Diversidad y estructura genetica del genero monotipico Colombobalanus en el sureste de los Andes colombianos
Colombobalanus es un genero monotipico con una unica especie Colombobalanus excelsa, que se encuentra presente en cinco localidades de los andes de Colombia y actualmente esta categorizada como vulnerable (VU). Analizamos la diversidad y estructura genetica de poblaciones de C. excelsa localizadas e...
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Veröffentlicht in: | Caldasia 2013-01, Vol.35 (1), p.123 |
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Format: | Artikel |
Sprache: | spa |
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creator | Aguirre-Acosta, Natalia Palacio-MejÃa, Juan D Barrios-Leal, Dora J Botero-Echeverry, Jorge E |
description | Colombobalanus es un genero monotipico con una unica especie Colombobalanus excelsa, que se encuentra presente en cinco localidades de los andes de Colombia y actualmente esta categorizada como vulnerable (VU). Analizamos la diversidad y estructura genetica de poblaciones de C. excelsa localizadas en cuatro remanentes de bosque que se encuentran ubicados en una region cafetera en el departamento del Huila, Colombia. Fueron colectadas muestras de 10 arboles de cada remanente de bosque para un total de 40 muestras que fueron analizadas utilizando 7 marcadores microsatelites. Los analisis realizados fueron, diversidad genetica ([H.sub.e]), estructura genetica ([F.sub.ST]), distancia genetica, y el indice de similaridad de Jaccard. Catorce alelos fueron encontrados para la poblacion, con una heterocigocidad de ([H.sub.e]) of 0.2797 y una estructura genetica de ([F.sub.ST]) of 0.049. Los valores de diversidad genetica y las diferencias entre las poblaciones estudiadas en terminos de distancia y estructura, al igual que el indice de similaridad, sugieren que los cuatro remanentes de bosque pertenecieron a una poblacion panmitica de C. excelsa que tuvo un flujo genetico continuo en un pasado reciente. Los resultados ademas nos permiten concluir que la poca cantidad de alelos encontrados en estas poblaciones con respecto a otras poblaciones del pais, podria estar indicando un clasico cuello de botella en estos remanentes de bosque, donde quedan pocos individuos semilleros de C. excelsa como consecuencia de los disturbios causados por la actividad humana. Palabras clave. Conservation genetica, microsatelites, especie endemica, genetica de poblaciones, arboles tropicales. Colombobalanus is a genus with a single species Colombobalanus excelsa, currently categorized as vulnerable (VU) and known from only five localities in the Colombian Andes. We analyzed the diversity and genetic structure of four C. excelsa forest remnants in one locality in the coffee-producing area of the southeastern corner of Department of Huila, Colombia. Samples from ten trees were collected from each forest remnant for a total of 40 sample leaves, which were analyzed using 7 microsatellite markers. The resulting data matrix was used to perform genetic diversity ([H.sub.e]), genetic structure ([F.sub.ST]), and genetic distance analyses, as well as the Jaccard similarity index. Fourteen alleles were found for the entire population, with a heterozygosity ([H.sub.e]) of 0.2797 and a genetic struc |
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Analizamos la diversidad y estructura genetica de poblaciones de C. excelsa localizadas en cuatro remanentes de bosque que se encuentran ubicados en una region cafetera en el departamento del Huila, Colombia. Fueron colectadas muestras de 10 arboles de cada remanente de bosque para un total de 40 muestras que fueron analizadas utilizando 7 marcadores microsatelites. Los analisis realizados fueron, diversidad genetica ([H.sub.e]), estructura genetica ([F.sub.ST]), distancia genetica, y el indice de similaridad de Jaccard. Catorce alelos fueron encontrados para la poblacion, con una heterocigocidad de ([H.sub.e]) of 0.2797 y una estructura genetica de ([F.sub.ST]) of 0.049. Los valores de diversidad genetica y las diferencias entre las poblaciones estudiadas en terminos de distancia y estructura, al igual que el indice de similaridad, sugieren que los cuatro remanentes de bosque pertenecieron a una poblacion panmitica de C. excelsa que tuvo un flujo genetico continuo en un pasado reciente. Los resultados ademas