Компьютерное моделирование иммунореактивной конформации иммунодоминантного эпитопа HIV-RF

С помощью предложенного ранее расчетно-теоретического метода построена модель простран­ственной структуры иммунодоминантного эпитопа (ИДЭ) HIV-RF, согласующаяся с данными спектроскопии ЯМР. Установлено, что главный иммуногенный участок вируса образует в водном растворе доминирующую структуру, в кото...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Biopolimery i kletka 2005-01, Vol.21 (2), p.165
Hauptverfasser: Андрианов, А М, Соколов, Ю А
Format: Artikel
Sprache:rus
Schlagworte:
Online-Zugang:Volltext
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
container_end_page
container_issue 2
container_start_page 165
container_title Biopolimery i kletka
container_volume 21
creator Андрианов, А М
Соколов, Ю А
description С помощью предложенного ранее расчетно-теоретического метода построена модель простран­ственной структуры иммунодоминантного эпитопа (ИДЭ) HIV-RF, согласующаяся с данными спектроскопии ЯМР. Установлено, что главный иммуногенный участок вируса образует в водном растворе доминирующую структуру, в которой инверсный γ-изгиб на участке Gly-Pro-Gly преобразуется в нестандартный β-поворот IV (Gly-Arg-Val-Ile). Показано, что лучшая по энергии конформация ИДЭ HIV-RF подобна структуре, обнаруженной в кристалле в комплексе пептидного антигена с Fab-фрагментом антитела 58.2. На основе сравнительного анализа трехмерных структур ИДЭ в вирионах HIV-RF, HIV-Thailand и HIV-MN сделан вывод о том, что исследуемый участок белка gp120 формирует в трех субтипах вируса подобные пространственные формы основной цепи, реализующиеся из разных локальных минимумов входящих в его состав аминокис­лотных остатков.
doi_str_mv 10.7124/bc.0006E8
format Article
fullrecord <record><control><sourceid>proquest</sourceid><recordid>TN_cdi_proquest_journals_2306552825</recordid><sourceformat>XML</sourceformat><sourcesystem>PC</sourcesystem><sourcerecordid>2306552825</sourcerecordid><originalsourceid>FETCH-proquest_journals_23065528253</originalsourceid><addsrcrecordid>eNqNjT1Ow0AUhFcIJAyh4AaWqB3Wu_5LjRKFFiHaCFBSRIhATHoUEBVwAA5AbQGWluDYV5i9EbMRDV2q9958M_OE2A9lOw1VdHhx2ZZSJt1sQ3hhp6ODJIvUpvCk0jpIkzjdFjt5PqYlypTyxDveUKNCY5_tq52jtPdYUil9ijW-UOIHhmKNDxRExiFDWNkH5yQqCRbMGlpc9tvHgmNpH1e4QmGfCM2_HKvdX8OdtUw77RO1b1_Q8OOcZ4PC7x-fBSe9ltganV_lw72_uSsOet3To35wM53czob53WA8mU2viQZKyySOVaZivZ7rF-ibnD8</addsrcrecordid><sourcetype>Aggregation Database</sourcetype><iscdi>true</iscdi><recordtype>article</recordtype><pqid>2306552825</pqid></control><display><type>article</type><title>Компьютерное моделирование иммунореактивной конформации иммунодоминантного эпитопа HIV-RF</title><source>EZB-FREE-00999 freely available EZB journals</source><creator>Андрианов, А М ; Соколов, Ю А</creator><creatorcontrib>Андрианов, А М ; Соколов, Ю А</creatorcontrib><description>С помощью предложенного ранее расчетно-теоретического метода построена модель простран­ственной структуры иммунодоминантного эпитопа (ИДЭ) HIV-RF, согласующаяся с данными спектроскопии ЯМР. Установлено, что главный иммуногенный участок вируса образует в водном растворе доминирующую структуру, в которой инверсный γ-изгиб на участке Gly-Pro-Gly преобразуется в нестандартный β-поворот IV (Gly-Arg-Val-Ile). Показано, что лучшая по энергии конформация ИДЭ HIV-RF подобна структуре, обнаруженной в кристалле в комплексе пептидного антигена с Fab-фрагментом антитела 58.2. На основе сравнительного анализа трехмерных структур ИДЭ в вирионах HIV-RF, HIV-Thailand и HIV-MN сделан вывод о том, что исследуемый участок белка gp120 формирует в трех субтипах вируса подобные пространственные формы основной цепи, реализующиеся из разных локальных минимумов входящих в его состав аминокис­лотных остатков.</description><identifier>ISSN: 0233-7657</identifier><identifier>EISSN: 1993-6842</identifier><identifier>DOI: 10.7124/bc.0006E8</identifier><language>rus</language><publisher>Kiev: Natsional'na Akademiya Nauk Ukrainy - National Academy of Sciences of Ukraine</publisher><subject>Glycoprotein gp120 ; HIV ; Human immunodeficiency virus</subject><ispartof>Biopolimery i kletka, 2005-01, Vol.21 (2), p.165</ispartof><rights>2005. This work is published under http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ (the “License”). Notwithstanding the ProQuest Terms and Conditions, you may use this content in accordance with the terms of the License.</rights><lds50>peer_reviewed</lds50><oa>free_for_read</oa><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Tsyndetics_thumb_exl</thumbnail><link.rule.ids>314,780,784,27924,27925</link.rule.ids></links><search><creatorcontrib>Андрианов, А М</creatorcontrib><creatorcontrib>Соколов, Ю А</creatorcontrib><title>Компьютерное моделирование иммунореактивной конформации иммунодоминантного эпитопа HIV-RF</title><title>Biopolimery i kletka</title><description>С помощью предложенного ранее расчетно-теоретического метода построена модель простран­ственной структуры иммунодоминантного эпитопа (ИДЭ) HIV-RF, согласующаяся с данными спектроскопии ЯМР. Установлено, что главный иммуногенный участок вируса образует в водном растворе доминирующую структуру, в которой инверсный γ-изгиб на участке Gly-Pro-Gly преобразуется в нестандартный β-поворот IV (Gly-Arg-Val-Ile). Показано, что лучшая по энергии конформация ИДЭ HIV-RF подобна структуре, обнаруженной в кристалле в комплексе пептидного антигена с Fab-фрагментом антитела 58.2. На основе сравнительного анализа трехмерных структур ИДЭ в вирионах HIV-RF, HIV-Thailand и HIV-MN сделан вывод о том, что исследуемый участок белка gp120 формирует в трех субтипах вируса подобные пространственные формы основной цепи, реализующиеся из разных локальных минимумов входящих в его состав аминокис­лотных остатков.</description><subject>Glycoprotein gp120</subject><subject>HIV</subject><subject>Human immunodeficiency virus</subject><issn>0233-7657</issn><issn>1993-6842</issn><fulltext>true</fulltext><rsrctype>article</rsrctype><creationdate>2005</creationdate><recordtype>article</recordtype><sourceid>ABUWG</sourceid><sourceid>AFKRA</sourceid><sourceid>AZQEC</sourceid><sourceid>BENPR</sourceid><sourceid>CCPQU</sourceid><sourceid>DWQXO</sourceid><sourceid>GNUQQ</sourceid><recordid>eNqNjT1Ow0AUhFcIJAyh4AaWqB3Wu_5LjRKFFiHaCFBSRIhATHoUEBVwAA5AbQGWluDYV5i9EbMRDV2q9958M_OE2A9lOw1VdHhx2ZZSJt1sQ3hhp6ODJIvUpvCk0jpIkzjdFjt5PqYlypTyxDveUKNCY5_tq52jtPdYUil9ijW-UOIHhmKNDxRExiFDWNkH5yQqCRbMGlpc9tvHgmNpH1e4QmGfCM2_HKvdX8OdtUw77RO1b1_Q8OOcZ4PC7x-fBSe9ltganV_lw72_uSsOet3To35wM53czob53WA8mU2viQZKyySOVaZivZ7rF-ibnD8</recordid><startdate>20050101</startdate><enddate>20050101</enddate><creator>Андрианов, А М</creator><creator>Соколов, Ю А</creator><general>Natsional'na Akademiya Nauk Ukrainy - National Academy of Sciences of Ukraine</general><scope>3V.