SYSTEMS AND METHODS FOR ASSESSING AND IMPROVING THE QUALITY OF MULTIPLEX MOLECULAR ASSAYS

A method of identifying extant proteins, including (a) inputting to a computer processor: (i) a plurality of empirical binding profiles, individual empirical binding profiles including empirical binding outcomes for binding of an extant protein to a plurality of different affinity reagents, (ii) a plurality of candidate outcome profiles, individual candidate outcome profiles including binding outcomes for binding of a candidate protein to the plurality of different affinity reagents, and (iii) a plurality of pseudo outcome profiles, individual pseudo outcome profiles including a rearrangement of a candidate outcome profile; (b) performing a process in the computer processor to identify extant proteins based on the empirical binding profiles of the extant proteins and the plurality of candidate outcome profiles; and (c) performing a process in the computer processor to determine a false discovery statistic for the extant proteins based on the plurality of pseudo outcome profiles. L'invention concerne un procédé d'identification de protéines existantes, comprenant les étapes consistant à (a) entrer dans un processeur informatique : (i) une pluralité de profils de liaison empiriques, des profils de liaison empiriques individuels comprenant des résultats de liaison empiriques pour la liaison d'une protéine existante à une pluralité de réactifs d'affinité différents, (ii) une pluralité de profils de résultat candidats, de profils de résultat candidats individuels comprenant des résultats de liaison pour la liaison d'une protéine candidate à la pluralité de réactifs d'affinité différents, et (iii) une pluralité de profils de pseudo-résultat, des profils de pseudo-résultat individuels comprenant un réarrangement d'un profil de résultat candidat ; (b) à réaliser un processus dans le processeur informatique pour identifier des protéines existantes sur la base des profils de liaison empiriques des protéines existantes et de la pluralité de profils de résultat candidats ; et (c) à réaliser un processus dans le processeur informatique pour déterminer une statistique de fausse découverte pour les protéines existantes sur la base de la pluralité de pseudo-profils de résultat.