Accediendo al pasado: uso de especímenes de colección como fuentes de información genética para el género Bombus (Hymenoptera: Apidae)
Introducción: Recientemente ha tomado relevancia el uso de especímenes de museo como fuente de información genética para desarrollar estudios que resuelven preguntas taxonómicas, ecológicas, demográficas y evolutivas a diversas escalas temporales y geográficas. Sin embargo, material genético obtenid...
Gespeichert in:
Veröffentlicht in: | Revista de biología tropical 2020-06, Vol.68 (2), p.394 |
---|---|
Hauptverfasser: | , , , , |
Format: | Artikel |
Sprache: | spa |
Online-Zugang: | Volltext |
Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
container_end_page | |
---|---|
container_issue | 2 |
container_start_page | 394 |
container_title | Revista de biología tropical |
container_volume | 68 |
creator | Lotta-Arévalo, Ingrid A Vargas-Ramírez, Mario Nates-Parra, Guiomar Matta, Nubia E Ospina Torres, Rodulfo |
description | Introducción: Recientemente ha tomado relevancia el uso de especímenes de museo como fuente de información genética para desarrollar estudios que resuelven preguntas taxonómicas, ecológicas, demográficas y evolutivas a diversas escalas temporales y geográficas. Sin embargo, material genético obtenido a partir de ejemplares depositados en colecciones biológicas es poco usado, debido al deterioro natural del ADN preservado en dichos ejemplares, de manera que la obtención de material genético de calidad es demandante en términos de tiempo y dinero. Objetivo: Usando material de museo, identificar una secuencia mini-barcode que pueda ser empleada en la determinación taxonómica, y que a su vez suministre información que permita la estimación de relaciones filogenéticas de especies del género Bombus. Métodos: se estandarizó el protocolo de extracción de ADN a partir de la extremidad mesotoracica derecha y/o una muestra de músculo torácico de 96 especímenes depositados en la colección LABUN entre 7 y 38 años atrás. Las diferentes combinaciones de oligonucleótidos evaluadas permitieron amplificar fragmentos de 152 a 407 pares de bases (pb) del gen mitocondrial Cytochrome Oxidase I (COI). Usando como plantilla un grupo de 31 secuencias amplificadas a partir de especímenes recolectados recientemente, los fragmentos obtenidos de los especímenes del museo fueron ensamblados y analizados en un marco filogenético. Además, se realizó un análisis de red de haplotipos para evaluar en detalle las relaciones entre los haplotipos mitocondriales resultantes. Resultados: Se determinó un mayor éxito de extracción de ADN a partir de muestras de extremidad depositadas a partir del año 1982. Entretanto, la amplificación exitosa de fragmentos de más de 300 pares de bases (pb) se logró principalmente en muestras depositadas en fechas posteriores a 1999, lo que indica una mayor integridad del material genético recuperado de individuos de 19 años de recolección en adelante. Aunque todos los fragmentos evaluados pueden ser empleados como mini-barcode, solo con uno se obtiene una topología similar a la observada con el fragmento completo. Se detectó una gran variacion genética, particularmente al interior de las especies Bombus atratus y B. funebris, en las que se reveló una clara estructura filogeográfica. Conclusiones: Se obtuvieron nuevas secuencias de códigos de barras mediante extracción de ADN y protocolo de amplificación de muestras de museos. Además, se generó nueva información so |
doi_str_mv | 10.15517/rbt.v68i2.36350 |
format | Article |
