Filogenetska i molekularna analiza gena hemaglutinina virusa ptičje gripe h9n2 izoliranih u jatima peradi u Maroku između 2016. i 2018. godine
Virusi ptičje gripe H9N2 nastavljaju se širiti u peradi i divljih ptica širom svijeta. Infekcija niskopatogenim virusom influence H9N2 prvi je put otkrivena u Maroku u siječnju 2016. godine. U ovom je istraživanju za probir na H9N2 prikupljeno ukupno 105 organa i obrisaka iz dušnika s 21 farme brojl...
Gespeichert in:
| Veröffentlicht in: | Veterinarski arhiv 2020-11, Vol.90 (5), p.477 |
|---|---|
| Hauptverfasser: | , , , , , , |
| Format: | Artikel |
| Sprache: | hrv ; eng |
| Schlagworte: | |
| Online-Zugang: | Volltext |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
| container_end_page | |
|---|---|
| container_issue | 5 |
| container_start_page | 477 |
| container_title | Veterinarski arhiv |
| container_volume | 90 |
| creator | El Khantour, Abderrazak Soulaymani, Abdelmajid Salek, Mohamed Maltouf, Abdelkarim Filali El Mellouli, Fatiha Ducatez, Mariette F Fellahi, Siham |
| description | Virusi ptičje gripe H9N2 nastavljaju se širiti u peradi i divljih ptica širom svijeta. Infekcija niskopatogenim virusom influence H9N2 prvi je put otkrivena u Maroku u siječnju 2016. godine. U ovom je istraživanju za probir na H9N2 prikupljeno ukupno 105 organa i obrisaka iz dušnika s 21 farme brojlera od srpnja 2016. do listopada 2018. iz različitih regija Maroka. Sumnja na bolest temeljila se na teškim respiracijskim znakovima kao što su kihanje, kašljanje, hropanje i hripanje, a infekcija virusom H9N2 potvrđena je PCR-om obrnute transkripcije u stvarnom vremenu. Sekvencije gena za hemaglutinin (HA) od četiri izolata amplificirane su pomoću RT-PCR qRT-PCR poravnane za filogenetsku i analizu sličnosti aminokiselina. Od 21 uzorka jata 48 % (10/21) bilo je pozitivno na H9 s pragom broja ciklusa u rasponu od 18,6 do 34,8. Maksimalna sličnost u nukleotidnim i proteinskim sekvencijama (96 -98 %) uočena je između marokanskih virusa i virusa H9 izoliranih iz brojlerskih pilića u 2017. u Burkini Faso (A/piletina/BurkinaFaso/17RS93-19) i od kokošjeg pileta u Ujedinjenim Arapskim Emiratima u 2015. (A/piletina/ Dubai/D2506/2015). HA geni otkrili su blisku vezu između četiriju virusa, s 97,9 % -99,9 % nukleotidnog identiteta. Filogenetska analiza pokazala je da marokanski virusi pripadaju lozi G1 i vjerojatno potječu s Bliskog istoka, kao što je objavljeno 2016. godine. |
| doi_str_mv | 10.24099/vet.arhiv.0724 |
| format | Article |
| fullrecord | <record><control><sourceid>hrcak</sourceid><recordid>TN_cdi_hrcak_primary_oai_hrcak_srce_hr_245820</recordid><sourceformat>XML</sourceformat><sourcesystem>PC</sourcesystem><sourcerecordid>oai_hrcak_srce_hr_245820</sourcerecordid><originalsourceid>FETCH-hrcak_primary_oai_hrcak_srce_hr_2458203</originalsourceid><addsrcrecordid>eNqVjc1OhDAQxxujibh69jovAJZCBc7GjRdv3slkd4SB0pIWSNx3MNF32gezib6Ap__XLzNC3OcyU6VsmoeNlgx9z1smK1VeiCQvijytpdaXIpFFpVJd1vJa3IQwSKkrpVUivvZsXEeWljAiMEzO0Lga9BYBLRo-IcQZoacJO7MubDmmjf0aEOaFz58DQed5Jugbq4BPzrBHyz2sMODCU8TI45FjfkXvxjUyE52_V1Ayf8zi06h1Bp07sqVbcfWOJtDdn-5Eun9-e3pJe3_AsZ19POg_Wofc_jbBHyjaVpW6VrL4L_8Dcb5mqw</addsrcrecordid><sourcetype>Open Access Repository</sourcetype><iscdi>true</iscdi><recordtype>article</recordtype></control><display><type>article</type><title>Filogenetska i molekularna analiza gena hemaglutinina virusa ptičje gripe h9n2 izoliranih u jatima peradi u Maroku između 2016. i 2018. godine</title><source>EZB-FREE-00999 freely available EZB journals</source><creator>El Khantour, Abderrazak ; Soulaymani, Abdelmajid ; Salek, Mohamed ; Maltouf, Abdelkarim Filali ; El Mellouli, Fatiha ; Ducatez, Mariette F ; Fellahi, Siham</creator><creatorcontrib>El Khantour, Abderrazak ; Soulaymani, Abdelmajid ; Salek, Mohamed ; Maltouf, Abdelkarim Filali ; El Mellouli, Fatiha ; Ducatez, Mariette F ; Fellahi, Siham</creatorcontrib><description>Virusi ptičje gripe H9N2 nastavljaju se širiti u peradi i divljih ptica širom svijeta. Infekcija niskopatogenim virusom influence H9N2 prvi je put otkrivena u Maroku u siječnju 2016. godine. U ovom je istraživanju za probir na H9N2 prikupljeno ukupno 105 organa i obrisaka iz dušnika s 21 farme brojlera od srpnja 2016. do listopada 2018. iz različitih regija Maroka. Sumnja na bolest temeljila se na teškim respiracijskim znakovima kao što su kihanje, kašljanje, hropanje i hripanje, a infekcija virusom H9N2 potvrđena je PCR-om obrnute transkripcije u stvarnom vremenu. Sekvencije gena za hemaglutinin (HA) od četiri izolata amplificirane su pomoću RT-PCR qRT-PCR poravnane za filogenetsku i analizu sličnosti aminokiselina. Od 21 uzorka jata 48 % (10/21) bilo je pozitivno na H9 s pragom broja ciklusa u rasponu od 18,6 do 34,8. Maksimalna sličnost u nukleotidnim i proteinskim sekvencijama (96 -98 %) uočena je između marokanskih virusa i virusa H9 izoliranih iz brojlerskih pilića u 2017. u Burkini Faso (A/piletina/BurkinaFaso/17RS93-19) i od kokošjeg pileta u Ujedinjenim Arapskim Emiratima u 2015. (A/piletina/ Dubai/D2506/2015). HA geni otkrili su blisku vezu između četiriju virusa, s 97,9 % -99,9 % nukleotidnog identiteta. Filogenetska analiza pokazala je da marokanski virusi pripadaju lozi G1 i vjerojatno potječu s Bliskog istoka, kao što je objavljeno 2016. godine.</description><identifier>ISSN: 0372-5480</identifier><identifier>EISSN: 1331-8055</identifier><identifier>DOI: 10.24099/vet.arhiv.0724</identifier><identifier>CODEN: VEARA6</identifier><language>hrv ; eng</language><publisher>Veterinarski fakultet Sveučilišta u Zagrebu</publisher><subject>avian influenza ; filogenija ; H9N2 ; Maroko ; molecular evolution ; molekularna analiza ; Morocco ; niska patogenost ; phylogeny ; ptičja gripa</subject><ispartof>Veterinarski arhiv, 2020-11, Vol.90 (5), p.477</ispartof><oa>free_for_read</oa><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Tsyndetics_thumb_exl</thumbnail><link.rule.ids>230,776,780,881,27902</link.rule.ids></links><search><creatorcontrib>El Khantour, Abderrazak</creatorcontrib><creatorcontrib>Soulaymani, Abdelmajid</creatorcontrib><creatorcontrib>Salek, Mohamed</creatorcontrib><creatorcontrib>Maltouf, Abdelkarim Filali</creatorcontrib><creatorcontrib>El Mellouli, Fatiha</creatorcontrib><creatorcontrib>Ducatez, Mariette F</creatorcontrib><creatorcontrib>Fellahi, Siham</creatorcontrib><title>Filogenetska i molekularna analiza gena hemaglutinina virusa ptičje gripe h9n2 izoliranih u jatima peradi u Maroku između 2016. i 2018. godine</title><title>Veterinarski arhiv</title><description>Virusi ptičje gripe H9N2 nastavljaju se širiti u peradi i divljih ptica širom svijeta. Infekcija niskopatogenim virusom influence H9N2 prvi je put otkrivena u Maroku u siječnju 2016. godine. U ovom je istraživanju za probir na H9N2 prikupljeno ukupno 105 organa i obrisaka iz dušnika s 21 farme brojlera od srpnja 2016. do listopada 2018. iz različitih regija Maroka. Sumnja na bolest temeljila se na teškim respiracijskim znakovima kao što su kihanje, kašljanje, hropanje i hripanje, a infekcija virusom H9N2 potvrđena je PCR-om obrnute transkripcije u stvarnom vremenu. Sekvencije gena za hemaglutinin (HA) od četiri izolata