Identidade molecular dos fitoplasmas associados aos enfezamentos do tomateiro e da berinjela com base na análise do gene 16S rDNA
Doenças de hortaliças de ocorrência no território brasileiro e em outras áreas do mundo têm sido associadas a diversos fitoplasmas. Na região de Piracicaba-SP e Bragança Paulista-SP, em plantas de tomate e berinjela foram observados sintomas típicos de enfezamento caracterizados por porte reduzido,...
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Veröffentlicht in: | Summa phytopathologica 2007, Vol.33 (3) |
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Sprache: | por |
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creator | Mello, Ana Paula de Oliveira Amaral(USP ESALQ Setor de Fitopatologia) Bedendo, Ivan Paulo(USP ESALQ Setor de Fitopatologia) Camargo, Luís Eduardo Aranha de(USP ESALQ Setor de Fitopatologia) |
description | Doenças de hortaliças de ocorrência no território brasileiro e em outras áreas do mundo têm sido associadas a diversos fitoplasmas. Na região de Piracicaba-SP e Bragança Paulista-SP, em plantas de tomate e berinjela foram observados sintomas típicos de enfezamento caracterizados por porte reduzido, clorose foliar, superbrotamento de ramos, desenvolvimento anormal do cálice, encurtamento de entre-nós, redução no tamanho de folhas, flores e frutos. Através de duplo PCR, utilizando os iniciadores R16 mF1/mR2 e R16 F2n/R2, fragmentos de DNA de 1,2 kb foram amplificados de amostras sintomáticas, demonstrando a presença de fitoplasma nos tecidos das plantas. O uso de iniciadores específicos demonstrou que estes fitoplasmas eram afiliados ao grupo 16SrIII. Análises de RFLP, usando as enzimas de restrição AluI, HpaII, KpnI, MboI, MseI e RsaI confirmaram que os fitoplasmas detectados eram representantes do grupo 16SrIII. Os fragmentos de DNA amplificados foram clonados em Escherichia coli, sequenciados e comparados, por homologia de seqüência, entre si e com outros fitoplasmas do grupo 16SrIII. Um índice de similaridade de seqüência acima de 95% foi encontrado quando seqüências dos fitoplasmas detectados em tomate e berinjela foram comparadas com aquelas de outros representantes do grupo 16SrIII. Um índice de 98-99% foi obtido quando seqüências dos fitoplasmas encontrados em tomate e berinjela foram comparadas entre si. Estes resultados evidenciaram que o enfezamento do tomateiro e da berinjela podem estar associados a um mesmo fitoplasma, com base na análise de seqüências do gene do 16S rDNA.
Vegetable diseases occurring in the Brazilian territory and around the world have been associated with various phytoplasmas. In the region of Piracicaba-SP and Bragança-SP, in eggplant and tomato plants typical symptoms of stunting characterized by reduced canopy, leaf yellowing, proliferation of shoots, calix malformation, shortening internodes, reduced size of leaves, flowers and fruits were observed. In nested PCR with primers R16 mF1/mR2 e R16 F2n/R2, fragments of 1.2kb in size were amplified from symptomatic samples demonstrating the presence of phytoplasmas in plant tissues. By using especific primers pairs it was demonstrated that the phytoplasmas were affiliated to group 16SrIII. RFLP analysis using the restriction enzymes AluI, HpaII, KpnI, MboI, MseI, and RsaI confirmed that the phytoplasmas were representatives of group 16SrIII. Amplified DNA fragments were cloned |
