Molecular Characterization and Expression Analysis of the Sterol-carrier Protein-2 Fragment in Anopheles sacharovi Generations

Amaç: Bu çalışmada, Anopheles sacharoviá.e sterol taşıyıcı protein-2 (SCP-2) geninin ilk kez moleküler karakterizasyonunun yapılması ve bu proteini kodlayan genin An. sacharovi gelişim dönemleri ve dişi nesillerin tükürük bezi, orta baǧırsak ve yaǧ dokusu gibi farklı dokularında ekspresyon düzeyleri...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Türkiye parazitolojii dergisi 2022-12, Vol.46 (4), p.312-321
Hauptverfasser: Aygün, Sümeyye, Düzlü, Önder, Yıldırım, Alparslan
Format: Artikel
Sprache:tur
Schlagworte:
Online-Zugang:Volltext
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
container_end_page 321
container_issue 4
container_start_page 312
container_title Türkiye parazitolojii dergisi
container_volume 46
creator Aygün, Sümeyye
Düzlü, Önder
Yıldırım, Alparslan
description Amaç: Bu çalışmada, Anopheles sacharoviá.e sterol taşıyıcı protein-2 (SCP-2) geninin ilk kez moleküler karakterizasyonunun yapılması ve bu proteini kodlayan genin An. sacharovi gelişim dönemleri ve dişi nesillerin tükürük bezi, orta baǧırsak ve yaǧ dokusu gibi farklı dokularında ekspresyon düzeylerinin karşılaştırılması amaçlanmıştır. Yöntemler: Sultan Sazlıǧı yöresinden toplanan ergin dişi A??, sacharovi ve insektaryumda elde edilen gelişim dönemleri çalışma materyalini oluşturmuştur. Morfolojik ve moleküler tür identifikasyonu yapılan An. sacharovi nesilleri ve ergin dişi dokularından total RNA ekstraksiyonunu takiben cDNA izolasyonu gerçekleştirilmiştir. cDNA kalıplarında SCP-2 geninin 216 bp fragmenti optimize edilmiş primerlerle amplifiye edilmiş ve amplikonlar sekanslanmıştır. Sekanslar in-silico analizlerle işlenerek genetik karakterizasyonlan saǧlanmıştır. Bulgular: Sekans analizine alman toplam 14 izolata ait SCP-2 nükleotid sekanslarının 12 sinin %100 benzer olduǧu, birbirine homolog olan diǧer iki izolata ait SCP-2 sekanslannm ise 183. bazda tek nükleotid deǧişimi gösterdiǧi belirlenmiştir. SCP-2 gen bölgesinin 216 bp fragmen tinin 72 amino asit zincirini kodladıǧı tespit edilmiştir. Filogenetik analiz sonucu SCP-2 gen sekanslarının sivrisinek türü ve soyu bazında monofiletik olarak kümelendiǧi, An. sacharovi izolatlarmm Anopheles kümesi içerisinde An. stephensi ve An. funestusTa birlikte alt küme oluşturduǧu görülmüştür. qPCR ekspresyon analizleri sonucunda SCP-2,nin en yüksek ergin erkeklerde ifade olduǧu ve bunu sırasıyla ergin dişi, L4, L3, L2, L1 ve pupa dönemlerinin izlediǧi belirlenmiştir. Ergin dişi dokularında ise SCP-2,nin en yüksek, fatbody'de ifade olduǧu bunu sırasıyla midgut ve tükrük bezinin izlediǧi belirlenmiştir. Sonuç: Bu çalışmada, vektör potansiyeli yüksek olan An. sacharovi için aşı adayı veya hedef ilaç bölgelerinden önemli birisi olan SCP-2 ilk kez karakterize edilmiş ve sivrisineǧin gelişim evreleri ve dokularındaki ekspresyonel farklılıklar ortaya konulmuştur.