nos permiten concluir que la poca cantidad de alelos encontrados en estas poblaciones con respecto a otras poblaciones del pais, podria estar indicando un clasico cuello de botella en estos remanentes de bosque, donde quedan pocos individuos semilleros de C. excelsa como consecuencia de los disturbios causados por la actividad humana. Palabras clave. Conservation genetica, microsatelites, especie endemica, genetica de poblaciones, arboles tropicales. Colombobalanus is a genus with a single species Colombobalanus excelsa, currently categorized as vulnerable (VU) and known from only five localities in the Colombian Andes. We analyzed the diversity and genetic structure of four C. excelsa forest remnants in one locality in the coffee-producing area of the southeastern corner of Department of Huila, Colombia. Samples from ten trees were collected from each forest remnant for a total of 40 sample leaves, which were analyzed using 7 microsatellite markers. The resulting data matrix was used to perform genetic diversity ([H.sub.e]), genetic structure ([F.sub.ST]), and genetic distance analyses, as well as the Jaccard similarity index. Fourteen alleles were found for the entire population, with a heterozygosity ([H.sub.e]) of 0.2797 and a genetic structure ([F.sub.ST]) of 0.049. These indices suggest that the forest remnants are members of a panmictic population with historical patterns of genetic flow. The results also allow us to conclude that the low number of alleles found in these populations compared with other populations in the country show a signature of historical bottleneck in these forest remnants, where few individuals were seedlings of C. excelsa due to the disturbances caused by human activity. Key words. Conservation genetics, microsatellites, endemic species, population genetics, tropical trees.</description><identifier>ISSN: 0366-5232</identifier><language>spa</language><publisher>Universidad Nacional de Colombia, Instituto de Ciencias</publisher><ispartof>Caldasia, 2013-01, Vol.35 (1), p.123</ispartof><rights>COPYRIGHT 2013 Universidad Nacional de Colombia, Instituto de Ciencias</rights><lds50>peer_reviewed</lds50><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Tsyndetics_thumb_exl</thumbnail><link.rule.ids>314,778,782</link.rule.ids></links><search><creatorcontrib>Aguirre-Acosta, Natalia</creatorcontrib><creatorcontrib>Palacio-MejÃa, Juan D</creatorcontrib><creatorcontrib>Barrios-Leal, Dora J</creatorcontrib><creatorcontrib>Botero-Echeverry, Jorge E</creatorcontrib><title>Diversidad y estructura genetica del genero monotipico Colombobalanus en el sureste de los Andes colombianos</title><title>Caldasia</title><description>Colombobalanus es un genero monotipico con una unica especie Colombobalanus excelsa, que se encuentra presente en cinco localidades de los andes de Colombia y actualmente esta categorizada como vulnerable (VU). Analizamos la diversidad y estructura genetica de poblaciones de C. excelsa localizadas en cuatro remanentes de bosque que se encuentran ubicados en una region cafetera en el departamento del Huila, Colombia. Fueron colectadas muestras de 10 arboles de cada remanente de bosque para un total de 40 muestras que fueron analizadas utilizando 7 marcadores microsatelites. Los analisis realizados fueron, diversidad genetica ([H.sub.e]), estructura genetica ([F.sub.ST]), distancia genetica, y el indice de similaridad de Jaccard. Catorce alelos fueron encontrados para la poblacion, con una heterocigocidad de ([H.sub.e]) of 0.2797 y una estructura genetica de ([F.sub.ST]) of 0.049. Los valores de diversidad genetica y las diferencias entre las poblaciones estudiadas en terminos de distancia y estructura, al igual que el indice de similaridad, sugieren que los cuatro remanentes de bosque pertenecieron a una poblacion panmitica de C. excelsa que tuvo un flujo genetico continuo en un pasado reciente. Los resultados ademas nos permiten concluir que la poca cantidad de alelos encontrados en estas poblaciones con respecto a otras poblaciones del pais, podria estar indicando un clasico cuello de botella en estos remanentes de bosque, donde quedan pocos individuos semilleros de C. excelsa como consecuencia de los disturbios causados por la actividad humana. Palabras clave. Conservation genetica, microsatelites, especie endemica, genetica de poblaciones, arboles