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Vegetable diseases occurring in the Brazilian territory and around the world have been associated with various phytoplasmas. In the region of Piracicaba-SP and Bragança-SP, in eggplant and tomato plants typical symptoms of stunting characterized by reduced canopy, leaf yellowing, proliferation of shoots, calix malformation, shortening internodes, reduced size of leaves, flowers and fruits were observed. In nested PCR with primers R16 mF1/mR2 e R16 F2n/R2, fragments of 1.2kb in size were amplified from symptomatic samples demonstrating the presence of phytoplasmas in plant tissues. By using especific primers pairs it was demonstrated that the phytoplasmas were affiliated to group 16SrIII. RFLP analysis using the restriction enzymes AluI, HpaII, KpnI, MboI, MseI, and RsaI confirmed that the phytoplasmas were representatives of group 16SrIII. Amplified DNA fragments were cloned in Escherichia coli, sequenced and compared by sequence similarities among themselves and with sequences belonging to phytoplasmas of group 16SrIII. Sequence similarities greater than 95% were found when the phytoplamas detected in tomato and eggplant were compared to the representatives of group 16SrIII. Values of 98-99% were obtained when sequences of phytoplasmas found in tomato and eggplant were compared among themselves. The results evidenced that tomato and eggplant stunting were associated with the same phytoplasma based upon the sequencing of the 16S rDNA gene.</description><identifier>ISSN: 0100-5405</identifier><language>por</language><publisher>Grupo Paulista de Fitopatologia</publisher><subject>amarelos ; cálice gigante ; giant calix ; Mollicutes ; yellows</subject><ispartof>Summa phytopathologica, 2007, Vol.33 (3)</ispartof><lds50>peer_reviewed</lds50><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Tsyndetics_thumb_exl</thumbnail><link.rule.ids>314,776,780,4010</link.rule.ids></links><search><creatorcontrib>Mello, Ana Paula de Oliveira Amaral(USP ESALQ Setor de Fitopatologia)</creatorcontrib><creatorcontrib>Bedendo, Ivan Paulo(USP ESALQ Setor de Fitopatologia)</creatorcontrib><creatorcontrib>Camargo, Luís Eduardo Aranha de(USP ESALQ Setor de Fitopatologia)</creatorcontrib><title>Identidade molecular dos fitoplasmas associados aos enfezamentos do tomateiro e da berinjela com base na análise do gene 16S rDNA</title><title>Summa phytopathologica</title><description>Doenças de hortaliças de ocorrência no território brasileiro e em outras áreas do mundo têm sido associadas a diversos fitoplasmas. Na região de Piracicaba-SP e Bragança Paulista-SP, em plantas de tomate e berinjela foram observados sintomas típicos de enfezamento caracterizados por porte reduzido, clorose foliar, superbrotamento de ramos, desenvolvimento anormal do cálice, encurtamento de entre-nós, redução no tamanho de folhas, flores e frutos. Através de duplo PCR, utilizando os iniciadores R16 mF1/mR2 e R16 F2n/R2, fragmentos de DNA de 1,2 kb foram amplificados de amostras sintomáticas, demonstrando a presença de fitoplasma nos tecidos das plantas. O uso de iniciadores específicos demonstrou que estes fitoplasmas eram afiliados ao grupo 16SrIII. Análises de RFLP, usando as enzimas de restrição AluI, HpaII, KpnI, MboI, MseI e RsaI confirmaram que os fitoplasmas detectados eram representantes do grupo 16SrIII. Os fragmentos de DNA amplificados foram clonados em Escherichia coli, sequenciados e comparados, por homologia de seqüência, entre si e com outros fitoplasmas do grupo 16SrIII. Um índice de similaridade de seqüência acima de 95% foi encontrado quando seqüências dos fitoplasmas detectados em tomate e berinjela foram comparadas com aquelas de outros representantes do grupo 16SrIII. Um índice de 98-99% foi obtido quando seqüências dos fitoplasmas encontrados em tomate e berinjela foram comparadas entre si. Estes resultados evidenciaram que o enfezamento do tomateiro e da berinjela podem estar associados a um mesmo fitoplasma, com base na análise de seqüências do gene do 16S rDNA.
