PREDICTING EFFECTS OF GENE REGULATORY SEQUENCES ON ENDOPHENOTYPES USING MACHINE LEARNING

A method for generating a gene regulatory sequence with a desired endophenotype profile includes obtaining a plurality of gene regulatory sequences and inputting the plurality of gene regulatory sequences into a machine-learning model trained to obtain a plurality of effect predictions corresponding...

Ausführliche Beschreibung

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Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser:	KREMLING, Karl Anton Grothe, ALTMAN, Ross Everett
Format:	Patent
Sprache:	eng ; fre
Schlagworte:	BEER BIOCHEMISTRY CALCULATING CHEMISTRY COMPOSITIONS THEREOF COMPUTER SYSTEMS BASED ON SPECIFIC COMPUTATIONAL MODELS COMPUTING COUNTING CULTURE MEDIA ENZYMOLOGY INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTEDFOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS METALLURGY MICROBIOLOGY MICROORGANISMS OR ENZYMES MUTATION OR GENETIC ENGINEERING PHYSICS PROPAGATING, PRESERVING OR MAINTAINING MICROORGANISMS SPIRITS VINEGAR WINE
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Beschreibung
Zusammenfassung:	A method for generating a gene regulatory sequence with a desired endophenotype profile includes obtaining a plurality of gene regulatory sequences and inputting the plurality of gene regulatory sequences into a machine-learning model trained to obtain a plurality of effect predictions corresponding to a plurality of endophenotypes. The method further includes selecting one or more desired endophenotypes based on the plurality of endophenotypes and selecting a gene regulatory sequence in accordance with the one or more desired endophenotypes. Un procédé de génération d'une séquence de régulation de gène ayant un profil d'endophénotype souhaité consiste à obtenir une pluralité de séquences de régulation de gène et à entrer la pluralité de séquences de régulation de gène dans un modèle d'apprentissage automatique entraîné pour obtenir une pluralité de prédictions d'effet correspondant à une pluralité d'endophénotypes. Le procédé consiste en outre à sélectionner un ou de plusieurs endophénotypes souhaités sur la base de la pluralité d'endophénotypes et à sélectionner une séquence de régulation de gène conformément au ou aux endophénotypes souhaités.