amplificirane su pomoću RT-PCR qRT-PCR poravnane za filogenetsku i analizu sličnosti aminokiselina. Od 21 uzorka jata 48 % (10/21) bilo je pozitivno na H9 s pragom broja ciklusa u rasponu od 18,6 do 34,8. Maksimalna sličnost u nukleotidnim i proteinskim sekvencijama (96 -98 %) uočena je između marokanskih virusa i virusa H9 izoliranih iz brojlerskih pilića u 2017. u Burkini Faso (A/piletina/BurkinaFaso/17RS93-19) i od kokošjeg pileta u Ujedinjenim Arapskim Emiratima u 2015. (A/piletina/ Dubai/D2506/2015). HA geni otkrili su blisku vezu između četiriju virusa, s 97,9 % -99,9 % nukleotidnog identiteta. Filogenetska analiza pokazala je da marokanski virusi pripadaju lozi G1 i vjerojatno potječu s Bliskog istoka, kao što je objavljeno 2016. godine.</description><subject>avian influenza</subject><subject>filogenija</subject><subject>H9N2</subject><subject>Maroko</subject><subject>molecular evolution</subject><subject>molekularna analiza</subject><subject>Morocco</subject><subject>niska patogenost</subject><subject>phylogeny</subject><subject>ptičja gripa</subject><issn>0372-5480</issn><issn>1331-8055</issn><fulltext>true</fulltext><rsrctype>article</rsrctype><creationdate>2020</creationdate><recordtype>article</recordtype><recordid>eNqVjc1OhDAQxxujibh69jovAJZCBc7GjRdv3slkd4SB0pIWSNx3MNF32gezib6Ap__XLzNC3OcyU6VsmoeNlgx9z1smK1VeiCQvijytpdaXIpFFpVJd1vJa3IQwSKkrpVUivvZsXEeWljAiMEzO0Lga9BYBLRo-IcQZoacJO7MubDmmjf0aEOaFz58DQed5Jugbq4BPzrBHyz2sMODCU8TI45FjfkXvxjUyE52_V1Ayf8zi06h1Bp07sqVbcfWOJtDdn-5Eun9-e3pJe3_AsZ19POg_Wofc_jbBHyjaVpW6VrL4L_8Dcb5mqw</recordid><startdate>20201110</startdate><enddate>20201110</enddate><creator>El Khantour, Abderrazak</creator><creator>Soulaymani, Abdelmajid</creator><creator>Salek, Mohamed</creator><creator>Maltouf, Abdelkarim Filali</creator><creator>El Mellouli, Fatiha</creator><creator>Ducatez, Mariette F</creator><creator>Fellahi, Siham</creator><general>Veterinarski fakultet Sveučilišta u Zagrebu</general><scope>VP8</scope></search><sort><creationdate>20201110</creationdate><title>Filogenetska i molekularna analiza gena hemaglutinina virusa ptičje gripe h9n2 izoliranih u jatima peradi u Maroku između 2016. i 2018. godine</title><author>El Khantour, Abderrazak ; Soulaymani, Abdelmajid ; Salek, Mohamed ; Maltouf, Abdelkarim Filali ; El Mellouli, Fatiha ; Ducatez, Mariette F ; Fellahi, Siham</author></sort><facets><frbrtype>5</frbrtype><frbrgroupid>cdi_FETCH-hrcak_primary_oai_hrcak_srce_hr_2458203</frbrgroupid><rsrctype>articles</rsrctype><prefilter>articles</prefilter><language>hrv ; eng</language><creationdate>2020</creationdate><topic>avian influenza</topic><topic>filogenija</topic><topic>H9N2</topic><topic>Maroko</topic><topic>molecular evolution</topic><topic>molekularna analiza</topic><topic>Morocco</topic><topic>niska patogenost</topic><topic>phylogeny</topic><topic>ptičja gripa</topic><toplevel>online_resources</toplevel><creatorcontrib>El Khantour, Abderrazak</creatorcontrib><creatorcontrib>Soulaymani, Abdelmajid</creatorcontrib><creatorcontrib>Salek, Mohamed</creatorcontrib><creatorcontrib>Maltouf, Abdelkarim Filali</creatorcontrib><creatorcontrib>El Mellouli, Fatiha</creatorcontrib><creatorcontrib>Ducatez, Mariette F</creatorcontrib><creatorcontrib>Fellahi, Siham</creatorcontrib><collection>Hrcak: Portal of scientific journals of Croatia</collection></facets><delivery><delcategory>Remote Search Resource</delcategory><fulltext>fulltext</fulltext></delivery><addata><au>El Khantour, Abderrazak</au><au>Soulaymani, Abdelmajid</au><au>Salek, Mohamed</au><au>Maltouf, Abdelkarim Filali</au><au>El