doi_str_mv 10.4274/tpd.galenos.2022.68553
format Article
fullrecord <record><control><sourceid>proquest</sourceid><recordid>TN_cdi_proquest_journals_2881464753</recordid><sourceformat>XML</sourceformat><sourcesystem>PC</sourcesystem><sourcerecordid>2881464753</sourcerecordid><originalsourceid>FETCH-proquest_journals_28814647533</originalsourceid><addsrcrecordid>eNqNj81Kw0AUhQdRMP68glxwnTiZyd9WSqubgqD7cklvmynjTLx3IurCZzcVH8DV4cB3-DhK3ZS6qExb3aVxW-zRU4hSGG1M0XR1bU9UZsqqya1u21OVlVbrvLFGn6sLkYPWTW0am6nvdfTUTx4ZFgMy9onYfWFyMQCGLSw_RiaRY70P6D_FCcQdpIHgeUajz3tkdsTwxDGRC7mBFeP-lUICdxzFcSBPAoL9LIjvDh4oEP8q5Eqd7dALXf_lpbpdLV8Wj_nI8W0iSZtDnHgWy8Z03fynamtr_0f9ANdOWhI</addsrcrecordid><sourcetype>Aggregation Database</sourcetype><iscdi>true</iscdi><recordtype>article</recordtype><pqid>2881464753</pqid></control><display><type>article</type><title>Molecular Characterization and Expression Analysis of the Sterol-carrier Protein-2 Fragment in Anopheles sacharovi Generations</title><source>DOAJ Directory of Open Access Journals</source><source>EZB-FREE-00999 freely available EZB journals</source><creator>Aygün, Sümeyye ; Düzlü, Önder ; Yıldırım, Alparslan</creator><creatorcontrib>Aygün, Sümeyye ; Düzlü, Önder ; Yıldırım, Alparslan</creatorcontrib><description>Amaç: Bu çalışmada, Anopheles sacharoviá.e sterol taşıyıcı protein-2 (SCP-2) geninin ilk kez moleküler karakterizasyonunun yapılması ve bu proteini kodlayan genin An. sacharovi gelişim dönemleri ve dişi nesillerin tükürük bezi, orta baǧırsak ve yaǧ dokusu gibi farklı dokularında ekspresyon düzeylerinin karşılaştırılması amaçlanmıştır. Yöntemler: Sultan Sazlıǧı yöresinden toplanan ergin dişi A??, sacharovi ve insektaryumda elde edilen gelişim dönemleri çalışma materyalini oluşturmuştur. Morfolojik ve moleküler tür identifikasyonu yapılan An. sacharovi nesilleri ve ergin dişi dokularından total RNA ekstraksiyonunu takiben cDNA izolasyonu gerçekleştirilmiştir. cDNA kalıplarında SCP-2 geninin 216 bp fragmenti optimize edilmiş primerlerle amplifiye edilmiş ve amplikonlar sekanslanmıştır. Sekanslar in-silico analizlerle işlenerek genetik karakterizasyonlan saǧlanmıştır. Bulgular: Sekans analizine alman toplam 14 izolata ait SCP-2 nükleotid sekanslarının 12 sinin %100 benzer olduǧu, birbirine homolog olan diǧer iki izolata ait SCP-2 sekanslannm ise 183. bazda tek nükleotid deǧişimi gösterdiǧi belirlenmiştir. SCP-2 gen bölgesinin 216 bp fragmen tinin 72 amino asit zincirini kodladıǧı tespit edilmiştir. Filogenetik analiz sonucu SCP-2 gen sekanslarının sivrisinek türü ve soyu bazında monofiletik olarak kümelendiǧi, An. sacharovi izolatlarmm Anopheles kümesi içerisinde An. stephensi ve An. funestusTa birlikte alt küme oluşturduǧu görülmüştür. qPCR ekspresyon analizleri sonucunda SCP-2,nin en yüksek ergin erkeklerde ifade olduǧu ve bunu sırasıyla ergin dişi, L4, L3, L2, L1 ve pupa dönemlerinin izlediǧi belirlenmiştir. Ergin dişi dokularında ise SCP-2,nin en yüksek, fatbody'de ifade olduǧu bunu sırasıyla midgut ve tükrük bezinin izlediǧi belirlenmiştir. Sonuç: Bu çalışmada, vektör potansiyeli yüksek olan An. sacharovi için aşı adayı veya hedef ilaç bölgelerinden önemli birisi olan SCP-2 ilk kez karakterize edilmiş ve sivrisineǧin gelişim evreleri ve dokularındaki ekspresyonel farklılıklar ortaya konulmuştur.