DIFERENCIAS GENÉTICAS Y ESTRUCTURA DE POBLACIONES DE Capsicum spp. CON SECUENCIAS SIMPLES REP ETIDAS
Entre las Solanáceas, Capsicum spp. es un género de hortalizas muy importante a nivel mundial, y cultivada extensamente en México. El objetivo del trabajo fue conocer la relación, diversidad y estructura genética de 14 poblaciones de Capsicum spp. (seis del estado de Tabasco y cinco de Tamaulipas, M...
Gespeichert in:
Veröffentlicht in: | Bioagro 2024-01, Vol.36 (1), p.27 |
---|---|
Hauptverfasser: | , , , , , |
Format: | Artikel |
Sprache: | spa |
Online-Zugang: | Volltext |
Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
container_end_page | |
---|---|
container_issue | 1 |
container_start_page | 27 |
container_title | Bioagro |
container_volume | 36 |
creator | Gálvez-Muñoz, Yasmín Araceli Cea-Migenes, María Esther Ruíz Salazar, Régulo Castañón-Nájera, Guillermo Latournerie- Moreno, Luis Ramírez-Meraz, Moisés |
description | Entre las Solanáceas, Capsicum spp. es un género de hortalizas muy importante a nivel mundial, y cultivada extensamente en México. El objetivo del trabajo fue conocer la relación, diversidad y estructura genética de 14 poblaciones de Capsicum spp. (seis del estado de Tabasco y cinco de Tamaulipas, México, y tres de Cuba). Los cuatro oligonucleótidos identificaron 202 alelos, 38 de ellos fueron polimórficos. El mayor número de alelos (65) los amplificó el oligo HpmsCaSIG19 y Hpms1-274 detectó el menor número de alelos (35), la media de alelos fue de 50,5. La estructura genética de las poblaciones se estimó con los índices de fijación F. El valor de la diversidad entre regiones (PhiRT) fue 0,264, lo que significa que las poblaciones presentaron 73,6% de variación entre ellas. Se encontró alta diversidad entre subpoblaciones dentro de regiones ([Phi.sub.PR]=0,412). El [Phi.sub.PT] (análogo del [F.sub.ST])=0,567, puede interpretarse como alta diferenciación en las frecuencias génicas de las poblaciones evaluadas. El análisis clúster clasificó a las 14 poblaciones a una distancia de 11 en cinco grupos. Los clústeres I y III fueron formados por cuatro poblaciones cada uno, mientras que dos poblaciones por cluster se observaron en el clúster II, IV y V. En este análisis, la población Cachucha (Cach) de Cuba no se relacionó con las retrocruzas Habanero x Amashito (RCHaAm) y Garbanzo x Habanero (RCGaHa), tampoco a la población Habanero de Tabasco, México. Palabras clave adicionales: Capsicum spp., diversidad genética, marcadores SSRs, poblaciones de chile, relaciones filogenéticas In the Solanaceae family, Capsicum spp. is a worldwide important vegetable genus, and widely cultivated in Mexico. The objective of this research was to know the genetic relation, genetic diversity, and genetic structure of fourteen populations of Capsicum spp. (six from Tabasco, five from Tamaulipas, Mexico, and three from Cuba). The four oligonucleotides identified 202 alleles, 38 of them were polymorphics. The majority of alleles (65) were amplified by oligo HpmsCaSIG19, and Hpms1- 274 detected a small amount of alleles (35); the average of alleles was 50,5. The genetic structure of the population was estimated with the F fixation indices. The value of the diversity between regions ([Phi.sub.RT]) was 0,264, this means that the populations presented 73,6% of variation between them. High diversity was found among subpopulations and inside regions ([Phi.sub.PR]=0,412). The [Phi.sub.PT] (a |
doi_str_mv | 10.51372/bioagro361.3 |
format | Article |