</scope><scope>7X7</scope><scope>7XB</scope><scope>8FE</scope><scope>8FH</scope><scope>8FI</scope><scope>8FJ</scope><scope>8FK</scope><scope>ABUWG</scope><scope>AFKRA</scope><scope>AZQEC</scope><scope>BBNVY</scope><scope>BENPR</scope><scope>BHPHI</scope><scope>CCPQU</scope><scope>DWQXO</scope><scope>FYUFA</scope><scope>GHDGH</scope><scope>GNUQQ</scope><scope>HCIFZ</scope><scope>K9.</scope><scope>LK8</scope><scope>M0S</scope><scope>M7P</scope><scope>PIMPY</scope><scope>PQEST</scope><scope>PQQKQ</scope><scope>PQUKI</scope><scope>PRINS</scope></search><sort><creationdate>20050101</creationdate><title>Компьютерное моделирование иммунореактивной конформации иммунодоминантного эпитопа HIV-RF</title><author>Андрианов, А М ; Соколов, Ю А</author></sort><facets><frbrtype>5</frbrtype><frbrgroupid>cdi_FETCH-proquest_journals_23065528253</frbrgroupid><rsrctype>articles</rsrctype><prefilter>articles</prefilter><language>rus</language><creationdate>2005</creationdate><topic>Glycoprotein gp120</topic><topic>HIV</topic><topic>Human immunodeficiency virus</topic><toplevel>peer_reviewed</toplevel><toplevel>online_resources</toplevel><creatorcontrib>Андрианов, А М</creatorcontrib><creatorcontrib>Соколов, Ю А</creatorcontrib><collection>ProQuest Central (Corporate)</collection><collection>Health &amp; Medical Collection</collection><collection>ProQuest Central (purchase pre-March 2016)</collection><collection>ProQuest SciTech Collection</collection><collection>ProQuest Natural Science Collection</collection><collection>Hospital Premium Collection</collection><collection>Hospital Premium Collection (Alumni Edition)</collection><collection>ProQuest Central (Alumni) (purchase pre-March 2016)</collection><collection>ProQuest Central (Alumni Edition)</collection><collection>ProQuest Central UK/Ireland</collection><collection>ProQuest Central Essentials</collection><collection>Biological Science Collection</collection><collection>ProQuest Central</collection><collection>Natural Science Collection</collection><collection>ProQuest One Community College</collection><collection>ProQuest Central Korea</collection><collection>Health Research Premium Collection</collection><collection>Health Research Premium Collection (Alumni)</collection><collection>ProQuest Central Student</collection><collection>SciTech Premium Collection</collection><collection>ProQuest Health &amp; Medical Complete (Alumni)</collection><collection>ProQuest Biological Science Collection</collection><collection>Health &amp; Medical Collection (Alumni Edition)</collection><collection>Biological Science Database</collection><collection>Publicly Available Content Database</collection><collection>ProQuest One Academic Eastern Edition (DO NOT USE)</collection><collection>ProQuest One Academic</collection><collection>ProQuest One Academic UKI Edition</collection><collection>ProQuest Central China</collection><jtitle>Biopolimery i kletka</jtitle></facets><delivery><delcategory>Remote