Assessing the status of leopard in the Cape Fold Mountains using a Bayesian spatial capture–recapture model in Just Another Gibbs Sampler

Large carnivores are in decline globally. The leopard's (Panthera pardus) adaptability enabled its survival as the last remaining apex predator in the Western Cape, South Africa. Limited suitable habitat and anthropogenic activity imperil the continued survival of leopards, yet density estimate...

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Veröffentlicht in:African journal of ecology 2022-09, Vol.60 (3), p.299-307
Hauptverfasser: Amin, Rajan, Wilkinson, Anita, Williams, Kathryn S., Martins, Quinton E., Hayward, Jeannie
Format: Artikel
Sprache:eng
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container_title African journal of ecology
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creator Amin, Rajan
Wilkinson, Anita
Williams, Kathryn S.
Martins, Quinton E.
Hayward, Jeannie
description Large carnivores are in decline globally. The leopard's (Panthera pardus) adaptability enabled its survival as the last remaining apex predator in the Western Cape, South Africa. Limited suitable habitat and anthropogenic activity imperil the continued survival of leopards, yet density estimates are lacking in the Western Cape, especially across unprotected areas. We employ the flexible modelling environment of Just Another Gibbs Sampler (JAGS) to implement a Bayesian spatial capture–recapture (SCR) model and generate the first density estimate for the leopard population in the Boland Mountain Complex using a dataset collected in 2010–2011. Leopard density was estimated at 1.69/100 km2 (95% CI = 1.4–1.99) with adult female leopards occurring at a higher density (0.93/100 km2 [95% CI = 0.64–1.18]) than males (0.76/100 km2 [95% CI = 0.62–0.90]). Our modelling shows that males have more extensive ranges than females, increasing their susceptibility to anthropogenic threats, which are generally more abundant at the study area's periphery. Tailored conservation efforts are recommended in conjunction with an up‐to‐date leopard population density reassessment. The JAGS approach to SCR also enabled a detailed investigation of animal distribution and movement, and provides a reliable methodology to monitor population trends. Résumé Les grands carnivores sont en déclin à l’échelle mondiale. L’adaptabilité du léopard (Panthera pardus) lui a permis de survivre en tant que dernier superprédateur du Cap‐Occidental, en Afrique du Sud. Un habitat convenable limité et l’activité anthropique menacent la survie des léopards, mais les estimations de leur densité au Cap‐Occidental font défaut, particulièrement dans les zones non protégées. Nous utilisons l’environnement de modélisation flexible du programme Just another Gibbs sampler (JAGS) pour mettre en œuvre un modèle bayésien de capture‐recapture spatiale (SCR) et générer la première estimation de la densité de la population de léopards dans le complexe montagneux de Boland, à l’aide d’un ensemble de données collectées entre 2010 et 2011. La densité des léopards a été estimée à 1,69/100 km2 (IC à 95 % = 1,4 à 1,99), la densité des léopards femelles adultes étant plus élevée (0,93/100 km2 [IC à 95 % = 0,64 à 1,18]) que celle des léopards mâles (0,76/100 km2 [IC à 95 % = 0,62 à 0,90]). Notre modélisation montre que les aires de répartition des mâles sont plus étendues que celles des femelles, ce qui augmente leur vulnérabili
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The leopard's (Panthera pardus) adaptability enabled its survival as the last remaining apex predator in the Western Cape, South Africa. Limited suitable habitat and anthropogenic activity imperil the continued survival of leopards, yet density estimates are lacking in the Western Cape, especially across unprotected areas. We employ the flexible modelling environment of Just Another Gibbs Sampler (JAGS) to implement a Bayesian spatial capture–recapture (SCR) model and generate the first density estimate for the leopard population in the Boland Mountain Complex using a dataset collected in 2010–2011. Leopard density was estimated at 1.69/100 km2 (95% CI = 1.4–1.99) with adult female leopards occurring at a higher density (0.93/100 km2 [95% CI = 0.64–1.18]) than males (0.76/100 km2 [95% CI = 0.62–0.90]). Our modelling shows that males have more extensive ranges than females, increasing their susceptibility to anthropogenic threats, which are generally more abundant at the study area's periphery. Tailored conservation efforts are recommended in conjunction with an up‐to‐date leopard population density reassessment. The JAGS approach to SCR also enabled a detailed investigation of animal distribution and movement, and provides a reliable methodology to monitor population