Vegetable diseases occurring in the Brazilian territory and around the world have been associated with various phytoplasmas. In the region of Piracicaba-SP and Bragança-SP, in eggplant and tomato plants typical symptoms of stunting characterized by reduced canopy, leaf yellowing, proliferation of shoots, calix malformation, shortening internodes, reduced size of leaves, flowers and fruits were observed. In nested PCR with primers R16 mF1/mR2 e R16 F2n/R2, fragments of 1.2kb in size were amplified from symptomatic samples demonstrating the presence of phytoplasmas in plant tissues. By using especific primers pairs it was demonstrated that the phytoplasmas were affiliated to group 16SrIII. RFLP analysis using the restriction enzymes AluI, HpaII, KpnI, MboI, MseI, and RsaI confirmed that the phytoplasmas were representatives of group 16SrIII. Amplified DNA fragments were cloned in Escherichia coli, sequenced and compared by sequence similarities among themselves and with sequences belonging to phytoplasmas of group 16SrIII. Sequence similarities greater than 95% were found when the phytoplamas detected in tomato and eggplant were compared to the representatives of group 16SrIII. Values of 98-99% were obtained when sequences of phytoplasmas found in tomato and eggplant were compared among themselves. The results evidenced that tomato and eggplant stunting were associated with the same phytoplasma based upon the sequencing of the 16S rDNA gene.</description><subject>amarelos</subject><subject>cálice gigante</subject><subject>giant calix</subject><subject>Mollicutes</subject><subject>yellows</subject><issn>0100-5405</issn><fulltext>true</fulltext><rsrctype>article</rsrctype><creationdate>2007</creationdate><recordtype>article</recordtype><recordid>eNotjE1OwzAUhLMAqaX0CEjvApGe7dimy6r8Vapg0S7YVc_xc-XKiVEcNiy5CWfhYgTBYvTNjDRzUc1RINa6QT2rrko5I2phpZ5Xn1vP_Rg9eYYuJ27fEw3gc4EQx_yWqHRUgErJbaTfmiZxH_iDumk4BZ9hzB2NHIcMDJ7A8RD7MyeCNnfgqDD0BNR_f6U4-Wlw4p5BmD0Md8_r6-oyUCq8_OeiOjzcHzZP9e7lcbtZ7-qwkmNNbAShczZo9Fop3YYmaCOcZNU03ApnpF3ZRjB6NhjIe6MnOmnJGKvVorr5uw2Uj3QaYjm-7iWiVRIV3qof-YpZSQ</recordid><startdate>2007</startdate><enddate>2007</enddate><creator>Mello, Ana Paula de Oliveira Amaral(USP ESALQ Setor de Fitopatologia)</creator><creator>Bedendo, Ivan Paulo(USP ESALQ Setor de Fitopatologia)</creator><creator>Camargo, Luís Eduardo Aranha de(USP ESALQ Setor de Fitopatologia)</creator><general>Grupo Paulista de Fitopatologia</general><scope>FBQ</scope></search><sort><creationdate>2007</creationdate><title>Identidade molecular dos fitoplasmas associados aos enfezamentos do tomateiro e da berinjela com base na análise do gene 16S rDNA</title><author>Mello, Ana Paula de Oliveira Amaral(USP ESALQ Setor de Fitopatologia) ; Bedendo, Ivan Paulo(USP ESALQ Setor de Fitopatologia) ; Camargo, Luís Eduardo Aranha de(USP ESALQ Setor de Fitopatologia)</author></sort><facets><frbrtype>5</frbrtype><frbrgroupid>cdi_FETCH-LOGICAL-f92t-ae61a0bb7f50d5335cf4f561b2e344ec1b6279741e0de60fadd6560fb27a66753</frbrgroupid><rsrctype>articles</rsrctype><prefilter>articles</prefilter><language>por</language><creationdate>2007</creationdate><topic>amarelos</topic><topic>cálice gigante</topic><topic>giant calix</topic><topic>Mollicutes</topic><topic>yellows</topic><toplevel>peer_reviewed</toplevel><toplevel>online_resources</toplevel><creatorcontrib>Mello, Ana Paula de Oliveira Amaral(USP ESALQ Setor de Fitopatologia)</creatorcontrib><creatorcontrib>Bedendo, Ivan Paulo(USP ESALQ Setor de Fitopatologia)</creatorcontrib><creatorcontrib>Camargo, Luís Eduardo Aranha de(USP ESALQ Setor de Fitopatologia)</creatorcontrib><collection>AGRIS</collection><jtitle>Summa phytopathologica</jtitle></facets><delivery><delcategory>Remote Search Resource</delcategory><fulltext>fulltext</fulltext></delivery><addata><au>Mello, Ana Paula de Oliveira Amaral(USP ESALQ Setor de Fitopatologia)</au><au>Bedendo, Ivan Paulo(USP ESALQ Setor de Fitopatologia)</au><au>Camargo, Luís Eduardo Aranha de(USP ESALQ Setor de Fitopatologia)</au><format>journal</format><genre>article</genre><ristype>JOUR</ristype><atitle>Identidade molecular dos fitoplasmas associados aos enfezamentos do tomateiro e da berinjela com base na análise do gene 16S rDNA</atitle><jtitle>Summa phytopathologica</jtitle><date>2007</date><risdate>2007</risdate><volume>33</volume><issue>3</issue><issn>0100-5405</issn><abstract>Doenças de hortaliças de ocorrência no território brasileiro e em outras áreas do mundo têm sido associadas a diversos fitoplasmas. Na região de Piracicaba-SP e Bragança Paulista-SP, em plantas de tomate e berinjela foram observados sintomas típicos de enfezamento caracterizados por porte reduzido, clorose foliar, superbrotamento de ramos, desenvolvimento anormal do cálice, encurtamento de entre-nós, redução no tamanho de folhas, flores e frutos. Através de duplo PCR, utilizando os iniciadores R16 mF1/mR2 e R16 F2n/R2, fragmentos de DNA de 1,2 kb foram amplificados de amostras sintomáticas, demonstrando a presença de fitoplasma nos tecidos das plantas. O uso de iniciadores específicos demonstrou que estes fitoplasmas eram afiliados ao grupo 16SrIII. Análises de RFLP, usando as enzimas de restrição AluI, HpaII, KpnI, MboI, MseI e RsaI confirmaram que os fitoplasmas detectados eram representantes do grupo 16SrIII. Os fragmentos de DNA amplificados foram clonados em Escherichia coli, sequenciados e comparados, por homologia de seqüência, entre si e com outros fitoplasmas do grupo 16SrIII. Um índice de similaridade de seqüência acima de 95% foi encontrado quando seqüências dos fitoplasmas detectados em tomate e berinjela foram comparadas com aquelas de outros representantes do grupo 16SrIII. Um índice de 98-99% foi obtido quando seqüências dos fitoplasmas encontrados em tomate e berinjela foram comparadas entre si. Estes resultados evidenciaram que o enfezamento do tomateiro e da berinjela podem estar associados a um mesmo fitoplasma, com base na análise de seqüências do gene do 16S rDNA.
Vegetable diseases occurring in the Brazilian territory and around the world have been associated with various phytoplasmas. In the region of Piracicaba-SP and Bragança-SP, in eggplant and tomato plants typical symptoms of stunting characterized by reduced canopy, leaf yellowing, proliferation of shoots, calix malformation, shortening internodes, reduced size of leaves, flowers and fruits were observed. In nested PCR with primers R16 mF1/mR2 e R16 F2n/R2, fragments of 1.2kb in size were amplified from symptomatic samples demonstrating the presence of phytoplasmas in plant tissues. By using especific primers pairs it was demonstrated that the phytoplasmas were affiliated to group 16SrIII. RFLP analysis using the restriction enzymes AluI, HpaII, KpnI, MboI, MseI, and RsaI confirmed that the phytoplasmas were representatives of group 16SrIII. Amplified DNA fragments were cloned in Escherichia coli, sequenced and compared by sequence similarities among themselves and with sequences belonging to phytoplasmas of group 16SrIII. Sequence similarities greater than 95% were found when the phytoplamas detected in tomato and eggplant were compared to the representatives of group 16SrIII. Values of 98-99% were obtained when sequences of phytoplasmas found in tomato and eggplant were compared among themselves. The results evidenced that tomato and eggplant stunting were associated with the same phytoplasma based upon the sequencing of the 16S rDNA gene.</abstract><pub>Grupo Paulista de Fitopatologia</pub></addata></record> |
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ispartof | Summa phytopathologica, 2007, Vol.33 (3) |
issn | 0100-5405 |
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source | Elektronische Zeitschriftenbibliothek - Frei zugängliche E-Journals |
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