GENE SIGNATURES AND METHOD FOR PREDICTING RESPONSE TO PD-1 ANTAGONISTS AND CTLA-4 ANTAGONISTS, AND COMBINATION THEREOF

The present invention relates to the field of cancer, more particularly to the field of immunotherapy and gene signatures. Provided are two specific and distinct gene signatures, namely a Response Immune Signal (RIS) gene signature and a Stromal Immune Signal (SIS) gene signature, which can be used...

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Hauptverfasser: KRIJGSMAN, Oscar, PEEPER, Daniel Simon
Format: Patent
Sprache:eng ; fre
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creator KRIJGSMAN, Oscar
PEEPER, Daniel Simon
description The present invention relates to the field of cancer, more particularly to the field of immunotherapy and gene signatures. Provided are two specific and distinct gene signatures, namely a Response Immune Signal (RIS) gene signature and a Stromal Immune Signal (SIS) gene signature, which can be used as biomarkers to accurately predict the response of a cancer subject to treatment with a PD-1 antagonist (e.g., PD-1 antibody) and/or a CTLA-4 antagonist (e.g., CTLA-4 antibody). In particular, it was found that the RIS and SIS gene signatures of the invention may be used in combination to predict the response of a cancer subject to treatment with a combination therapy consisting of a PD-1 antagonist (e.g., PD-1 antibody) and a CTLA-4 antagonist (e.g., CTLA-4 antibody). The gene signatures of the invention may be advantageously used in methods for treating cancer, such as melanoma, and to help devise treatment strategies best suited to individual patients (e.g., to achieve personalized therapy, and spare patients from undesired side effects, e.g., toxicity). L'invention relève du domaine du cancer, et plus particulièrement du domaine de l'immunothérapie et des signatures géniques. L'invention concerne deux signatures géniques spécifiques et distinctes, à savoir une signature génique Signal Immunitaire de Réponse (RIS) et une signature génique Signal Immunitaire stromal (SIS), qui peuvent être utilisées en tant que biomarqueurs pour prédire avec précision la réponse d'un sujet cancéreux à un traitement avec un antagoniste de PD-1 (par exemple, un anticorps anti-PD-1) et/ou un antagoniste de CTLA -4 (par exemple, un anticorps anti-CTLA -4). En particulier, il a été découvert que les signatures géniques RIS et SIS de l'invention peuvent être utilisées en combinaison pour prédire la réponse d'un sujet cancéreux à un traitement avec une polythérapie consistant en un antagoniste de PD-1 (par exemple, un anticorps anti-PD-1) et un antagoniste de CTLA -4 (par exemple, un anticorps anti-CTLA -4). Les signatures géniques de l'invention peuvent être avantageusement utilisées dans des procédés de traitement du cancer, tel que le mélanome, et pour aider à concevoir les stratégies de traitement les mieux appropriées pour des patients individuels (par exemple, pour réaliser une thérapie personnalisée, et épargner aux patients les effets secondaires indésirables, par exemple, la toxicité).
format Patent
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Provided are two specific and distinct gene signatures, namely a Response Immune Signal (RIS) gene signature and a Stromal Immune Signal (SIS) gene signature, which can be used as biomarkers to accurately predict the response of a cancer subject to treatment with a PD-1 antagonist (e.g., PD-1 antibody) and/or a CTLA-4 antagonist (e.g., CTLA-4 antibody). In particular, it was found that the RIS and SIS gene signatures of the invention may be used in combination to predict the response of a cancer subject to treatment with a combination therapy consisting of a PD-1 antagonist (e.g., PD-1 antibody) and a CTLA-4 antagonist (e.g., CTLA-4 antibody). The gene signatures of the invention may be advantageously used in methods for treating cancer, such as melanoma, and to help devise treatment strategies best suited to individual patients (e.g., to achieve personalized therapy, and spare patients from undesired side effects, e.g., toxicity). L'invention relève du domaine du cancer, et plus particulièrement du domaine de l'immunothérapie et des signatures géniques. L'invention concerne deux signatures géniques spécifiques et distinctes, à savoir une signature génique Signal Immunitaire de Réponse (RIS) et une signature génique Signal Immunitaire stromal (SIS), qui peuvent être utilisées en tant que biomarqueurs pour prédire avec précision la réponse d'un sujet cancéreux à un traitement avec un antagoniste de PD-1 (par exemple, un anticorps anti-PD-1) et/ou un antagoniste de CTLA -4 (par exemple, un anticorps anti-CTLA -4). En particulier, il a été découvert que les signatures géniques RIS et SIS de l'invention peuvent être utilisées en combinaison pour prédire la réponse d'un sujet cancéreux à un traitement avec une polythérapie consistant en un antagoniste de PD-1 (par exemple, un anticorps anti-PD-1) et un antagoniste de CTLA -4 (par exemple, un anticorps anti-CTLA -4). Les signatures géniques de l'invention peuvent être avantageusement utilisées dans des procédés de traitement du cancer, tel que le mélanome, et pour aider à concevoir les stratégies de traitement les mieux appropriées pour des patients individuels (par exemple, pour réaliser une thérapie personnalisée, et épargner aux patients les effets secondaires indésirables, par exemple, la toxicité).