trends. Résumé Les grands carnivores sont en déclin à l’échelle mondiale. L’adaptabilité du léopard (Panthera pardus) lui a permis de survivre en tant que dernier superprédateur du Cap‐Occidental, en Afrique du Sud. Un habitat convenable limité et l’activité anthropique menacent la survie des léopards, mais les estimations de leur densité au Cap‐Occidental font défaut, particulièrement dans les zones non protégées. Nous utilisons l’environnement de modélisation flexible du programme Just another Gibbs sampler (JAGS) pour mettre en œuvre un modèle bayésien de capture‐recapture spatiale (SCR) et générer la première estimation de la densité de la population de léopards dans le complexe montagneux de Boland, à l’aide d’un ensemble de données collectées entre 2010 et 2011. La densité des léopards a été estimée à 1,69/100 km2 (IC à 95 % = 1,4 à 1,99), la densité des léopards femelles adultes étant plus élevée (0,93/100 km2 [IC à 95 % = 0,64 à 1,18]) que celle des léopards mâles (0,76/100 km2 [IC à 95 % = 0,62 à 0,90]). Notre modélisation montre que les aires de répartition des mâles sont plus étendues que celles des femelles, ce qui augmente leur vulnérabilité aux menaces anthropiques, qui sont généralement plus abondantes en périphérie de la zone d’étude. Des efforts de conservation adaptés sont recommandés, en conjonction avec une réévaluation à jour de la densité des populations de léopards. L’approche JAGS utilisée pour la mise en œuvre du RCS a également permis une étude détaillée de la répartition et des déplacements des animaux et fournit une méthodologie fiable pour surveiller les tendances des populations.</description><identifier>ISSN: 0141-6707</identifier><identifier>EISSN: 1365-2028</identifier><identifier>DOI: 10.1111/aje.12944</identifier><language>eng</language><publisher>Nairobi: Blackwell Publishing Ltd</publisher><subject>Adaptability ; Anthropogenic factors ; Bayesian analysis ; Bayesian spatial capture‐recapture ; Capture-recapture studies ; Carnivores ; Conservation ; Environment models ; Females ; JAGS ; leopard ; Males ; Mountains ; Panthera pardus ; Population ; Population density ; Survival</subject><ispartof>African journal of ecology, 2022-09, Vol.60 (3), p.299-307</ispartof><rights>2022 John Wiley &amp; Sons Ltd</rights><rights>Copyright © 2022 John Wiley &amp; Sons Ltd</rights><lds50>peer_reviewed</lds50><oa>free_for_read</oa><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed><citedby>FETCH-LOGICAL-c3324-c76866321119e360be60a5bc4654a6305ff0ff97b50c0b19408da1bf36d37e963</citedby><cites>FETCH-LOGICAL-c3324-c76866321119e360be60a5bc4654a6305ff0ff97b50c0b19408da1bf36d37e963</cites><orcidid>0000-0003-0797-3836 ; 0000-0001-7003-9371 ; 0000-0002-2752-3667 ; 0000-0001-7502-8970 ; 0000-0002-6890-2196</orcidid></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Tsyndetics_thumb_exl</thumbnail><linktopdf>$$Uhttps://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1111%2Faje.12944$$EPDF$$P50$$Gwiley$$H</linktopdf><linktohtml>$$Uhttps://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111%2Faje.12944$$EHTML$$P50$$Gwiley$$H</linktohtml><link.rule.ids>314,776,780,1411,27901,27902,45550,45551</link.rule.ids></links><search><creatorcontrib>Amin, Rajan</creatorcontrib><creatorcontrib>Wilkinson, Anita</creatorcontrib><creatorcontrib>Williams, Kathryn S.</creatorcontrib><creatorcontrib>Martins, Quinton E.</creatorcontrib><creatorcontrib>Hayward, Jeannie</creatorcontrib><title>Assessing the status of leopard in the Cape Fold Mountains using a Bayesian spatial capture–recapture model in Just Another Gibbs Sampler</title><title>African journal of ecology</title><description>Large carnivores are in decline globally. 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Nous utilisons l’environnement de modélisation flexible du programme Just another Gibbs sampler (JAGS) pour mettre en œuvre un modèle bayésien de capture‐recapture spatiale (SCR) et générer la première estimation de la densité de la population de léopards dans le complexe montagneux de Boland, à l’aide d’un ensemble de données collectées entre 2010 et 2011. La densité des léopards a été estimée à 1,69/100 km2 (IC à 95 % = 1,4 à 1,99), la densité des léopards femelles adultes étant plus élevée (0,93/100 km2 [IC à 95 % = 0,64 à 1,18]) que celle des léopards mâles (0,76/100 km2 [IC à 95 % = 0,62 à 0,90]). Notre modélisation montre que les aires de répartition des mâles sont plus étendues que celles des femelles, ce qui augmente leur vulnérabilité aux menaces anthropiques, qui sont généralement plus abondantes en périphérie de la zone d’étude. Des efforts de conservation adaptés sont recommandés, en conjonction avec une réévaluation à jour de la densité des populations de léopards. 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