fullrecord | <record><control><sourceid>gale</sourceid><recordid>TN_cdi_gale_infotracmisc_A784164793</recordid><sourceformat>XML</sourceformat><sourcesystem>PC</sourcesystem><galeid>A784164793</galeid><sourcerecordid>A784164793</sourcerecordid><originalsourceid>FETCH-LOGICAL-g673-92af77230422f00f271b96035f3e353fc480e0914cb6f9ecd827406ce4208803</originalsourceid><addsrcrecordid>eNptjb1OwzAUhT2ARCmM7JaYE65_aidjcN0SKSRVnA5MVeraVVDbVA08BM_VF8OIDgzoDueeq--ci9ADgXhCmKRP665vt6eeCRKzKzQijIiIBXeDbofhHYBLEGSE3DSf6VqXKs8Mnuvy_NXkKqxvWJumXqpmWWd4qvGiei4ylVelNj9Wtcehs597PByPMVZViY1Wy0uNyV8XReBqvcC6yaeZuUPXvt0N7v6iY2RmulEvUVHNw7si2grJopS2XkrKgFPqATyVZJ0KYBPPHJswb3kCDlLC7Vr41NlNQiUHYR2nkCTAxujxt3Xb7tyqO_j-49TafTfYVSYTTgSXKQtU_A8VZuP2ne0Pznfh_ifwDVRLXSk</addsrcrecordid><sourcetype>Aggregation Database</sourcetype><iscdi>true</iscdi><recordtype>article</recordtype></control><display><type>article</type><title>DIFERENCIAS GENÉTICAS Y ESTRUCTURA DE POBLACIONES DE Capsicum spp. CON SECUENCIAS SIMPLES REP ETIDAS</title><source>EZB-FREE-00999 freely available EZB journals</source><source>Alma/SFX Local Collection</source><creator>Gálvez-Muñoz, Yasmín Araceli ; Cea-Migenes, María Esther ; Ruíz Salazar, Régulo ; Castañón-Nájera, Guillermo ; Latournerie- Moreno, Luis ; Ramírez-Meraz, Moisés</creator><creatorcontrib>Gálvez-Muñoz, Yasmín Araceli ; Cea-Migenes, María Esther ; Ruíz Salazar, Régulo ; Castañón-Nájera, Guillermo ; Latournerie- Moreno, Luis ; Ramírez-Meraz, Moisés</creatorcontrib><description>Entre las Solanáceas, Capsicum spp. es un género de hortalizas muy importante a nivel mundial, y cultivada extensamente en México. El objetivo del trabajo fue conocer la relación, diversidad y estructura genética de 14 poblaciones de Capsicum spp. (seis del estado de Tabasco y cinco de Tamaulipas, México, y tres de Cuba). Los cuatro oligonucleótidos identificaron 202 alelos, 38 de ellos fueron polimórficos. El mayor número de alelos (65) los amplificó el oligo HpmsCaSIG19 y Hpms1-274 detectó el menor número de alelos (35), la media de alelos fue de 50,5. La estructura genética de las poblaciones se estimó con los índices de fijación F. El valor de la diversidad entre regiones (PhiRT) fue 0,264, lo que significa que las poblaciones presentaron 73,6% de variación entre ellas. Se encontró alta diversidad entre subpoblaciones dentro de regiones ([Phi.sub.PR]=0,412). El [Phi.sub.PT] (análogo del [F.sub.ST])=0,567, puede interpretarse como alta diferenciación en las frecuencias génicas de las poblaciones evaluadas. El análisis clúster clasificó a las 14 poblaciones a una distancia de 11 en cinco grupos. Los clústeres I y III fueron formados por cuatro poblaciones cada uno, mientras que dos poblaciones por cluster se observaron en el clúster II, IV y V. En este análisis, la población Cachucha (Cach) de Cuba no se relacionó con las retrocruzas Habanero x Amashito (RCHaAm) y Garbanzo x Habanero (RCGaHa), tampoco a la población Habanero de Tabasco, México. Palabras clave adicionales: Capsicum spp., diversidad genética, marcadores SSRs, poblaciones de chile, relaciones filogenéticas In the Solanaceae family, Capsicum spp. is a worldwide important vegetable genus, and widely cultivated in Mexico. The objective of this research was to know the genetic relation, genetic diversity, and genetic structure of fourteen populations of Capsicum spp. (six from Tabasco, five from Tamaulipas, Mexico, and three from Cuba). The four oligonucleotides identified 202 alleles, 38 of them were polymorphics. The majority of alleles (65) were amplified by oligo HpmsCaSIG19, and Hpms1- 274 detected a small amount of alleles (35); the average of alleles was 50,5. The genetic structure of the population was estimated with the F fixation indices. The value of the diversity between regions ([Phi.sub.RT]) was 0,264, this means that the populations presented 73,6% of variation between them. High diversity was found among subpopulations and inside regions ([Phi.sub.PR]=0,412). The [Phi.sub.PT] (analog of [F.sub.ST])=0,567, can be interpreted as high differentiation in the genics frequency of the populations that were evaluated. The cluster analysis classified the fourteen populations at a distance of 11 in five groups; the clusters I and III were formed by four populations on each one, while, two populations per cluster were observed in the clusters II, IV, and