tropicales. Colombobalanus is a genus with a single species Colombobalanus excelsa, currently categorized as vulnerable (VU) and known from only five localities in the Colombian Andes. We analyzed the diversity and genetic structure of four C. excelsa forest remnants in one locality in the coffee-producing area of the southeastern corner of Department of Huila, Colombia. Samples from ten trees were collected from each forest remnant for a total of 40 sample leaves, which were analyzed using 7 microsatellite markers. The resulting data matrix was used to perform genetic diversity ([H.sub.e]), genetic structure ([F.sub.ST]), and genetic distance analyses, as well as the Jaccard similarity index. Fourteen alleles were found for the entire population, with a heterozygosity ([H.sub.e]) of 0.2797 and a genetic structure ([F.sub.ST]) of 0.049. These indices suggest that the forest remnants are members of a panmictic population with historical patterns of genetic flow. The results also allow us to conclude that the low number of alleles found in these populations compared with other populations in the country show a signature of historical bottleneck in these forest remnants, where few individuals were seedlings of C. excelsa due to the disturbances caused by human activity. Key words. 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Analizamos la diversidad y estructura genetica de poblaciones de C. excelsa localizadas en cuatro remanentes de bosque que se encuentran ubicados en una region cafetera en el departamento del Huila, Colombia. Fueron colectadas muestras de 10 arboles de cada remanente de bosque para un total de 40 muestras que fueron analizadas utilizando 7 marcadores microsatelites. Los analisis realizados fueron, diversidad genetica ([H.sub.e]), estructura genetica ([F.sub.ST]), distancia genetica, y el indice de similaridad de Jaccard. Catorce alelos fueron encontrados para la poblacion, con una heterocigocidad de ([H.sub.e]) of 0.2797 y una estructura genetica de ([F.sub.ST]) of 0.049. Los valores de diversidad genetica y las diferencias entre las poblaciones estudiadas en terminos de distancia y estructura, al igual que el indice de similaridad, sugieren que los cuatro remanentes de bosque pertenecieron a una poblacion panmitica de C. excelsa que tuvo un flujo genetico continuo en un pasado reciente. Los resultados ademas nos permiten concluir que la poca cantidad de alelos encontrados en estas poblaciones con respecto a otras poblaciones del pais, podria estar indicando un clasico cuello de botella en estos remanentes de bosque, donde quedan pocos individuos semilleros de C. excelsa como consecuencia de los disturbios causados por la actividad humana. Palabras clave. Conservation genetica, microsatelites, especie endemica, genetica de poblaciones, arboles tropicales. Colombobalanus is a genus with a single species Colombobalanus excelsa, currently categorized as vulnerable (VU) and known from only five localities in the Colombian Andes. We analyzed the diversity and genetic structure of four C. excelsa forest remnants in one locality in the coffee-producing area of the southeastern corner of Department of Huila, Colombia. Samples from ten trees were collected from each forest remnant for a total of 40 sample leaves, which were analyzed using 7 microsatellite markers. The resulting data matrix was used to perform genetic diversity ([H.sub.e]), genetic structure ([F.sub.ST]), and genetic distance analyses, as well as the Jaccard similarity index. Fourteen alleles were found for the entire population, with a heterozygosity ([H.sub.e]) of 0.2797 and a genetic structure ([F.sub.ST]) of 0.049. These indices suggest that the forest remnants are members of a panmictic population with historical patterns of genetic flow. The results also allow us to conclude that the low number of alleles found in these populations compared with other populations in the country show a signature of historical bottleneck in these forest remnants, where few individuals were seedlings of C. excelsa due to the disturbances caused by human activity. Key words. Conservation genetics, microsatellites, endemic species, population genetics, tropical trees.</abstract><pub>Universidad Nacional de Colombia, Instituto de Ciencias</pub></addata></record> |
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