METHODS FOR ASSESSING INTEGRATED NUCLEIC ACIDS

Provided are methods for assessing nucleic acid sequences integrated into a genome of a genetically engineered cell, such as a genetically engineered cell used in cell therapy. Cells are generally genetically engineered to express a recombinant protein, such as a recombinant receptor, via introduction of a polynucleotide and integration of certain sequences in the polynucleotide, such as recombinant sequences, into the genome of the cell. In some aspects, the provided methods can be used to distinguish integrated nucleic acids and non-integrated, residual nucleic acids. L'invention concerne des procédés pour évaluer des séquences d'acides nucléiques intégrées dans un génome d'une cellule génétiquement modifiée, telle qu'une cellule génétiquement modifiée utilisée en thérapie cellulaire. Les cellules sont généralement génétiquement modifiées pour exprimer une protéine recombinante, telle qu'un récepteur recombinant, par introduction d'un polynucléotide et intégration de certaines séquences du polynucléotide, telles que des séquences recombinantes, dans le génome de la cellule. Selon certains aspects, les procédés de l'invention peuvent être utilisés pour distinguer des acides nucléiques intégrés et des acides nucléiques résiduels non intégrés.