V. In this analysis, the population Cachucha of Cuba was not related with the backcrosses Habanero x Amashito (RCHaAm) and Garbanzo x Habanero (RCGaHa), and it was not related to the Habanero population of Tabasco Mexico. Additional Keywords: Capsicum spp., chili populations, genetic diversity, phylogenetic relations, SSR markers</description><identifier>ISSN: 1316-3361</identifier><identifier>DOI: 10.51372/bioagro361.3</identifier><language>spa</language><publisher>Universidad Centroccidental Lisandro Alvarado</publisher><ispartof>Bioagro, 2024-01, Vol.36 (1), p.27</ispartof><rights>COPYRIGHT 2024 Universidad Centroccidental Lisandro Alvarado</rights><lds50>peer_reviewed</lds50><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Tsyndetics_thumb_exl</thumbnail><link.rule.ids>314,780,784,27924,27925</link.rule.ids></links><search><creatorcontrib>Gálvez-Muñoz, Yasmín Araceli</creatorcontrib><creatorcontrib>Cea-Migenes, María Esther</creatorcontrib><creatorcontrib>Ruíz Salazar, Régulo</creatorcontrib><creatorcontrib>Castañón-Nájera, Guillermo</creatorcontrib><creatorcontrib>Latournerie- Moreno, Luis</creatorcontrib><creatorcontrib>Ramírez-Meraz, Moisés</creatorcontrib><title>DIFERENCIAS GENÉTICAS Y ESTRUCTURA DE POBLACIONES DE Capsicum spp. CON SECUENCIAS SIMPLES REP ETIDAS</title><title>Bioagro</title><description>Entre las Solanáceas, Capsicum spp. es un género de hortalizas muy importante a nivel mundial, y cultivada extensamente en México. El objetivo del trabajo fue conocer la relación, diversidad y estructura genética de 14 poblaciones de Capsicum spp. (seis del estado de Tabasco y cinco de Tamaulipas, México, y tres de Cuba). Los cuatro oligonucleótidos identificaron 202 alelos, 38 de ellos fueron polimórficos. El mayor número de alelos (65) los amplificó el oligo HpmsCaSIG19 y Hpms1-274 detectó el menor número de alelos (35), la media de alelos fue de 50,5. La estructura genética de las poblaciones se estimó con los índices de fijación F. El valor de la diversidad entre regiones (PhiRT) fue 0,264, lo que significa que las poblaciones presentaron 73,6% de variación entre ellas. Se encontró alta diversidad entre subpoblaciones dentro de regiones ([Phi.sub.PR]=0,412). El [Phi.sub.PT] (análogo del [F.sub.ST])=0,567, puede interpretarse como alta diferenciación en las frecuencias génicas de las poblaciones evaluadas. El análisis clúster clasificó a las 14 poblaciones a una distancia de 11 en cinco grupos. Los clústeres I y III fueron formados por cuatro poblaciones cada uno, mientras que dos poblaciones por cluster se observaron en el clúster II, IV y V. En este análisis, la población Cachucha (Cach) de Cuba no se relacionó con las retrocruzas Habanero x Amashito (RCHaAm) y Garbanzo x Habanero (RCGaHa), tampoco a la población Habanero de Tabasco, México. Palabras clave adicionales: Capsicum spp., diversidad genética, marcadores SSRs, poblaciones de chile, relaciones filogenéticas In the Solanaceae family, Capsicum spp. is a worldwide important vegetable genus, and widely cultivated in Mexico. The objective of this research was to know the genetic relation, genetic diversity, and genetic structure of fourteen populations of Capsicum spp. (six from Tabasco, five from Tamaulipas, Mexico, and three from Cuba). The four oligonucleotides identified 202 alleles, 38 of them were polymorphics. The majority of alleles (65) were amplified by oligo HpmsCaSIG19, and Hpms1- 274 detected a small amount of alleles (35); the average of alleles was 50,5. The genetic structure of the population was estimated with the F fixation indices. The value of the diversity between regions ([Phi.sub.RT]) was 0,264, this means that the populations presented 73,6% of variation between them. High diversity was found among subpopulations and inside regions ([Phi.sub.PR]=0,412). The [Phi.sub.PT] (analog of [F.sub.ST])=0,567, can be interpreted as high differentiation in the genics frequency of the