</description><language>eng ; fre</language><subject>BEER ; BIOCHEMISTRY ; CHEMISTRY ; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR ; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES ; ENZYMOLOGY ; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS ; METALLURGY ; MICROBIOLOGY ; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING ; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS ; SPIRITS ; VINEGAR ; WINE</subject><creationdate>2020</creationdate><oa>free_for_read</oa><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Tsyndetics_thumb_exl</thumbnail><linktohtml>$$Uhttps://worldwide.espacenet.com/publicationDetails/biblio?FT=D&amp;date=20200402&amp;DB=EPODOC&amp;CC=WO&amp;NR=2020005068A3$$EHTML$$P50$$Gepo$$Hfree_for_read</linktohtml><link.rule.ids>230,308,780,885,25564,76547</link.rule.ids><linktorsrc>$$Uhttps://worldwide.espacenet.com/publicationDetails/biblio?FT=D&amp;date=20200402&amp;DB=EPODOC&amp;CC=WO&amp;NR=2020005068A3$$EView_record_in_European_Patent_Office$$FView_record_in_$$GEuropean_Patent_Office$$Hfree_for_read</linktorsrc></links><search><creatorcontrib>KRIJGSMAN, Oscar</creatorcontrib><creatorcontrib>PEEPER, Daniel Simon</creatorcontrib><title>GENE SIGNATURES AND METHOD FOR PREDICTING RESPONSE TO PD-1 ANTAGONISTS AND CTLA-4 ANTAGONISTS, AND COMBINATION THEREOF</title><description>The present invention relates to the field of cancer, more particularly to the field of immunotherapy and gene signatures. Provided are two specific and distinct gene signatures, namely a Response Immune Signal (RIS) gene signature and a Stromal Immune Signal (SIS) gene signature, which can be used as biomarkers to accurately predict the response of a cancer subject to treatment with a PD-1 antagonist (e.g., PD-1 antibody) and/or a CTLA-4 antagonist (e.g., CTLA-4 antibody). In particular, it was found that the RIS and SIS gene signatures of the invention may be used in combination to predict the response of a cancer subject to treatment with a combination therapy consisting of a PD-1 antagonist (e.g., PD-1 antibody) and a CTLA-4 antagonist (e.g., CTLA-4 antibody). The gene signatures of the invention may be advantageously used in methods for treating cancer, such as melanoma, and to help devise treatment strategies best suited to individual patients (e.g., to achieve personalized therapy, and spare patients from undesired side effects, e.g., toxicity). L'invention relève du domaine du cancer, et plus particulièrement du domaine de l'immunothérapie et des signatures géniques. L'invention concerne deux signatures géniques spécifiques et distinctes, à savoir une signature génique Signal Immunitaire de Réponse (RIS) et une signature génique Signal Immunitaire stromal (SIS), qui peuvent être utilisées en tant que biomarqueurs pour prédire avec précision la réponse d'un sujet cancéreux à un traitement avec un antagoniste de PD-1 (par exemple, un anticorps anti-PD-1) et/ou un antagoniste de CTLA -4 (par exemple, un anticorps anti-CTLA -4). En particulier, il a été découvert que les signatures géniques RIS et SIS de l'invention peuvent être utilisées en combinaison pour prédire la réponse d'un sujet cancéreux à un traitement avec une polythérapie consistant en un antagoniste de PD-1 (par exemple, un anticorps anti-PD-1) et un antagoniste de CTLA -4 (par exemple, un anticorps anti-CTLA -4). Les signatures géniques de l'invention peuvent être avantageusement utilisées dans des procédés de traitement du cancer, tel que le mélanome, et pour aider à concevoir les stratégies de traitement les mieux appropriées pour des patients individuels (par exemple, pour réaliser une thérapie personnalisée, et épargner aux patients les effets secondaires indésirables, par exemple, la toxicité).