Mellouli, Fatiha</au><au>Ducatez, Mariette F</au><au>Fellahi, Siham</au><format>book</format><genre>document</genre><ristype>GEN</ristype><atitle>Filogenetska i molekularna analiza gena hemaglutinina virusa ptičje gripe h9n2 izoliranih u jatima peradi u Maroku između 2016. i 2018. godine</atitle><jtitle>Veterinarski arhiv</jtitle><date>2020-11-10</date><risdate>2020</risdate><volume>90</volume><issue>5</issue><spage>477</spage><pages>477-</pages><issn>0372-5480</issn><eissn>1331-8055</eissn><coden>VEARA6</coden><abstract>Virusi ptičje gripe H9N2 nastavljaju se širiti u peradi i divljih ptica širom svijeta. Infekcija niskopatogenim virusom influence H9N2 prvi je put otkrivena u Maroku u siječnju 2016. godine. U ovom je istraživanju za probir na H9N2 prikupljeno ukupno 105 organa i obrisaka iz dušnika s 21 farme brojlera od srpnja 2016. do listopada 2018. iz različitih regija Maroka. Sumnja na bolest temeljila se na teškim respiracijskim znakovima kao što su kihanje, kašljanje, hropanje i hripanje, a infekcija virusom H9N2 potvrđena je PCR-om obrnute transkripcije u stvarnom vremenu. Sekvencije gena za hemaglutinin (HA) od četiri izolata amplificirane su pomoću RT-PCR qRT-PCR poravnane za filogenetsku i analizu sličnosti aminokiselina. Od 21 uzorka jata 48 % (10/21) bilo je pozitivno na H9 s pragom broja ciklusa u rasponu od 18,6 do 34,8. Maksimalna sličnost u nukleotidnim i proteinskim sekvencijama (96 -98 %) uočena je između marokanskih virusa i virusa H9 izoliranih iz brojlerskih pilića u 2017. u Burkini Faso (A/piletina/BurkinaFaso/17RS93-19) i od kokošjeg pileta u Ujedinjenim Arapskim Emiratima u 2015. (A/piletina/ Dubai/D2506/2015). HA geni otkrili su blisku vezu između četiriju virusa, s 97,9 % -99,9 % nukleotidnog identiteta. Filogenetska analiza pokazala je da marokanski virusi pripadaju lozi G1 i vjerojatno potječu s Bliskog istoka, kao što je objavljeno 2016. godine.</abstract><pub>Veterinarski fakultet Sveučilišta u Zagrebu</pub><doi>10.24099/vet.arhiv.0724</doi><oa>free_for_read</oa></addata></record> |
| fulltext | fulltext |
| identifier | ISSN: 0372-5480 |
| ispartof | Veterinarski arhiv, 2020-11, Vol.90 (5), p.477 |
| issn | 0372-5480 1331-8055 |
| language | hrv ; eng |
| recordid | cdi_hrcak_primary_oai_hrcak_srce_hr_245820 |
| source | EZB-FREE-00999 freely available EZB journals |
| subjects | avian influenza filogenija H9N2 Maroko molecular evolution molekularna analiza Morocco niska patogenost phylogeny ptičja gripa |
| title | Filogenetska i molekularna analiza gena hemaglutinina virusa ptičje gripe h9n2 izoliranih u jatima peradi u Maroku između 2016. i 2018. godine |
| url | https://sfx.bib-bvb.de/sfx_tum?ctx_ver=Z39.88-2004&ctx_enc=info:ofi/enc:UTF-8&ctx_tim=2025-02-01T17%3A29%3A30IST&url_ver=Z39.88-2004&url_ctx_fmt=infofi/fmt:kev:mtx:ctx&rfr_id=info:sid/primo.exlibrisgroup.com:primo3-Article-hrcak&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:book&rft.genre=document&rft.atitle=Filogenetska%20i%20molekularna%20analiza%20gena%20hemaglutinina%20virusa%20pti%C4%8Dje%20gripe%20h9n2%20izoliranih%20u%20jatima%20peradi%20u%20Maroku%20izme%C4%91u%202016.%20i%202018.%20godine&rft.jtitle=Veterinarski%20arhiv&rft.au=El%20Khantour,%20Abderrazak&rft.date=2020-11-10&rft.volume=90&rft.issue=5&rft.spage=477&rft.pages=477-&rft.issn=0372-5480&rft.eissn=1331-8055&rft.coden=VEARA6&rft_id=info:doi/10.24099/vet.arhiv.0724&rft_dat=%3Chrcak%3Eoai_hrcak_srce_hr_245820%3C/hrcak%3E%3Curl%3E%3C/url%3E&disable_directlink=true&sfx.directlink=off&sfx.report_link=0&rft_id=info:oai/&rft_id=info:pmid/&rfr_iscdi=true |