populations that were evaluated. The cluster analysis classified the fourteen populations at a distance of 11 in five groups; the clusters I and III were formed by four populations on each one, while, two populations per cluster were observed in the clusters II, IV, and V. In this analysis, the population Cachucha of Cuba was not related with the backcrosses Habanero x Amashito (RCHaAm) and Garbanzo x Habanero (RCGaHa), and it was not related to the Habanero population of Tabasco Mexico. Additional Keywords: Capsicum spp., chili populations, genetic diversity, phylogenetic relations, SSR markers</description><issn>1316-3361</issn><fulltext>true</fulltext><rsrctype>article</rsrctype><creationdate>2024</creationdate><recordtype>article</recordtype><recordid>eNptjb1OwzAUhT2ARCmM7JaYE65_aidjcN0SKSRVnA5MVeraVVDbVA08BM_VF8OIDgzoDueeq--ci9ADgXhCmKRP665vt6eeCRKzKzQijIiIBXeDbofhHYBLEGSE3DSf6VqXKs8Mnuvy_NXkKqxvWJumXqpmWWd4qvGiei4ylVelNj9Wtcehs597PByPMVZViY1Wy0uNyV8XReBqvcC6yaeZuUPXvt0N7v6iY2RmulEvUVHNw7si2grJopS2XkrKgFPqATyVZJ0KYBPPHJswb3kCDlLC7Vr41NlNQiUHYR2nkCTAxujxt3Xb7tyqO_j-49TafTfYVSYTTgSXKQtU_A8VZuP2ne0Pznfh_ifwDVRLXSk</recordid><startdate>20240101</startdate><enddate>20240101</enddate><creator>Gálvez-Muñoz, Yasmín Araceli</creator><creator>Cea-Migenes, María Esther</creator><creator>Ruíz Salazar, Régulo</creator><creator>Castañón-Nájera, Guillermo</creator><creator>Latournerie- Moreno, Luis</creator><creator>Ramírez-Meraz, Moisés</creator><general>Universidad Centroccidental Lisandro Alvarado</general><scope>INF</scope></search><sort><creationdate>20240101</creationdate><title>DIFERENCIAS GENÉTICAS Y ESTRUCTURA DE POBLACIONES DE Capsicum spp. CON SECUENCIAS SIMPLES REP ETIDAS</title><author>Gálvez-Muñoz, Yasmín Araceli ; Cea-Migenes, María Esther ; Ruíz Salazar, Régulo ; Castañón-Nájera, Guillermo ; Latournerie- Moreno, Luis ; Ramírez-Meraz, Moisés</author></sort><facets><frbrtype>5</frbrtype><frbrgroupid>cdi_FETCH-LOGICAL-g673-92af77230422f00f271b96035f3e353fc480e0914cb6f9ecd827406ce4208803</frbrgroupid><rsrctype>articles</rsrctype><prefilter>articles</prefilter><language>spa</language><creationdate>2024</creationdate><toplevel>peer_reviewed</toplevel><toplevel>online_resources</toplevel><creatorcontrib>Gálvez-Muñoz, Yasmín Araceli</creatorcontrib><creatorcontrib>Cea-Migenes, María Esther</creatorcontrib><creatorcontrib>Ruíz Salazar, Régulo</creatorcontrib><creatorcontrib>Castañón-Nájera, Guillermo</creatorcontrib><creatorcontrib>Latournerie- Moreno, Luis</creatorcontrib><creatorcontrib>Ramírez-Meraz, Moisés</creatorcontrib><collection>Gale OneFile: Informe Academico</collection><jtitle>Bioagro</jtitle></facets><delivery><delcategory>Remote Search Resource</delcategory><fulltext>fulltext</fulltext></delivery><addata><au>Gálvez-Muñoz, Yasmín Araceli</au><au>Cea-Migenes, María Esther</au><au>Ruíz Salazar, Régulo</au><au>Castañón-Nájera, Guillermo</au><au>Latournerie- Moreno, Luis</au><au>Ramírez-Meraz, Moisés</au><format>journal</format><genre>article</genre><ristype>JOUR</ristype><atitle>DIFERENCIAS GENÉTICAS Y ESTRUCTURA DE POBLACIONES DE Capsicum spp. CON SECUENCIAS SIMPLES REP ETIDAS</atitle><jtitle>Bioagro</jtitle><date>2024-01-01</date><risdate>2024</risdate><volume>36</volume><issue>1</issue><spage>27</spage><pages>27-</pages><issn>1316-3361</issn><abstract>Entre las Solanáceas, Capsicum spp. es un género de hortalizas muy importante a nivel mundial, y cultivada extensamente en México. El objetivo del trabajo fue conocer la relación, diversidad y estructura genética de 14 poblaciones de Capsicum spp. (seis del estado de Tabasco y cinco de Tamaulipas, México, y tres de Cuba). Los cuatro oligonucleótidos identificaron 202 alelos, 38 de ellos fueron polimórficos. El mayor número de alelos (65) los amplificó el oligo HpmsCaSIG19 y Hpms1-274 detectó el menor número de alelos (35), la media de alelos fue de 50,5. La estructura genética de las poblaciones se estimó con