fullrecord | <record><control><sourceid>gale_cross</sourceid><recordid>TN_cdi_gale_infotracmisc_A636124716</recordid><sourceformat>XML</sourceformat><sourcesystem>PC</sourcesystem><galeid>A636124716</galeid><sourcerecordid>A636124716</sourcerecordid><originalsourceid>FETCH-LOGICAL-c225t-c5de6b7d3f06a40498cfadb9d88ddb89aec2a566c327f3576449af9f340295163</originalsourceid><addsrcrecordid>eNptUctq20AUHUoLcd3usxzIJlnIHc1LkneOSZOCoZt2La5m7pgpkkbMyAF_Q77Ei6zyCf6xynY2hXIX93EeXDiEXOdskSuVF99iMy6eden5Qmih2Acy4zxXGWeF-khmjAmZFYWUV-RzSn8Y47KSekZeVsag9djbQKGlAySwYUl3KVCLFNOA5vjaYY_ptJvQojH--NZPYxeo22E_XiDfuxA7uIBb7I-H0RuYDCNQbOn2eOgxBnofumaX6O3TfjINw4gRlnQ1eAt494V8ctAm_Pre5-T394df66ds8_Pxx3q1yQznasyMsqibwgrHNEgmq9I4sE1ly9LapqwADQeltRG8cEIVWsoKXOWEZLxSuRZzcnPx3UKL9enxMYLpfDL1Sgudc1mcWYv_sKay2HkTenR-uv8jYBeBiSGliK4eou8g7uuc1eeM6imj-pxRfc5I_AVLQ4nv</addsrcrecordid><sourcetype>Aggregation Database</sourcetype><iscdi>true</iscdi><recordtype>article</recordtype></control><display><type>article</type><title>Accediendo al pasado: uso de especímenes de colección como fuentes de información genética para el género Bombus (Hymenoptera: Apidae)</title><source>EZB-FREE-00999 freely available EZB journals</source><creator>Lotta-Arévalo, Ingrid A ; Vargas-Ramírez, Mario ; Nates-Parra, Guiomar ; Matta, Nubia E ; Ospina Torres, Rodulfo</creator><creatorcontrib>Lotta-Arévalo, Ingrid A ; Vargas-Ramírez, Mario ; Nates-Parra, Guiomar ; Matta, Nubia E ; Ospina Torres, Rodulfo</creatorcontrib><description>Introducción: Recientemente ha tomado relevancia el uso de especímenes de museo como fuente de información genética para desarrollar estudios que resuelven preguntas taxonómicas, ecológicas, demográficas y evolutivas a diversas escalas temporales y geográficas. Sin embargo, material genético obtenido a partir de ejemplares depositados en colecciones biológicas es poco usado, debido al deterioro natural del ADN preservado en dichos ejemplares, de manera que la obtención de material genético de calidad es demandante en términos de tiempo y dinero. Objetivo: Usando material de museo, identificar una secuencia mini-barcode que pueda ser empleada en la determinación taxonómica, y que a su vez suministre información que permita la estimación de relaciones filogenéticas de especies del género Bombus. Métodos: se estandarizó el protocolo de extracción de ADN a partir de la extremidad mesotoracica derecha y/o una muestra de músculo torácico de 96 especímenes depositados en la colección LABUN entre 7 y 38 años atrás. Las diferentes combinaciones de oligonucleótidos evaluadas permitieron amplificar fragmentos de 152 a 407 pares de bases (pb) del gen mitocondrial Cytochrome Oxidase I (COI). Usando como plantilla un grupo de 31 secuencias amplificadas a partir de especímenes recolectados recientemente, los fragmentos obtenidos de los especímenes del museo fueron ensamblados y analizados en un marco filogenético. Además, se realizó un análisis de red de haplotipos para evaluar en detalle las relaciones entre los haplotipos mitocondriales resultantes. Resultados: Se determinó un mayor éxito de extracción de ADN a partir de muestras de extremidad depositadas a partir del año 1982. Entretanto, la amplificación exitosa de fragmentos de más de 300 pares de bases (pb) se logró principalmente en muestras depositadas en fechas posteriores a 1999, lo que indica una mayor integridad del material genético recuperado de individuos de 19 años de recolección en adelante. Aunque todos los fragmentos evaluados pueden ser empleados como mini-barcode, solo con uno se obtiene una topología similar a la observada con el fragmento completo. Se detectó una gran variacion genética, particularmente al interior de las especies Bombus atratus y B. funebris, en las que se reveló una clara estructura filogeográfica. Conclusiones: Se obtuvieron nuevas secuencias de códigos de barras mediante extracción de ADN y protocolo de amplificación de muestras de museos. Además, se generó nueva información sobre la variabilidad genética intraespecífica, detectando la presencia de haplotipos mitocondriales únicos que podrían constituir Unidades Significativas Evolutivas sujetas a conservación. Dicha información es de vital importancia para formular estrategias de conservación para estos polinizadores en Colombia.