</description><identifier>ISSN: 1300-6320</identifier><identifier>EISSN: 2146-3077</identifier><identifier>DOI: 10.4274/tpd.galenos.2022.68553</identifier><language>tur</language><publisher>Izmir: Galenos Publishing House</publisher><subject>Adipose tissue ; Anopheles ; Anopheles sacharovi ; Anopheles stephensi ; Developmental stages ; Fat body ; Midgut ; Phylogeny ; Proteins ; Salivary gland ; Sequence analysis ; Single-cell protein ; Sterols</subject><ispartof>Türkiye parazitolojii dergisi, 2022-12, Vol.46 (4), p.312-321</ispartof><rights>Copyright Galenos Publishing House Dec 2022</rights><lds50>peer_reviewed</lds50><oa>free_for_read</oa><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Tsyndetics_thumb_exl</thumbnail><link.rule.ids>314,776,780,860,27903,27904</link.rule.ids></links><search><creatorcontrib>Aygün, Sümeyye</creatorcontrib><creatorcontrib>Düzlü, Önder</creatorcontrib><creatorcontrib>Yıldırım, Alparslan</creatorcontrib><title>Molecular Characterization and Expression Analysis of the Sterol-carrier Protein-2 Fragment in Anopheles sacharovi Generations</title><title>Türkiye parazitolojii dergisi</title><description>Amaç: Bu çalışmada, Anopheles sacharoviá.e sterol taşıyıcı protein-2 (SCP-2) geninin ilk kez moleküler karakterizasyonunun yapılması ve bu proteini kodlayan genin An. sacharovi gelişim dönemleri ve dişi nesillerin tükürük bezi, orta baǧırsak ve yaǧ dokusu gibi farklı dokularında ekspresyon düzeylerinin karşılaştırılması amaçlanmıştır. Yöntemler: Sultan Sazlıǧı yöresinden toplanan ergin dişi A??, sacharovi ve insektaryumda elde edilen gelişim dönemleri çalışma materyalini oluşturmuştur. Morfolojik ve moleküler tür identifikasyonu yapılan An. sacharovi nesilleri ve ergin dişi dokularından total RNA ekstraksiyonunu takiben cDNA izolasyonu gerçekleştirilmiştir. cDNA kalıplarında SCP-2 geninin 216 bp fragmenti optimize edilmiş primerlerle amplifiye edilmiş ve amplikonlar sekanslanmıştır. Sekanslar in-silico analizlerle işlenerek genetik karakterizasyonlan saǧlanmıştır. Bulgular: Sekans analizine alman toplam 14 izolata ait SCP-2 nükleotid sekanslarının 12 sinin %100 benzer olduǧu, birbirine homolog olan diǧer iki izolata ait SCP-2 sekanslannm ise 183. bazda tek nükleotid deǧişimi gösterdiǧi belirlenmiştir. SCP-2 gen bölgesinin 216 bp fragmen tinin 72 amino asit zincirini kodladıǧı tespit edilmiştir. Filogenetik analiz sonucu SCP-2 gen sekanslarının sivrisinek türü ve soyu bazında monofiletik olarak kümelendiǧi, An. sacharovi izolatlarmm Anopheles kümesi içerisinde An. stephensi ve An. funestusTa birlikte alt küme oluşturduǧu görülmüştür. qPCR ekspresyon analizleri sonucunda SCP-2,nin en yüksek ergin erkeklerde ifade olduǧu ve bunu sırasıyla ergin dişi, L4, L3, L2, L1 ve pupa dönemlerinin izlediǧi belirlenmiştir. Ergin dişi dokularında ise SCP-2,nin en yüksek, fatbody'de ifade olduǧu bunu sırasıyla midgut ve tükrük bezinin izlediǧi belirlenmiştir. Sonuç: Bu çalışmada, vektör potansiyeli yüksek olan An. sacharovi için aşı adayı veya hedef ilaç bölgelerinden önemli birisi olan SCP-2 ilk kez karakterize edilmiş ve sivrisineǧin gelişim evreleri ve dokularındaki ekspresyonel farklılıklar ortaya konulmuştur.