METHOD FOR PERFORMING MULTIPLE ANALYSES ON SAME NUCLEIC ACID SAMPLE

Provided herein is a method for sample analysis. In some embodiments, the method may involve: (a) incubating a nucleic acid sample with a terminal transferase and a cyclooctene-functionalized nucleotide to produced cyclooctene-functionalized nucleic acid molecules; (b) tethering the cyclooctene-func...

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Hauptverfasser: JI, Hanlee P, LAU, Billy Tsz Cheong
Format: Patent
Sprache:eng ; fre
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creator JI, Hanlee P
LAU, Billy Tsz Cheong
description Provided herein is a method for sample analysis. In some embodiments, the method may involve: (a) incubating a nucleic acid sample with a terminal transferase and a cyclooctene-functionalized nucleotide to produced cyclooctene-functionalized nucleic acid molecules; (b) tethering the cyclooctene-functionalized nucleic acid molecules to a tetrazine-functionalized support via an Alder cycloaddition reaction; (c) performing at least two separate primer extension reactions using the tethered nucleic acid molecules as a template to produce multiple distinct sets of primer extension products; (d) separately analyzing the sets of primer extension products using different methods to produce multiple data sets; and (e) integrating the data sets. L'invention concerne un procédé d'analyse d'échantillons. Dans certains modes de réalisation, le procédé peut comprendre les étapes suivantes : (a) incubation d'un échantillon d'acide nucléique avec une transférase terminale et un nucléotide fonctionnalisé par cyclo-octène pour produire des molécules d'acide nucléique fonctionnalisées par cyclo-octène; (b) fixation les molécules d'acide nucléique à fonction cyclo-octène à un support fonctionnalisé par tétrazine par l'intermédiaire d'une réaction de cycloaddition de type Diels-Alder; (c) réalisation d'au moins deux réactions d'extension d'amorce séparées à l'aide des molécules d'acide nucléique fixées en tant que matrice pour produire de multiples ensembles distincts de produits d'extension d'amorce; (d) analyse séparée des ensembles de produits d'extension d'amorce à l'aide de différents procédés pour produire de multiples ensembles de données; et (e) intégration des ensembles de données.
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In some embodiments, the method may involve: (a) incubating a nucleic acid sample with a terminal transferase and a cyclooctene-functionalized nucleotide to produced cyclooctene-functionalized nucleic acid molecules; (b) tethering the cyclooctene-functionalized nucleic acid molecules to a tetrazine-functionalized support via an Alder cycloaddition reaction; (c) performing at least two separate primer extension reactions using the tethered nucleic acid molecules as a template to produce multiple distinct sets of primer extension products; (d) separately analyzing the sets of primer extension products using different methods to produce multiple data sets; and (e) integrating the data sets. L'invention concerne un procédé d'analyse d'échantillons. Dans certains modes de réalisation, le procédé peut comprendre les étapes suivantes : (a) incubation d'un échantillon d'acide nucléique avec une transférase terminale et un nucléotide fonctionnalisé par cyclo-octène pour produire des molécules d'acide nucléique fonctionnalisées par cyclo-octène; (b) fixation les molécules d'acide nucléique à fonction cyclo-octène à un support fonctionnalisé par tétrazine par l'intermédiaire d'une réaction de cycloaddition de type Diels-Alder; (c) réalisation d'au moins deux réactions d'extension d'amorce séparées à l'aide des molécules d'acide nucléique fixées en tant que matrice pour produire de multiples ensembles distincts de produits d'extension d'amorce; (d) analyse séparée des ensembles de produits d'extension d'amorce à l'aide de différents procédés pour produire de multiples ensembles de données; et (e) intégration des ensembles de données.