</description><identifier>ISSN: 0034-7744</identifier><identifier>EISSN: 2215-2075</identifier><identifier>DOI: 10.15517/rbt.v68i2.36350</identifier><language>spa</language><publisher>Universidad de Costa Rica</publisher><ispartof>Revista de biología tropical, 2020-06, Vol.68 (2), p.394</ispartof><rights>COPYRIGHT 2020 Universidad de Costa Rica</rights><lds50>peer_reviewed</lds50><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed><citedby>FETCH-LOGICAL-c225t-c5de6b7d3f06a40498cfadb9d88ddb89aec2a566c327f3576449af9f340295163</citedby></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Tsyndetics_thumb_exl</thumbnail><link.rule.ids>314,780,784,27924,27925</link.rule.ids></links><search><creatorcontrib>Lotta-Arévalo, Ingrid A</creatorcontrib><creatorcontrib>Vargas-Ramírez, Mario</creatorcontrib><creatorcontrib>Nates-Parra, Guiomar</creatorcontrib><creatorcontrib>Matta, Nubia E</creatorcontrib><creatorcontrib>Ospina Torres, Rodulfo</creatorcontrib><title>Accediendo al pasado: uso de especímenes de colección como fuentes de información genética para el género Bombus (Hymenoptera: Apidae)</title><title>Revista de biología tropical</title><description>Introducción: Recientemente ha tomado relevancia el uso de especímenes de museo como fuente de información genética para desarrollar estudios que resuelven preguntas taxonómicas, ecológicas, demográficas y evolutivas a diversas escalas temporales y geográficas. Sin embargo, material genético obtenido a partir de ejemplares depositados en colecciones biológicas es poco usado, debido al deterioro natural del ADN preservado en dichos ejemplares, de manera que la obtención de material genético de calidad es demandante en términos de tiempo y dinero. Objetivo: Usando material de museo, identificar una secuencia mini-barcode que pueda ser empleada en la determinación taxonómica, y que a su vez suministre información que permita la estimación de relaciones filogenéticas de especies del género Bombus. Métodos: se estandarizó el protocolo de extracción de ADN a partir de la extremidad mesotoracica derecha y/o una muestra de músculo torácico de 96 especímenes depositados en la colección LABUN entre 7 y 38 años atrás. Las diferentes combinaciones de oligonucleótidos evaluadas permitieron amplificar fragmentos de 152 a 407 pares de bases (pb) del gen mitocondrial Cytochrome Oxidase I (COI). Usando como plantilla un grupo de 31 secuencias amplificadas a partir de especímenes recolectados recientemente, los fragmentos obtenidos de los especímenes del museo fueron ensamblados y analizados en un marco filogenético. Además, se realizó un análisis de red de haplotipos para evaluar en detalle las relaciones entre los haplotipos mitocondriales resultantes. Resultados: Se determinó un mayor éxito de extracción de ADN a partir de muestras de extremidad depositadas a partir del año 1982. Entretanto, la amplificación exitosa de fragmentos de más de 300 pares de bases (pb) se logró principalmente en muestras depositadas en fechas posteriores a 1999, lo que indica una mayor integridad del material genético recuperado de individuos de 19 años de recolección en adelante. Aunque todos los fragmentos evaluados pueden ser empleados como mini-barcode, solo con uno se obtiene una topología similar a la observada con el fragmento completo. Se detectó una gran variacion genética, particularmente al interior de las especies Bombus atratus y B. funebris, en las que se reveló una clara estructura filogeográfica. Conclusiones: Se obtuvieron nuevas secuencias de códigos de barras mediante extracción de ADN y protocolo de amplificación de muestras de museos. Además, se generó nueva información sobre la variabilidad genética intraespecífica, detectando la presencia de haplotipos mitocondriales únicos que podrían constituir Unidades Significativas Evolutivas sujetas a conservación. Dicha información es de vital importancia para formular estrategias de conservación para estos polinizadores en Colombia.