DIGITAL AMPLIFICATION ASSAY ANALYSIS METHOD

Provided herein are methods and systems for detecting the presence or absence of multiple target nucleic acids in partitions of a digital amplification assay. In one embodiment of the method, different probes labeled with the same signal-generating label are distinguishable from each other as a resu...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser: WHITMAN, Doug, BERNIER, Jenni
Format: Patent
Sprache:eng ; fre
Schlagworte:
Online-Zugang:Volltext bestellen
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
Beschreibung
Zusammenfassung:Provided herein are methods and systems for detecting the presence or absence of multiple target nucleic acids in partitions of a digital amplification assay. In one embodiment of the method, different probes labeled with the same signal-generating label are distinguishable from each other as a result of having different melting temperatures in the presence of their cognate target nucleic acids. Following amplification of the target nucleic acids in a digital assay, signals are measured at three or more different temperatures and at least two relational values between signals measured at the three or more different temperatures are calculated and plotted against each other to classify partition subsets according to their target nucleic acid occupancy. L'invention concerne des procédés et des systèmes pour détecter la présence ou l'absence d'acides nucléiques cibles multiples dans des partitions d'un dosage d'amplification numérique. Dans un mode de réalisation du procédé, différentes sondes marquées avec le même marqueur générateur de signal peuvent être distinguées les unes des autres du fait qu'elles présentent des températures de fusion différentes en présence de leurs acides nucléiques cibles apparentés. Suite à l'amplification des acides nucléiques cibles dans un dosage numérique, des signaux sont mesurés à trois températures différentes ou plus et au moins deux valeurs relationnelles entre des signaux mesurés aux trois températures différentes ou plus sont calculées et tracées les unes par rapport aux autres pour classer des sous-ensembles de partition en fonction de leur occupation d'acide nucléique cible.