</description><subject>BEER</subject><subject>BIOCHEMISTRY</subject><subject>CHEMISTRY</subject><subject>COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR</subject><subject>CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES</subject><subject>ENZYMOLOGY</subject><subject>MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS</subject><subject>METALLURGY</subject><subject>MICROBIOLOGY</subject><subject>MUTATION OR GENETIC ENGINEERING</subject><subject>PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS</subject><subject>SPIRITS</subject><subject>VINEGAR</subject><subject>WINE</subject><fulltext>true</fulltext><rsrctype>patent</rsrctype><creationdate>2020</creationdate><recordtype>patent</recordtype><sourceid>EVB</sourceid><recordid>eNqNjLEKwkAQRNNYiPoPC7YGzkTF9sxtLge6G-5WLEOQsxINRPx-A7GwtBp482amydsiIQRnScvZYwBNBk4oFRso2UPt0bhCHFkY2popIAhDbdL1oIq2TC7IOCvkqNPNL16NnE8HN_w7JpAKPXI5Tya39t7HxTdnybJEKao0ds8m9l17jY_4ai6cqUwptVW7vc7z_6wPxAw52A</recordid><startdate>20200402</startdate><enddate>20200402</enddate><creator>KRIJGSMAN, Oscar</creator><creator>PEEPER, Daniel Simon</creator><scope>EVB</scope></search><sort><creationdate>20200402</creationdate><title>GENE SIGNATURES AND METHOD FOR PREDICTING RESPONSE TO PD-1 ANTAGONISTS AND CTLA-4 ANTAGONISTS, AND COMBINATION THEREOF</title><author>KRIJGSMAN, Oscar ; PEEPER, Daniel Simon</author></sort><facets><frbrtype>5</frbrtype><frbrgroupid>cdi_FETCH-epo_espacenet_WO2020005068A33</frbrgroupid><rsrctype>patents</rsrctype><prefilter>patents</prefilter><language>eng ; fre</language><creationdate>2020</creationdate><topic>BEER</topic><topic>BIOCHEMISTRY</topic><topic>CHEMISTRY</topic><topic>COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR</topic><topic>CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES</topic><topic>ENZYMOLOGY</topic><topic>MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS</topic><topic>METALLURGY</topic><topic>MICROBIOLOGY</topic><topic>MUTATION OR GENETIC ENGINEERING</topic><topic>PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS</topic><topic>SPIRITS</topic><topic>VINEGAR</topic><topic>WINE</topic><toplevel>online_resources</toplevel><creatorcontrib>KRIJGSMAN, Oscar</creatorcontrib><creatorcontrib>PEEPER, Daniel Simon</creatorcontrib><collection>esp@cenet</collection></facets><delivery><delcategory>Remote Search Resource</delcategory><fulltext>fulltext_linktorsrc</fulltext></delivery><addata><au>KRIJGSMAN, Oscar</au><au>PEEPER, Daniel Simon</au><format>patent</format><genre>patent</genre><ristype>GEN</ristype><title>GENE SIGNATURES AND METHOD FOR PREDICTING RESPONSE TO PD-1 ANTAGONISTS AND CTLA-4 ANTAGONISTS, AND COMBINATION THEREOF</title><date>2020-04-02</date><risdate>2020</risdate><abstract>The present invention relates to the field of cancer, more particularly to the field of immunotherapy and gene signatures. Provided are two specific and distinct gene signatures, namely a Response Immune Signal (RIS) gene signature and a Stromal Immune Signal (SIS) gene signature, which can be used as biomarkers to accurately predict the response of a cancer subject to treatment with a PD-1 antagonist (e.g., PD-1 antibody) and/or a CTLA-4 antagonist (e.g., CTLA-4 antibody). In particular, it was found that the RIS and SIS gene signatures of the invention may be used in combination to predict the response of a cancer subject to treatment with a combination therapy consisting of a PD-1 antagonist (e.g., PD-1 antibody) and a CTLA-4 antagonist (e.g., CTLA-4 antibody). The gene signatures of the invention may be advantageously used in methods for treating cancer, such as melanoma, and to help devise treatment strategies best suited to individual patients (e.g., to achieve personalized therapy, and spare patients from undesired side effects, e.g., toxicity). L'invention relève du domaine du cancer, et plus particulièrement du domaine de l'immunothérapie et des signatures géniques. L'invention concerne deux signatures géniques spécifiques et distinctes, à savoir une signature génique Signal Immunitaire de Réponse (RIS) et une signature génique Signal Immunitaire stromal (SIS), qui peuvent être utilisées en tant que biomarqueurs pour prédire avec précision la réponse d'un sujet cancéreux à un traitement avec un antagoniste de PD-1 (par exemple, un anticorps anti-PD-1) et/ou un antagoniste de CTLA -4 (par exemple, un anticorps anti-CTLA -4). En particulier, il a été découvert que les signatures géniques RIS et SIS de l'invention peuvent être utilisées en combinaison pour prédire la réponse d'un sujet cancéreux à un traitement avec une polythérapie consistant en un antagoniste de PD-1 (par exemple, un anticorps anti-PD-1) et un antagoniste de CTLA -4 (par exemple, un anticorps anti-CTLA -4). Les signatures géniques de l'invention peuvent être avantageusement utilisées dans des procédés de traitement du cancer, tel que le mélanome, et pour aider à concevoir les stratégies de traitement les mieux appropriées pour des patients individuels (par exemple, pour réaliser une thérapie personnalisée, et épargner aux patients les effets secondaires indésirables, par exemple, la toxicité).</abstract><oa>free_for_read</oa></addata></record>
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