</description><subject>Adipose tissue</subject><subject>Anopheles</subject><subject>Anopheles sacharovi</subject><subject>Anopheles stephensi</subject><subject>Developmental stages</subject><subject>Fat body</subject><subject>Midgut</subject><subject>Phylogeny</subject><subject>Proteins</subject><subject>Salivary gland</subject><subject>Sequence analysis</subject><subject>Single-cell protein</subject><subject>Sterols</subject><issn>1300-6320</issn><issn>2146-3077</issn><fulltext>true</fulltext><rsrctype>article</rsrctype><creationdate>2022</creationdate><recordtype>article</recordtype><sourceid>ABUWG</sourceid><sourceid>AFKRA</sourceid><sourceid>AZQEC</sourceid><sourceid>BENPR</sourceid><sourceid>CCPQU</sourceid><sourceid>DWQXO</sourceid><sourceid>GNUQQ</sourceid><recordid>eNqNj81Kw0AUhQdRMP68glxwnTiZyd9WSqubgqD7cklvmynjTLx3IurCZzcVH8DV4cB3-DhK3ZS6qExb3aVxW-zRU4hSGG1M0XR1bU9UZsqqya1u21OVlVbrvLFGn6sLkYPWTW0am6nvdfTUTx4ZFgMy9onYfWFyMQCGLSw_RiaRY70P6D_FCcQdpIHgeUajz3tkdsTwxDGRC7mBFeP-lUICdxzFcSBPAoL9LIjvDh4oEP8q5Eqd7dALXf_lpbpdLV8Wj_nI8W0iSZtDnHgWy8Z03fynamtr_0f9ANdOWhI</recordid><startdate>20221201</startdate><enddate>20221201</enddate><creator>Aygün, Sümeyye</creator><creator>Düzlü, Önder</creator><creator>Yıldırım, Alparslan</creator><general>Galenos Publishing House</general><scope>3V.</scope><scope>7X7</scope><scope>7XB</scope><scope>88E</scope><scope>8FE</scope><scope>8FH</scope><scope>8FI</scope><scope>8FJ</scope><scope>8FK</scope><scope>ABUWG</scope><scope>AFKRA</scope><scope>AZQEC</scope><scope>BBNVY</scope><scope>BENPR</scope><scope>BHPHI</scope><scope>CCPQU</scope><scope>DWQXO</scope><scope>EDSIH</scope><scope>FYUFA</scope><scope>GHDGH</scope><scope>GNUQQ</scope><scope>HCIFZ</scope><scope>K9.</scope><scope>LK8</scope><scope>M0S</scope><scope>M1P</scope><scope>M7P</scope><scope>PIMPY</scope><scope>PQEST</scope><scope>PQQKQ</scope><scope>PQUKI</scope><scope>PRINS</scope></search><sort><creationdate>20221201</creationdate><title>Molecular Characterization and Expression Analysis of the Sterol-carrier Protein-2 Fragment in Anopheles sacharovi Generations</title><author>Aygün, Sümeyye ; Düzlü, Önder ; Yıldırım, Alparslan</author></sort><facets><frbrtype>5</frbrtype><frbrgroupid>cdi_FETCH-proquest_journals_28814647533</frbrgroupid><rsrctype>articles</rsrctype><prefilter>articles</prefilter><language>tur</language><creationdate>2022</creationdate><topic>Adipose tissue</topic><topic>Anopheles</topic><topic>Anopheles sacharovi</topic><topic>Anopheles stephensi</topic><topic>Developmental stages</topic><topic>Fat body</topic><topic>Midgut</topic><topic>Phylogeny</topic><topic>Proteins</topic><topic>Salivary gland</topic><topic>Sequence analysis</topic><topic>Single-cell protein</topic><topic>Sterols</topic><toplevel>peer_reviewed</toplevel><toplevel>online_resources</toplevel><creatorcontrib>Aygün, Sümeyye</creatorcontrib><creatorcontrib>Düzlü, Önder</creatorcontrib><creatorcontrib>Yıldırım, Alparslan</creatorcontrib><collection>ProQuest