Central Korea</collection><collection>Turkey Database</collection><collection>Health Research Premium Collection</collection><collection>Health Research Premium Collection (Alumni)</collection><collection>ProQuest Central Student</collection><collection>SciTech Premium Collection</collection><collection>ProQuest Health & Medical Complete (Alumni)</collection><collection>ProQuest Biological Science Collection</collection><collection>Health & Medical Collection (Alumni Edition)</collection><collection>Medical Database</collection><collection>Biological Science Database</collection><collection>Publicly Available Content Database</collection><collection>ProQuest One Academic Eastern Edition (DO NOT USE)</collection><collection>ProQuest One Academic</collection><collection>ProQuest One Academic UKI Edition</collection><collection>ProQuest Central China</collection><jtitle>Türkiye parazitolojii dergisi</jtitle></facets><delivery><delcategory>Remote Search Resource</delcategory><fulltext>fulltext</fulltext></delivery><addata><au>Aygün, Sümeyye</au><au>Düzlü, Önder</au><au>Yıldırım, Alparslan</au><format>journal</format><genre>article</genre><ristype>JOUR</ristype><atitle>Molecular Characterization and Expression Analysis of the Sterol-carrier Protein-2 Fragment in Anopheles sacharovi Generations</atitle><jtitle>Türkiye parazitolojii dergisi</jtitle><date>2022-12-01</date><risdate>2022</risdate><volume>46</volume><issue>4</issue><spage>312</spage><epage>321</epage><pages>312-321</pages><issn>1300-6320</issn><eissn>2146-3077</eissn><abstract>Amaç: Bu çalışmada, Anopheles sacharoviá.e sterol taşıyıcı protein-2 (SCP-2) geninin ilk kez moleküler karakterizasyonunun yapılması ve bu proteini kodlayan genin An. sacharovi gelişim dönemleri ve dişi nesillerin tükürük bezi, orta baǧırsak ve yaǧ dokusu gibi farklı dokularında ekspresyon düzeylerinin karşılaştırılması amaçlanmıştır. Yöntemler: Sultan Sazlıǧı yöresinden toplanan ergin dişi A??, sacharovi ve insektaryumda elde edilen gelişim dönemleri çalışma materyalini oluşturmuştur. Morfolojik ve moleküler tür identifikasyonu yapılan An. sacharovi nesilleri ve ergin dişi dokularından total RNA ekstraksiyonunu takiben cDNA izolasyonu gerçekleştirilmiştir. cDNA kalıplarında SCP-2 geninin 216 bp fragmenti optimize edilmiş primerlerle amplifiye edilmiş ve amplikonlar sekanslanmıştır. Sekanslar in-silico analizlerle işlenerek genetik karakterizasyonlan saǧlanmıştır. Bulgular: Sekans analizine alman toplam 14 izolata ait SCP-2 nükleotid sekanslarının 12 sinin %100 benzer olduǧu, birbirine homolog olan diǧer iki izolata ait SCP-2 sekanslannm ise 183. bazda tek nükleotid deǧişimi gösterdiǧi belirlenmiştir. SCP-2 gen bölgesinin 216 bp fragmen tinin 72 amino asit zincirini kodladıǧı tespit edilmiştir. Filogenetik analiz sonucu SCP-2 gen sekanslarının sivrisinek türü ve soyu bazında monofiletik olarak kümelendiǧi, An. sacharovi izolatlarmm Anopheles kümesi içerisinde An. stephensi ve An. funestusTa birlikte alt küme oluşturduǧu görülmüştür. qPCR ekspresyon analizleri sonucunda SCP-2,nin en yüksek ergin erkeklerde ifade olduǧu ve bunu sırasıyla ergin dişi, L4, L3, L2, L1 ve pupa dönemlerinin izlediǧi belirlenmiştir. Ergin dişi dokularında ise SCP-2,nin en yüksek, fatbody'de ifade olduǧu bunu sırasıyla midgut ve tükrük bezinin izlediǧi belirlenmiştir. Sonuç: Bu çalışmada, vektör potansiyeli yüksek olan An. sacharovi için aşı adayı veya hedef ilaç bölgelerinden önemli birisi olan SCP-2 ilk kez karakterize edilmiş ve sivrisineǧin gelişim evreleri ve dokularındaki ekspresyonel farklılıklar ortaya konulmuştur.</abstract><cop>Izmir</cop><pub>Galenos Publishing House</pub><doi>10.4274/tpd.galenos.2022.68553</doi><oa>free_for_read</oa></addata></record> |
fulltext | fulltext |
identifier | ISSN: 1300-6320 |
ispartof | Türkiye parazitolojii dergisi, 2022-12, Vol.46 (4), p.312-321 |
issn | 1300-6320 2146-3077 |
language | tur |
recordid | cdi_proquest_journals_2881464753 |
source | DOAJ Directory of Open Access Journals; EZB-FREE-00999 freely available EZB journals |
subjects | Adipose tissue Anopheles Anopheles sacharovi Anopheles stephensi Developmental stages Fat body Midgut Phylogeny Proteins Salivary gland Sequence analysis Single-cell protein Sterols |
title | Molecular Characterization and Expression Analysis of the Sterol-carrier Protein-2 Fragment in Anopheles sacharovi Generations |
url | https://sfx.bib-bvb.de/sfx_tum?ctx_ver=Z39.88-2004&ctx_enc=info:ofi/enc:UTF-8&ctx_tim=2025-01-22T04%3A22%3A29IST&url_ver=Z39.88-2004&url_ctx_fmt=infofi/fmt:kev:mtx:ctx&rfr_id=info:sid/primo.exlibrisgroup.com:primo3-Article-proquest&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:journal&rft.genre=article&rft.atitle=Molecular%20Characterization%20and%20Expression%20Analysis%20of%20the%20Sterol-carrier%20Protein-2%20Fragment%20in%20Anopheles%20sacharovi%20Generations&rft.jtitle=T%C3%BCrkiye%20parazitolojii%20dergisi&rft.au=Ayg%C3%BCn,%20S%C3%BCmeyye&rft.date=2022-12-01&rft.volume=46&rft.issue=4&rft.spage=312&rft.epage=321&rft.pages=312-321&rft.issn=1300-6320&rft.eissn=2146-3077&rft_id=info:doi/10.4274/tpd.galenos.2022.68553&rft_dat=%3Cproquest%3E2881464753%3C/proquest%3E%3Curl%3E%3C/url%3E&disable_directlink=true&sfx.directlink=off&sfx.report_link=0&rft_id=info:oai/&rft_pqid=2881464753&rft_id=info:pmid/&rfr_iscdi=true |