</description><issn>0034-7744</issn><issn>2215-2075</issn><fulltext>true</fulltext><rsrctype>article</rsrctype><creationdate>2020</creationdate><recordtype>article</recordtype><recordid>eNptUctq20AUHUoLcd3usxzIJlnIHc1LkneOSZOCoZt2La5m7pgpkkbMyAF_Q77Ei6zyCf6xynY2hXIX93EeXDiEXOdskSuVF99iMy6eden5Qmih2Acy4zxXGWeF-khmjAmZFYWUV-RzSn8Y47KSekZeVsag9djbQKGlAySwYUl3KVCLFNOA5vjaYY_ptJvQojH--NZPYxeo22E_XiDfuxA7uIBb7I-H0RuYDCNQbOn2eOgxBnofumaX6O3TfjINw4gRlnQ1eAt494V8ctAm_Pre5-T394df66ds8_Pxx3q1yQznasyMsqibwgrHNEgmq9I4sE1ly9LapqwADQeltRG8cEIVWsoKXOWEZLxSuRZzcnPx3UKL9enxMYLpfDL1Sgudc1mcWYv_sKay2HkTenR-uv8jYBeBiSGliK4eou8g7uuc1eeM6imj-pxRfc5I_AVLQ4nv</recordid><startdate>20200601</startdate><enddate>20200601</enddate><creator>Lotta-Arévalo, Ingrid A</creator><creator>Vargas-Ramírez, Mario</creator><creator>Nates-Parra, Guiomar</creator><creator>Matta, Nubia E</creator><creator>Ospina Torres, Rodulfo</creator><general>Universidad de Costa Rica</general><scope>AAYXX</scope><scope>CITATION</scope><scope>INF</scope></search><sort><creationdate>20200601</creationdate><title>Accediendo al pasado: uso de especímenes de colección como fuentes de información genética para el género Bombus (Hymenoptera: Apidae)</title><author>Lotta-Arévalo, Ingrid A ; Vargas-Ramírez, Mario ; Nates-Parra, Guiomar ; Matta, Nubia E ; Ospina Torres, Rodulfo</author></sort><facets><frbrtype>5</frbrtype><frbrgroupid>cdi_FETCH-LOGICAL-c225t-c5de6b7d3f06a40498cfadb9d88ddb89aec2a566c327f3576449af9f340295163</frbrgroupid><rsrctype>articles</rsrctype><prefilter>articles</prefilter><language>spa</language><creationdate>2020</creationdate><toplevel>peer_reviewed</toplevel><toplevel>online_resources</toplevel><creatorcontrib>Lotta-Arévalo, Ingrid A</creatorcontrib><creatorcontrib>Vargas-Ramírez, Mario</creatorcontrib><creatorcontrib>Nates-Parra, Guiomar</creatorcontrib><creatorcontrib>Matta, Nubia E</creatorcontrib><creatorcontrib>Ospina Torres, Rodulfo</creatorcontrib><collection>CrossRef</collection><collection>Gale OneFile: Informe Academico</collection><jtitle>Revista de biología tropical</jtitle></facets><delivery><delcategory>Remote Search Resource</delcategory><fulltext>fulltext</fulltext></delivery><addata><au>Lotta-Arévalo, Ingrid A</au><au>Vargas-Ramírez, Mario</au><au>Nates-Parra, Guiomar</au><au>Matta, Nubia E</au><au>Ospina Torres, Rodulfo</au><format>journal</format><genre>article</genre><ristype>JOUR</ristype><atitle>Accediendo al pasado: uso de especímenes de colección como fuentes de información genética para el género Bombus (Hymenoptera: Apidae)</atitle><jtitle>Revista de biología tropical</jtitle><date>2020-06-01</date><risdate>2020</risdate><volume>68</volume><issue>2</issue><spage>394</spage><pages>394-</pages><issn>0034-7744</issn><eissn>2215-2075</eissn><abstract>Introducción: Recientemente ha tomado relevancia el uso de especímenes de museo como fuente de información genética para desarrollar estudios que resuelven preguntas taxonómicas, ecológicas, demográficas y evolutivas a diversas escalas temporales y geográficas. Sin embargo, material genético obtenido a partir de ejemplares depositados en colecciones biológicas es poco usado, debido al deterioro natural del ADN preservado en dichos ejemplares, de manera que la obtención de material genético de calidad es demandante en