Central (Corporate)</collection><collection>Health &amp; Medical Collection</collection><collection>ProQuest Central (purchase pre-March 2016)</collection><collection>Medical Database (Alumni Edition)</collection><collection>ProQuest SciTech Collection</collection><collection>ProQuest Natural Science Collection</collection><collection>Hospital Premium Collection</collection><collection>Hospital Premium Collection (Alumni Edition)</collection><collection>ProQuest Central (Alumni) (purchase pre-March 2016)</collection><collection>ProQuest Central (Alumni Edition)</collection><collection>ProQuest Central UK/Ireland</collection><collection>ProQuest Central Essentials</collection><collection>Biological Science Collection</collection><collection>ProQuest Central</collection><collection>Natural Science Collection</collection><collection>ProQuest One Community College</collection><collection>ProQuest Central Korea</collection><collection>Turkey Database</collection><collection>Health Research Premium Collection</collection><collection>Health Research Premium Collection (Alumni)</collection><collection>ProQuest Central Student</collection><collection>SciTech Premium Collection</collection><collection>ProQuest Health &amp; Medical Complete (Alumni)</collection><collection>ProQuest Biological Science Collection</collection><collection>Health &amp; Medical Collection (Alumni Edition)</collection><collection>Medical Database</collection><collection>Biological Science Database</collection><collection>Publicly Available Content Database</collection><collection>ProQuest One Academic Eastern Edition (DO NOT USE)</collection><collection>ProQuest One Academic</collection><collection>ProQuest One Academic UKI Edition</collection><collection>ProQuest Central China</collection><jtitle>Türkiye parazitolojii dergisi</jtitle></facets><delivery><delcategory>Remote Search Resource</delcategory><fulltext>fulltext</fulltext></delivery><addata><au>Aygün, Sümeyye</au><au>Düzlü, Önder</au><au>Yıldırım, Alparslan</au><format>journal</format><genre>article</genre><ristype>JOUR</ristype><atitle>Molecular Characterization and Expression Analysis of the Sterol-carrier Protein-2 Fragment in Anopheles sacharovi Generations</atitle><jtitle>Türkiye parazitolojii dergisi</jtitle><date>2022-12-01</date><risdate>2022</risdate><volume>46</volume><issue>4</issue><spage>312</spage><epage>321</epage><pages>312-321</pages><issn>1300-6320</issn><eissn>2146-3077</eissn><abstract>Amaç: Bu çalışmada, Anopheles sacharoviá.e sterol taşıyıcı protein-2 (SCP-2) geninin ilk kez moleküler karakterizasyonunun yapılması ve bu proteini kodlayan genin An. sacharovi gelişim dönemleri ve dişi nesillerin tükürük bezi, orta baǧırsak ve yaǧ dokusu gibi farklı dokularında ekspresyon düzeylerinin karşılaştırılması amaçlanmıştır. Yöntemler: Sultan Sazlıǧı yöresinden toplanan ergin dişi A??, sacharovi ve insektaryumda elde edilen gelişim dönemleri çalışma materyalini oluşturmuştur. Morfolojik ve moleküler tür identifikasyonu yapılan An. sacharovi nesilleri ve ergin dişi dokularından