METHOD AND KIT FOR MULTIPLEX ANALYSIS OF RAPIDLY MUTATING Y-CHROMOSOME SHORT TANDEM REPEATS

The invention relates to a method and kit for multiplex analysis of rapidly mutating Y-chromosome short tandem repeats (RM-YSTRs) and more specifically, but not exclusively, to the analysis of multiple RM-YSTRs at specific loci on the Y-chromosome. In accordance with a first aspect of the invention...

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Hauptverfasser: MOHAMMAD ALBASTAKI, Abdulla, AHMAD LOOTAH, Reem, OBAID ALMARRI, Iman, ZHANG, Yueke, HAMDAN ALGHAFRI, Rashid, SAMI ALREYAMI, Afra, NAJI, Mohammad, YU, Zailiang, MATAR ALMEZAINA, Reem, LIU, Lin, XU, Shuxin
Format: Patent
Sprache:eng ; fre
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AHMAD LOOTAH, Reem
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description The invention relates to a method and kit for multiplex analysis of rapidly mutating Y-chromosome short tandem repeats (RM-YSTRs) and more specifically, but not exclusively, to the analysis of multiple RM-YSTRs at specific loci on the Y-chromosome. In accordance with a first aspect of the invention there is provided a method for detecting the presence of multiple rapidly mutating Y-chromosome short tandem repeats (RM Y-STRs) in a sample including providing the sample containing DNA, providing 27 primer pairs developed to bind to the RM Y-STRs at 25 loci in the sample, performing a polymerase chain reaction (PCR) to co-amplify the RM Y-STRs in the sample, and comparing the PCR products with reference values representative of different RM Y-STRs to determine the RM Y-STRs present in the sample. L'invention concerne un procédé et un kit pour l'analyse multiplex de répétitions en tandem courtes du chromosome Y à mutation rapide (RM-YSTR) et plus particulièrement, mais pas exclusivement, l'analyse de RM-YSTR multiples au niveau de loci spécifiques sur le chromosome Y. Selon un premier aspect de l'invention, la présente invention concerne un procédé pour détecter la présence de multiples répétitions en tandem courtes du chromosome Y à mutation rapide (RM Y-STR) dans un échantillon, comprenant les étapes consistant à fournir l'échantillon contenant l'ADN, à fournir 27 paires d'amorces développées pour se lier aux RM Y-STR au niveau de 25 loci dans l'échantillon, à effectuer une réaction en chaîne par polymérase (PCR) pour co-amplifier les RM Y-STR dans l'échantillon, et à comparer les produits PCR avec des valeurs de référence représentatives de différents RM Y-STR pour déterminer les RM Y-STR présents dans l'échantillon.
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In accordance with a first aspect of the invention there is provided a method for detecting the presence of multiple rapidly mutating Y-chromosome short tandem repeats (RM Y-STRs) in a sample including providing the sample containing DNA, providing 27 primer pairs developed to bind to the RM Y-STRs at 25 loci in the sample, performing a polymerase chain reaction (PCR) to co-amplify the RM Y-STRs in the sample, and comparing the PCR products with reference values representative of different RM Y-STRs to determine the RM Y-STRs present in the sample. L'invention concerne un procédé et un kit pour l'analyse multiplex de répétitions en tandem courtes du chromosome Y à mutation rapide (RM-YSTR) et plus particulièrement, mais pas exclusivement, l'analyse de RM-YSTR multiples au niveau de loci spécifiques sur le chromosome Y. Selon un premier aspect de l'invention, la présente invention concerne un procédé pour détecter la présence de multiples répétitions en tandem courtes du chromosome Y à mutation rapide (RM Y-STR) dans un échantillon, comprenant les étapes consistant à fournir l'échantillon contenant l'ADN, à fournir 27 paires d'amorces développées pour se lier aux RM Y-STR au niveau de 25 loci dans l'échantillon, à effectuer une réaction en chaîne par polymérase (PCR) pour co-amplifier les RM Y-STR dans l'échantillon, et à comparer les produits PCR avec des valeurs de référence représentatives de différents RM Y-STR pour déterminer les RM Y-STR présents dans l'échantillon.