términos de tiempo y dinero. Objetivo: Usando material de museo, identificar una secuencia mini-barcode que pueda ser empleada en la determinación taxonómica, y que a su vez suministre información que permita la estimación de relaciones filogenéticas de especies del género Bombus. Métodos: se estandarizó el protocolo de extracción de ADN a partir de la extremidad mesotoracica derecha y/o una muestra de músculo torácico de 96 especímenes depositados en la colección LABUN entre 7 y 38 años atrás. Las diferentes combinaciones de oligonucleótidos evaluadas permitieron amplificar fragmentos de 152 a 407 pares de bases (pb) del gen mitocondrial Cytochrome Oxidase I (COI). Usando como plantilla un grupo de 31 secuencias amplificadas a partir de especímenes recolectados recientemente, los fragmentos obtenidos de los especímenes del museo fueron ensamblados y analizados en un marco filogenético. Además, se realizó un análisis de red de haplotipos para evaluar en detalle las relaciones entre los haplotipos mitocondriales resultantes. Resultados: Se determinó un mayor éxito de extracción de ADN a partir de muestras de extremidad depositadas a partir del año 1982. Entretanto, la amplificación exitosa de fragmentos de más de 300 pares de bases (pb) se logró principalmente en muestras depositadas en fechas posteriores a 1999, lo que indica una mayor integridad del material genético recuperado de individuos de 19 años de recolección en adelante. Aunque todos los fragmentos evaluados pueden ser empleados como mini-barcode, solo con uno se obtiene una topología similar a la observada con el fragmento completo. Se detectó una gran variacion genética, particularmente al interior de las especies Bombus atratus y B. funebris, en las que se reveló una clara estructura filogeográfica. Conclusiones: Se obtuvieron nuevas secuencias de códigos de barras mediante extracción de ADN y protocolo de amplificación de muestras de museos. Además, se generó nueva información sobre la variabilidad genética intraespecífica, detectando la presencia de haplotipos mitocondriales únicos que podrían constituir Unidades Significativas Evolutivas sujetas a conservación. Dicha información es de vital importancia para formular estrategias de conservación para estos polinizadores en Colombia.</abstract><pub>Universidad de Costa Rica</pub><doi>10.15517/rbt.v68i2.36350</doi></addata></record> |
fulltext | fulltext |
identifier | ISSN: 0034-7744 |
ispartof | Revista de biología tropical, 2020-06, Vol.68 (2), p.394 |
issn | 0034-7744 2215-2075 |
language | spa |
recordid | cdi_gale_infotracmisc_A636124716 |
source | EZB-FREE-00999 freely available EZB journals |
title | Accediendo al pasado: uso de especímenes de colección como fuentes de información genética para el género Bombus (Hymenoptera: Apidae) |
url | https://sfx.bib-bvb.de/sfx_tum?ctx_ver=Z39.88-2004&ctx_enc=info:ofi/enc:UTF-8&ctx_tim=2024-12-31T00%3A09%3A24IST&url_ver=Z39.88-2004&url_ctx_fmt=infofi/fmt:kev:mtx:ctx&rfr_id=info:sid/primo.exlibrisgroup.com:primo3-Article-gale_cross&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:journal&rft.genre=article&rft.atitle=Accediendo%20al%20pasado:%20uso%20de%20espec%C3%ADmenes%20de%20colecci%C3%B3n%20como%20fuentes%20de%20informaci%C3%B3n%20gen%C3%A9tica%20para%20el%20g%C3%A9nero%20Bombus%20(Hymenoptera:%20Apidae)&rft.jtitle=Revista%20de%20biolog%C3%ADa%20tropical&rft.au=Lotta-Ar%C3%A9valo,%20Ingrid%20A&rft.date=2020-06-01&rft.volume=68&rft.issue=2&rft.spage=394&rft.pages=394-&rft.issn=0034-7744&rft.eissn=2215-2075&rft_id=info:doi/10.15517/rbt.v68i2.36350&rft_dat=%3Cgale_cross%3EA636124716%3C/gale_cross%3E%3Curl%3E%3C/url%3E&disable_directlink=true&sfx.directlink=off&sfx.report_link=0&rft_id=info:oai/&rft_id=info:pmid/&rft_galeid=A636124716&rfr_iscdi=true |