GENOME ANALYSIS OF Pseudomonas brassicacearum S-1 - AN ANTAGONIST OF CROP PATHOGENS

Вступ. Штам Pseudomonas brassicacearum S-1 е основою бмпрепарату «Екогрш», який застосовують для захисту вщ naToreHİB овочевих та зеленних культур в умовах малооб'емно! но! гiдpoпoнiки. Метою роботи було секвенування та анал^ нуклеотидно! пoслiдoвнoстi геному бактеpiй P. brassicacearum S-1 (код доступу в базi даних ГенБанк CP045701). Методи. Повногеномне секвенування проводили за допомогою приладив MiSeq (Шитта) та MinION (Oxford Nanopore), для аналiзу послiдoвнoстi геному було використано низку 6İoiнфopматичних програм. Результати. Геном штаму P. brassicacearum S-1 складаеться з одше! кiльцевoī хромосоми розмфом 6 577 561 пар основ зi вмiстoм ГЦ-пар 60,8%. Анал^ геному дав змогу виявити гени, яш визначають синтез широкого спектру вторинних метабoлiтiв, що становлять б^технолoгiчний лoгiчний пoтенцiал штаму S-1. Крш того, було визначено локал^ащю мoбiльних генетичних елементiв, пpoфагiв İ коротких повторюваних пoслiдoвнoстей у межах геному штаму S-1. Висновки. Виявленi генетичнi детермiнанти синтезу практично значущих сполук вказують на значний потенщал штаму P. brassicacearum S-1 як агента бмконтролю.