</description><language>eng ; fre</language><subject>BEER ; BIOCHEMISTRY ; CHEMISTRY ; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR ; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES ; ENZYMOLOGY ; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS ; METALLURGY ; MICROBIOLOGY ; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING ; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS ; SPIRITS ; VINEGAR ; WINE</subject><creationdate>2023</creationdate><oa>free_for_read</oa><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Tsyndetics_thumb_exl</thumbnail><linktohtml>$$Uhttps://worldwide.espacenet.com/publicationDetails/biblio?FT=D&amp;date=20230420&amp;DB=EPODOC&amp;CC=WO&amp;NR=2023062409A1$$EHTML$$P50$$Gepo$$Hfree_for_read</linktohtml><link.rule.ids>230,308,780,885,25564,76547</link.rule.ids><linktorsrc>$$Uhttps://worldwide.espacenet.com/publicationDetails/biblio?FT=D&amp;date=20230420&amp;DB=EPODOC&amp;CC=WO&amp;NR=2023062409A1$$EView_record_in_European_Patent_Office$$FView_record_in_$$GEuropean_Patent_Office$$Hfree_for_read</linktorsrc></links><search><creatorcontrib>MOHAMMAD ALBASTAKI, Abdulla</creatorcontrib><creatorcontrib>AHMAD LOOTAH, Reem</creatorcontrib><creatorcontrib>OBAID ALMARRI, Iman</creatorcontrib><creatorcontrib>ZHANG, Yueke</creatorcontrib><creatorcontrib>HAMDAN ALGHAFRI, Rashid</creatorcontrib><creatorcontrib>SAMI ALREYAMI, Afra</creatorcontrib><creatorcontrib>NAJI, Mohammad</creatorcontrib><creatorcontrib>YU, Zailiang</creatorcontrib><creatorcontrib>MATAR ALMEZAINA, Reem</creatorcontrib><creatorcontrib>LIU, Lin</creatorcontrib><creatorcontrib>XU, Shuxin</creatorcontrib><title>METHOD AND KIT FOR MULTIPLEX ANALYSIS OF RAPIDLY MUTATING Y-CHROMOSOME SHORT TANDEM REPEATS</title><description>The invention relates to a method and kit for multiplex analysis of rapidly mutating Y-chromosome short tandem repeats (RM-YSTRs) and more specifically, but not exclusively, to the analysis of multiple RM-YSTRs at specific loci on the Y-chromosome. 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Selon un premier aspect de l'invention, la présente invention concerne un procédé pour détecter la présence de multiples répétitions en tandem courtes du chromosome Y à mutation rapide (RM Y-STR) dans un échantillon, comprenant les étapes consistant à fournir l'échantillon contenant l'ADN, à fournir 27 paires d'amorces développées pour se lier aux RM Y-STR au niveau de 25 loci dans l'échantillon, à effectuer une réaction en chaîne par polymérase (PCR) pour co-amplifier les RM Y-STR dans l'échantillon, et à comparer les produits PCR avec des valeurs de référence représentatives de différents RM Y-STR pour déterminer les RM Y-STR présents dans l'échantillon.</description><subject>BEER</subject><subject>BIOCHEMISTRY</subject><subject>CHEMISTRY</subject><subject>COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR</subject><subject>CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES</subject><subject>ENZYMOLOGY</subject><subject>MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS</subject><subject>METALLURGY</subject><subject>MICROBIOLOGY</subject><subject>MUTATION OR GENETIC ENGINEERING</subject><subject>PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS</subject><subject>SPIRITS</subject><subject>VINEGAR</subject><subject>WINE</subject><fulltext>true</fulltext><rsrctype>patent</rsrctype><creationdate>2023</creationdate><recordtype>patent</recordtype><sourceid>EVB</sourceid><recordid>eNqNjLEKwjAURbs4iPoPD5wLsRWhY2hfTDDpK8kTLQ6lSJxEC_X_MYMf4HThnMNdZjeHrKkB2TZwMgyKPLizZdNZvCYqbR9MAFLgZWca2yfLkk17hD6vtSdHgRxC0OQZON2gA48dSg7rbPEYn3Pc_HaVbRVyrfM4vYc4T-M9vuJnuFAhilIcir2o5K78r_oCXpYzJw</recordid><startdate>20230420</startdate><enddate>20230420</enddate><creator>MOHAMMAD