los índices de fijación F. El valor de la diversidad entre regiones (PhiRT) fue 0,264, lo que significa que las poblaciones presentaron 73,6% de variación entre ellas. Se encontró alta diversidad entre subpoblaciones dentro de regiones ([Phi.sub.PR]=0,412). El [Phi.sub.PT] (análogo del [F.sub.ST])=0,567, puede interpretarse como alta diferenciación en las frecuencias génicas de las poblaciones evaluadas. El análisis clúster clasificó a las 14 poblaciones a una distancia de 11 en cinco grupos. Los clústeres I y III fueron formados por cuatro poblaciones cada uno, mientras que dos poblaciones por cluster se observaron en el clúster II, IV y V. En este análisis, la población Cachucha (Cach) de Cuba no se relacionó con las retrocruzas Habanero x Amashito (RCHaAm) y Garbanzo x Habanero (RCGaHa), tampoco a la población Habanero de Tabasco, México. Palabras clave adicionales: Capsicum spp., diversidad genética, marcadores SSRs, poblaciones de chile, relaciones filogenéticas In the Solanaceae family, Capsicum spp. is a worldwide important vegetable genus, and widely cultivated in Mexico. The objective of this research was to know the genetic relation, genetic diversity, and genetic structure of fourteen populations of Capsicum spp. (six from Tabasco, five from Tamaulipas, Mexico, and three from Cuba). The four oligonucleotides identified 202 alleles, 38 of them were polymorphics. The majority of alleles (65) were amplified by oligo HpmsCaSIG19, and Hpms1- 274 detected a small amount of alleles (35); the average of alleles was 50,5. The genetic structure of the population was estimated with the F fixation indices. The value of the diversity between regions ([Phi.sub.RT]) was 0,264, this means that the populations presented 73,6% of variation between them. High diversity was found among subpopulations and inside regions ([Phi.sub.PR]=0,412). The [Phi.sub.PT] (analog of [F.sub.ST])=0,567, can be interpreted as high differentiation in the genics frequency of the populations that were evaluated. The cluster analysis classified the fourteen populations at a distance of 11 in five groups; the clusters I and III were formed by four populations on each one, while, two populations per cluster were observed in the clusters II, IV, and V. In this analysis, the population Cachucha of Cuba was not related with the backcrosses Habanero x Amashito (RCHaAm) and Garbanzo x Habanero (RCGaHa), and it was not related to the Habanero population of Tabasco Mexico. Additional Keywords: Capsicum spp., chili populations, genetic diversity, phylogenetic relations, SSR markers</abstract><pub>Universidad Centroccidental Lisandro Alvarado</pub><doi>10.51372/bioagro361.3</doi></addata></record> |
fulltext | fulltext |
identifier | ISSN: 1316-3361 |
ispartof | Bioagro, 2024-01, Vol.36 (1), p.27 |
issn | 1316-3361 |
language | spa |
recordid | cdi_gale_infotracmisc_A784164793 |
source | EZB-FREE-00999 freely available EZB journals; Alma/SFX Local Collection |
title | DIFERENCIAS GENÉTICAS Y ESTRUCTURA DE POBLACIONES DE Capsicum spp. CON SECUENCIAS SIMPLES REP ETIDAS |
url | https://sfx.bib-bvb.de/sfx_tum?ctx_ver=Z39.88-2004&ctx_enc=info:ofi/enc:UTF-8&ctx_tim=2024-12-25T03%3A22%3A24IST&url_ver=Z39.88-2004&url_ctx_fmt=infofi/fmt:kev:mtx:ctx&rfr_id=info:sid/primo.exlibrisgroup.com:primo3-Article-gale&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:journal&rft.genre=article&rft.atitle=DIFERENCIAS%20GEN%C3%89TICAS%20Y%20ESTRUCTURA%20DE%20POBLACIONES%20DE%20Capsicum%20spp.%20CON%20SECUENCIAS%20SIMPLES%20REP%20ETIDAS&rft.jtitle=Bioagro&rft.au=G%C3%A1lvez-Mu%C3%B1oz,%20Yasm%C3%ADn%20Araceli&rft.date=2024-01-01&rft.volume=36&rft.issue=1&rft.spage=27&rft.pages=27-&rft.issn=1316-3361&rft_id=info:doi/10.51372/bioagro361.3&rft_dat=%3Cgale%3EA784164793%3C/gale%3E%3Curl%3E%3C/url%3E&disable_directlink=true&sfx.directlink=off&sfx.report_link=0&rft_id=info:oai/&rft_id=info:pmid/&rft_galeid=A784164793&rfr_iscdi=true |