Generalized Verlet Algorithm for Efficient Molecular Dynamics Simulations with Long-range Interactions

For the purpose of molecular dynamics simulations of large biopolymers we have developed a new method to accelerate the calculation of long-range pair interactions (e.g. Coulomb interaction). The algorithm introduces distance classes to schedule updates of non-bonding interactions and to avoid unnec...

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Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Molecular simulation 1991-03, Vol.6 (1-3), p.121-142
Hauptverfasser: Grubmüller, H., Heller, H., Windemuth, A., Schulten, K.
Format: Artikel
Sprache:eng
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