ALBASTAKI, Abdulla</creator><creator>AHMAD LOOTAH, Reem</creator><creator>OBAID ALMARRI, Iman</creator><creator>ZHANG, Yueke</creator><creator>HAMDAN ALGHAFRI, Rashid</creator><creator>SAMI ALREYAMI, Afra</creator><creator>NAJI, Mohammad</creator><creator>YU, Zailiang</creator><creator>MATAR ALMEZAINA, Reem</creator><creator>LIU, Lin</creator><creator>XU, Shuxin</creator><scope>EVB</scope></search><sort><creationdate>20230420</creationdate><title>METHOD AND KIT FOR MULTIPLEX ANALYSIS OF RAPIDLY MUTATING Y-CHROMOSOME SHORT TANDEM REPEATS</title><author>MOHAMMAD ALBASTAKI, Abdulla ; AHMAD LOOTAH, Reem ; OBAID ALMARRI, Iman ; ZHANG, Yueke ; HAMDAN ALGHAFRI, Rashid ; SAMI ALREYAMI, Afra ; NAJI, Mohammad ; YU, Zailiang ; MATAR ALMEZAINA, Reem ; LIU, Lin ; XU, Shuxin</author></sort><facets><frbrtype>5</frbrtype><frbrgroupid>cdi_FETCH-epo_espacenet_WO2023062409A13</frbrgroupid><rsrctype>patents</rsrctype><prefilter>patents</prefilter><language>eng ; fre</language><creationdate>2023</creationdate><topic>BEER</topic><topic>BIOCHEMISTRY</topic><topic>CHEMISTRY</topic><topic>COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR</topic><topic>CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES</topic><topic>ENZYMOLOGY</topic><topic>MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS</topic><topic>METALLURGY</topic><topic>MICROBIOLOGY</topic><topic>MUTATION OR GENETIC ENGINEERING</topic><topic>PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS</topic><topic>SPIRITS</topic><topic>VINEGAR</topic><topic>WINE</topic><toplevel>online_resources</toplevel><creatorcontrib>MOHAMMAD ALBASTAKI, Abdulla</creatorcontrib><creatorcontrib>AHMAD LOOTAH, Reem</creatorcontrib><creatorcontrib>OBAID ALMARRI, Iman</creatorcontrib><creatorcontrib>ZHANG, Yueke</creatorcontrib><creatorcontrib>HAMDAN ALGHAFRI, Rashid</creatorcontrib><creatorcontrib>SAMI ALREYAMI, Afra</creatorcontrib><creatorcontrib>NAJI, Mohammad</creatorcontrib><creatorcontrib>YU, Zailiang</creatorcontrib><creatorcontrib>MATAR ALMEZAINA, Reem</creatorcontrib><creatorcontrib>LIU, Lin</creatorcontrib><creatorcontrib>XU, Shuxin</creatorcontrib><collection>esp@cenet</collection></facets><delivery><delcategory>Remote Search Resource</delcategory><fulltext>fulltext_linktorsrc</fulltext></delivery><addata><au>MOHAMMAD ALBASTAKI, Abdulla</au><au>AHMAD LOOTAH, Reem</au><au>OBAID ALMARRI, Iman</au><au>ZHANG, Yueke</au><au>HAMDAN ALGHAFRI, Rashid</au><au>SAMI ALREYAMI, Afra</au><au>NAJI, Mohammad</au><au>YU, Zailiang</au><au>MATAR ALMEZAINA, Reem</au><au>LIU, Lin</au><au>XU, Shuxin</au><format>patent</format><genre>patent</genre><ristype>GEN</ristype><title>METHOD AND KIT FOR MULTIPLEX ANALYSIS OF RAPIDLY MUTATING Y-CHROMOSOME SHORT TANDEM REPEATS</title><date>2023-04-20</date><risdate>2023</risdate><abstract>The invention relates to a method and kit for multiplex analysis of rapidly mutating Y-chromosome short tandem repeats (RM-YSTRs) and more specifically, but not exclusively, to the analysis of multiple RM-YSTRs at specific loci on the Y-chromosome. In accordance with a first aspect of the invention there is provided a method for detecting the presence of multiple rapidly mutating Y-chromosome short tandem repeats (RM Y-STRs) in a sample including providing the sample containing DNA, providing 27 primer pairs developed to bind to the RM Y-STRs at 25 loci in the sample, performing a polymerase chain reaction (PCR) to co-amplify the RM Y-STRs in the sample, and comparing the PCR products with reference values representative of different RM Y-STRs to determine the RM Y-STRs present in the sample. L'invention concerne un procédé et un kit pour l'analyse multiplex de répétitions en tandem courtes du chromosome Y à mutation rapide (RM-YSTR) et plus particulièrement, mais pas exclusivement, l'analyse de RM-YSTR multiples au niveau de loci spécifiques sur le chromosome Y. 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