Search Resource</delcategory><fulltext>fulltext</fulltext></delivery><addata><au>Андрианов, А М</au><au>Соколов, Ю А</au><format>journal</format><genre>article</genre><ristype>JOUR</ristype><atitle>Компьютерное моделирование иммунореактивной конформации иммунодоминантного эпитопа HIV-RF</atitle><jtitle>Biopolimery i kletka</jtitle><date>2005-01-01</date><risdate>2005</risdate><volume>21</volume><issue>2</issue><spage>165</spage><pages>165-</pages><issn>0233-7657</issn><eissn>1993-6842</eissn><abstract>С помощью предложенного ранее расчетно-теоретического метода построена модель простран­ственной структуры иммунодоминантного эпитопа (ИДЭ) HIV-RF, согласующаяся с данными спектроскопии ЯМР. Установлено, что главный иммуногенный участок вируса образует в водном растворе доминирующую структуру, в которой инверсный γ-изгиб на участке Gly-Pro-Gly преобразуется в нестандартный β-поворот IV (Gly-Arg-Val-Ile). Показано, что лучшая по энергии конформация ИДЭ HIV-RF подобна структуре, обнаруженной в кристалле в комплексе пептидного антигена с Fab-фрагментом антитела 58.2. На основе сравнительного анализа трехмерных структур ИДЭ в вирионах HIV-RF, HIV-Thailand и HIV-MN сделан вывод о том, что исследуемый участок белка gp120 формирует в трех субтипах вируса подобные пространственные формы основной цепи, реализующиеся из разных локальных минимумов входящих в его состав аминокис­лотных остатков.</abstract><cop>Kiev</cop><pub>Natsional'na Akademiya Nauk Ukrainy - National Academy of Sciences of Ukraine</pub><doi>10.7124/bc.0006E8</doi><oa>free_for_read</oa></addata></record>
fulltext fulltext
identifier ISSN: 0233-7657
ispartof Biopolimery i kletka, 2005-01, Vol.21 (2), p.165
issn 0233-7657
1993-6842
language rus
recordid cdi_proquest_journals_2306552825
source EZB-FREE-00999 freely available EZB journals
subjects Glycoprotein gp120
HIV
Human immunodeficiency virus
title Компьютерное моделирование иммунореактивной конформации иммунодоминантного эпитопа HIV-RF
url https://sfx.bib-bvb.de/sfx_tum?ctx_ver=Z39.88-2004&ctx_enc=info:ofi/enc:UTF-8&ctx_tim=2025-01-01T03%3A38%3A00IST&url_ver=Z39.88-2004&url_ctx_fmt=infofi/fmt:kev:mtx:ctx&rfr_id=info:sid/primo.exlibrisgroup.com:primo3-Article-proquest&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:journal&rft.genre=article&rft.atitle=%D0%9A%D0%BE%D0%BC%D0%BF%D1%8C%D1%8E%D1%82%D0%B5%D1%80%D0%BD%D0%BE%D0%B5%20%D0%BC%D0%BE%D0%B4%D0%B5%D0%BB%D0%B8%D1%80%D0%BE%D0%B2%D0%B0%D0%BD%D0%B8%D0%B5%20%D0%B8%D0%BC%D0%BC%D1%83%D0%BD%D0%BE%D1%80%D0%B5%D0%B0%D0%BA%D1%82%D0%B8%D0%B2%D0%BD%D0%BE%D0%B9%20%D0%BA%D0%BE%D0%BD%D1%84%D0%BE%D1%80%D0%BC%D0%B0%D1%86%D0%B8%D0%B8%20%D0%B8%D0%BC%D0%BC%D1%83%D0%BD%D0%BE%D0%B4%D0%BE%D0%BC%D0%B8%D0%BD%D0%B0%D0%BD%D1%82%D0%BD%D0%BE%D0%B3%D0%BE%20%D1%8D%D0%BF%D0%B8%D1%82%D0%BE%D0%BF%D0%B0%20HIV-RF&rft.jtitle=Biopolimery%20i%20kletka&rft.au=%D0%90%D0%BD%D0%B4%D1%80%D0%B8%D0%B0%D0%BD%D0%BE%D0%B2,%20%D0%90%20%D0%9C&rft.date=2005-01-01&rft.volume=21&rft.issue=2&rft.spage=165&rft.pages=165-&rft.issn=0233-7657&rft.eissn=1993-6842&rft_id=info:doi/10.7124/bc.0006E8&rft_dat=%3Cproquest%3E2306552825%3C/proquest%3E%3Curl%3E%3C/url%3E&disable_directlink=true&sfx.directlink=off&sfx.report_link=0&rft_id=info:oai/&rft_pqid=2306552825&rft_id=info:pmid/&rfr_iscdi=true