total RNA ekstraksiyonunu takiben cDNA izolasyonu gerçekleştirilmiştir. cDNA kalıplarında SCP-2 geninin 216 bp fragmenti optimize edilmiş primerlerle amplifiye edilmiş ve amplikonlar sekanslanmıştır. Sekanslar in-silico analizlerle işlenerek genetik karakterizasyonlan saǧlanmıştır. Bulgular: Sekans analizine alman toplam 14 izolata ait SCP-2 nükleotid sekanslarının 12 sinin %100 benzer olduǧu, birbirine homolog olan diǧer iki izolata ait SCP-2 sekanslannm ise 183. bazda tek nükleotid deǧişimi gösterdiǧi belirlenmiştir. SCP-2 gen bölgesinin 216 bp fragmen tinin 72 amino asit zincirini kodladıǧı tespit edilmiştir. Filogenetik analiz sonucu SCP-2 gen sekanslarının sivrisinek türü ve soyu bazında monofiletik olarak kümelendiǧi, An. sacharovi izolatlarmm Anopheles kümesi içerisinde An. stephensi ve An. funestusTa birlikte alt küme oluşturduǧu görülmüştür. qPCR ekspresyon analizleri sonucunda SCP-2,nin en yüksek ergin erkeklerde ifade olduǧu ve bunu sırasıyla ergin dişi, L4, L3, L2, L1 ve pupa dönemlerinin izlediǧi belirlenmiştir. Ergin dişi dokularında ise SCP-2,nin en yüksek, fatbody'de ifade olduǧu bunu sırasıyla midgut ve tükrük bezinin izlediǧi belirlenmiştir. Sonuç: Bu çalışmada, vektör potansiyeli yüksek olan An. sacharovi için aşı adayı veya hedef ilaç bölgelerinden önemli birisi olan SCP-2 ilk kez karakterize edilmiş ve sivrisineǧin gelişim evreleri ve dokularındaki ekspresyonel farklılıklar ortaya konulmuştur.</abstract><cop>Izmir</cop><pub>Galenos Publishing House</pub><doi>10.4274/tpd.galenos.2022.68553</doi><oa>free_for_read</oa></addata></record>
fulltext fulltext
identifier ISSN: 1300-6320
ispartof Türkiye parazitolojii dergisi, 2022-12, Vol.46 (4), p.312-321
issn 1300-6320
2146-3077
language tur
recordid cdi_proquest_journals_2881464753
source DOAJ Directory of Open Access Journals; EZB-FREE-00999 freely available EZB journals
subjects Adipose tissue
Anopheles
Anopheles sacharovi
Anopheles stephensi
Developmental stages
Fat body
Midgut
Phylogeny
Proteins
Salivary gland
Sequence analysis
Single-cell protein
Sterols
title Molecular Characterization and Expression Analysis of the Sterol-carrier Protein-2 Fragment in Anopheles sacharovi Generations
url https://sfx.bib-bvb.de/sfx_tum?ctx_ver=Z39.88-2004&ctx_enc=info:ofi/enc:UTF-8&ctx_tim=2025-01-22T04%3A22%3A29IST&url_ver=Z39.88-2004&url_ctx_fmt=infofi/fmt:kev:mtx:ctx&rfr_id=info:sid/primo.exlibrisgroup.com:primo3-Article-proquest&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:journal&rft.genre=article&rft.atitle=Molecular%20Characterization%20and%20Expression%20Analysis%20of%20the%20Sterol-carrier%20Protein-2%20Fragment%20in%20Anopheles%20sacharovi%20Generations&rft.jtitle=T%C3%BCrkiye%20parazitolojii%20dergisi&rft.au=Ayg%C3%BCn,%20S%C3%BCmeyye&rft.date=2022-12-01&rft.volume=46&rft.issue=4&rft.spage=312&rft.epage=321&rft.pages=312-321&rft.issn=1300-6320&rft.eissn=2146-3077&rft_id=info:doi/10.4274/tpd.galenos.2022.68553&rft_dat=%3Cproquest%3E2881464753%3C/proquest%3E%3Curl%3E%3C/url%3E&disable_directlink=true&sfx.directlink=off&sfx.report_link=0&rft_id=info:oai/&rft_pqid=2881464753&rft_id=info:pmid/&rfr_iscdi=true