</description><language>eng ; fre</language><subject>BEER ; BIOCHEMISTRY ; CHEMISTRY ; COMBINATORIAL CHEMISTRY ; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR ; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES ; ENZYMOLOGY ; LIBRARIES, e.g. CHEMICAL LIBRARIES, IN SILICOLIBRARIES ; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS ; METALLURGY ; MICROBIOLOGY ; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING ; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS ; SPIRITS ; VINEGAR ; WINE</subject><creationdate>2021</creationdate><oa>free_for_read</oa><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Tsyndetics_thumb_exl</thumbnail><linktohtml>$$Uhttps://worldwide.espacenet.com/publicationDetails/biblio?FT=D&amp;date=20210715&amp;DB=EPODOC&amp;CC=WO&amp;NR=2021141852A1$$EHTML$$P50$$Gepo$$Hfree_for_read</linktohtml><link.rule.ids>230,309,781,886,25568,76551</link.rule.ids><linktorsrc>$$Uhttps://worldwide.espacenet.com/publicationDetails/biblio?FT=D&amp;date=20210715&amp;DB=EPODOC&amp;CC=WO&amp;NR=2021141852A1$$EView_record_in_European_Patent_Office$$FView_record_in_$$GEuropean_Patent_Office$$Hfree_for_read</linktorsrc></links><search><creatorcontrib>JI, Hanlee P</creatorcontrib><creatorcontrib>LAU, Billy Tsz Cheong</creatorcontrib><title>METHOD FOR PERFORMING MULTIPLE ANALYSES ON SAME NUCLEIC ACID SAMPLE</title><description>Provided herein is a method for sample analysis. 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Dans certains modes de réalisation, le procédé peut comprendre les étapes suivantes : (a) incubation d'un échantillon d'acide nucléique avec une transférase terminale et un nucléotide fonctionnalisé par cyclo-octène pour produire des molécules d'acide nucléique fonctionnalisées par cyclo-octène; (b) fixation les molécules d'acide nucléique à fonction cyclo-octène à un support fonctionnalisé par tétrazine par l'intermédiaire d'une réaction de cycloaddition de type Diels-Alder; (c) réalisation d'au moins deux réactions d'extension d'amorce séparées à l'aide des molécules d'acide nucléique fixées en tant que matrice pour produire de multiples ensembles distincts de produits d'extension d'amorce; (d) analyse séparée des ensembles de produits d'extension d'amorce à l'aide de différents procédés pour produire de multiples ensembles de données; et (e) intégration des ensembles de données.</description><subject>BEER</subject><subject>BIOCHEMISTRY</subject><subject>CHEMISTRY</subject><subject>COMBINATORIAL CHEMISTRY</subject><subject>COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR</subject><subject>CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES</subject><subject>ENZYMOLOGY</subject><subject>LIBRARIES, e.g. CHEMICAL LIBRARIES, IN SILICOLIBRARIES</subject><subject>MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS</subject><subject>METALLURGY</subject><subject>MICROBIOLOGY</subject><subject>MUTATION OR GENETIC ENGINEERING</subject><subject>PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS</subject><subject>SPIRITS</subject><subject>VINEGAR</subject><subject>WINE</subject><fulltext>true</fulltext><rsrctype>patent</rsrctype><creationdate>2021</creationdate><recordtype>patent</recordtype><sourceid>EVB</sourceid><recordid>eNrjZHD2dQ3x8HdRcPMPUghwDQJSvp5-7gq-oT4hngE-rgqOfo4-kcGuwQr-fgrBjr6uCn6hzj6uns4Kjs6eLiARoCIeBta0xJziVF4ozc2g7OYa4uyhm1qQH59aXJCYnJqXWhIf7m9kYGRoaGJoYWrkaGhMnCoAzSUsNA</recordid><startdate>20210715</startdate><enddate>20210715</enddate><creator>JI, Hanlee P</creator><creator>LAU, Billy Tsz Cheong</creator><scope>EVB</scope></search><sort><creationdate>20210715</creationdate><title>METHOD FOR PERFORMING MULTIPLE ANALYSES ON SAME NUCLEIC ACID SAMPLE</title><author>JI, Hanlee P ; LAU, Billy Tsz Cheong</author></sort><facets><frbrtype>5</frbrtype><frbrgroupid>cdi_FETCH-epo_espacenet_WO2021141852A13</frbrgroupid><rsrctype>patents</rsrctype><prefilter>patents</prefilter><language>eng ; fre</language><creationdate>2021</creationdate><topic>BEER</topic><topic>BIOCHEMISTRY</topic><topic>CHEMISTRY</topic><topic>COMBINATORIAL CHEMISTRY</topic><topic>COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR</topic><topic>CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES</topic><topic>ENZYMOLOGY</topic><topic>LIBRARIES, e.g. CHEMICAL LIBRARIES, IN SILICOLIBRARIES</topic><topic>MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS</topic><topic>METALLURGY</topic><topic>MICROBIOLOGY</topic><topic>MUTATION OR GENETIC ENGINEERING</topic><topic>PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS</topic><topic>SPIRITS</topic><topic>VINEGAR</topic><topic>WINE</topic><toplevel>online_resources</toplevel><creatorcontrib>JI, Hanlee P</creatorcontrib><creatorcontrib>LAU, Billy Tsz Cheong</creatorcontrib><collection>esp@cenet</collection></facets><delivery><delcategory>Remote Search Resource</delcategory><fulltext>fulltext_linktorsrc</fulltext></delivery><addata><au>JI, Hanlee P</au><au>LAU, Billy Tsz Cheong</au><format>patent</format><genre>patent</genre><ristype>GEN</ristype><title>METHOD FOR PERFORMING MULTIPLE ANALYSES ON SAME NUCLEIC ACID SAMPLE</title><date>2021-07-15</date><risdate>2021</risdate><abstract>Provided herein is a method for sample analysis. 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